大自然的岔路口:土壤的碳捕获困境

大自然的岔路口:土壤的碳捕获困境 研究人员确定了决定土壤是捕获碳还是以二氧化碳形式释放碳的关键因素,突出了分子相互作用和土壤化学的作用,可能有助于减缓气候变化的努力。Smectite粘土(如图所示)含有已知能在天然土壤中固碳的粘土矿物。资料来源:Francesco Ungaro通过结合实验室实验和分子建模,研究人员研究了有机碳生物分子与一种以捕获土壤中有机物而闻名的粘土矿物之间的相互作用。他们发现,静电荷、碳分子的结构特征、土壤中周围的金属养分以及分子间的竞争都对土壤捕集碳的能力(或无能)起着重要作用。新发现可以帮助研究人员预测哪些土壤化学成分最有利于捕获碳,从而有可能找到基于土壤的减缓人类造成的气候变化的解决方案。这项研究最近发表在《 美国国家科学院院刊》上。该研究的资深作者、西北大学的 Ludmilla Aristilde 说:"土壤中储存的有机碳约为大气中碳含量的十倍。如果这个巨大的储存库受到干扰,将会产生巨大的连锁反应。目前有很多人在努力将碳封存起来,以防止它进入大气层。如果我们想这样做,那么我们首先必须了解其中的机制。"作为环境过程中有机物动力学方面的专家,Aristilde 是西北大学麦考密克工程学院土木与环境工程副教授。王家兴是 Aristilde 实验室的博士生,也是论文的第一作者。西北大学本科生 Rebecca Wilson 是论文的第二作者。普通粘土土壤固碳量达 25000 亿吨,是地球上最大的碳汇之一,仅次于海洋。尽管土壤就在我们身边,但研究人员才刚刚开始了解它是如何从碳循环中锁碳固碳的。为了研究这一过程,阿里斯蒂尔德和她的团队研究了埃米土,这是一种已知能在天然土壤中固碳的粘土矿物。然后,他们研究了粘土矿物的表面如何与十种不同的生物大分子结合,其中包括氨基酸、与纤维素有关的糖和与木质素有关的酚酸,它们的化学性质和结构各不相同。"我们决定研究这种粘土矿物,因为它无处不在,"Aristilde 说。"几乎所有土壤都含有粘土矿物。而且,粘土普遍存在于半干旱和温带气候地区我们知道这些地区将受到气候变化的影响。"异性相吸阿里斯蒂尔德和她的团队首先研究了粘土矿物与单个生物分子之间的相互作用。由于粘土矿物带负电荷,带正电荷的生物分子(赖氨酸、组氨酸和苏氨酸)的结合力最强。但有趣的是,这种结合并非完全由静电荷决定。研究人员利用三维计算模型发现,生物分子的结构也发挥了作用。他说:"在有些情况下,两个分子都带正电,但其中一个分子与粘土的相互作用比另一个更好。这是因为结合的结构特征也很重要。分子必须足够灵活,能够采用一种结构排列方式,使其带正电荷的成分与粘土对齐。例如,赖氨酸有一个带正电荷的长臂,可以用来固定自己。"朋友的帮助按照这种逻辑,人们可能会认为带负电荷的生物分子无法与粘土结合。但阿里斯蒂尔德和她的团队发现,周围的天然金属养分可以介入其中。带正电荷的金属(如镁和钙)在带负电荷的生物分子和粘土矿物之间架起了一座桥梁,形成了一种结合。即使是通常不会与粘土结合的生物分子,当镁存在时,也能够看到其结合率显著提高。因此,土壤中的天然金属成分可以促进碳捕集。虽然这是一个广泛报道的现象,但研究人员揭示了其结构和机制。混合与交融在研究单个生物分子与粘土矿物之间的相互作用时,研究人员发现结合是可预测和直接的。为了获得更接近真实世界环境的信息,阿里斯蒂尔德和她的团队将不同的生物分子混合在一起。"我们知道,环境中不同类型的生物分子是共存的,"阿里斯蒂尔德说。"因此,我们还进行了生物分子混合物的实验。虽然研究人员最初认为生物分子会相互竞争与粘土相互作用,但他们却发现了意想不到的行为。一个令人惊讶的转折是,即使是具有柔性结构的带正电荷的生物大分子也会受到抑制,无法与粘土矿物结合。虽然它们在单独存在时很容易与粘土结合,但生物大分子相互结合的冲动似乎取代了它们对粘土的吸引力。这在以前是没有过的。两种生物分子之间的吸引能量实际上高于生物分子对粘土的吸引能量。这导致吸附力下降。这改变了我们对分子如何在表面上竞争的看法。它们不仅仅是在争夺表面的结合位点。它们实际上可以相互吸引。下一步行动接下来,阿里斯蒂尔德和她的团队计划研究在包括热带气候在内的温暖地区发现的土壤中,生物分子是如何与矿物质相互作用的。在另一个相关项目中,他们的目标是探索有机物如何在河流和其他水系中迁移。阿里斯蒂尔德说:"既然我们已经研究了主要存在于温带地区的粘土矿物,我们就想了解其他类型的矿物。它们是如何捕获有机物的?过程是相同还是不同?如果我们想让碳继续留在土壤中,那么我们就需要了解它们是如何组合的,以及这种组合是如何影响微生物的可及性的。"编译来源:ScitechDaily ... PC版: 手机版:

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研究发现病毒会增强海洋的碳捕获能力 基于网络的生态互动分析表明,北极和南极地区 RNA 病毒物种的多样性高于预期。基因组分析的进展通过将基因组测序数据与人工智能分析相结合,研究人员发现了海洋病毒,并对其基因组进行了评估,发现它们从其他微生物或细胞中"窃取"了处理海洋中碳的基因。通过绘制微生物代谢基因(包括水下碳代谢基因)图谱,研究人员发现全球海洋中有 340 种已知的代谢途径。其中,有128种还存在于海洋病毒的基因组中。俄亥俄州立大学微生物学教授兼微生物组科学中心主任马修-沙利文(Matthew Sullivan)说:"这个数字如此之高,让我感到震惊。"通过计算技术的进步,研究小组挖掘出了这一巨大的数据宝库,现在已经揭示了哪些病毒在碳代谢中发挥作用,并将这一信息用于新开发的群落代谢模型,以帮助预测如何利用病毒来设计海洋微生物群,从而实现更好的碳捕获。沙利文说:"建模是为了了解病毒是如何提高或降低系统中的微生物活性的。群落代谢建模告诉我一个梦寐以求的数据点:哪些病毒以最重要的代谢途径为目标,这很重要,因为这意味着它们是很好的杠杆。"昨天(2024 年 2 月 17 日),沙利文在丹佛举行的美国科学促进会年会上介绍了这项研究。碳捕获病毒工程苏利文是塔拉海洋联合会(Tara Oceans Consortium)的病毒研究协调人,该联合会是一项为期三年的全球性研究,研究气候变化对世界海洋的影响,并收集了 35000 份含有丰富微生物的水样。他的实验室主要研究噬菌体(感染细菌的病毒)及其在工程框架中的放大潜力,以操纵海洋微生物将碳转化为最重的有机物,沉入海底。"海洋会吸收碳,这可以缓冲气候变化。二氧化碳作为气体被吸收,并由微生物将其转化为有机碳,"沙利文说。"我们现在看到的是,病毒以这些微生物群落代谢中最重要的反应为目标。这意味着我们可以开始研究哪些病毒可以用来将碳转化为我们想要的那种碳。换句话说,我们能否加强这个巨大的海洋缓冲区,使其成为碳汇,为应对气候变化争取时间,而不是将碳释放回大气层,加速气候变化?"2016 年,塔拉团队确定海洋中的碳下沉与病毒的存在有关。人们认为,当受病毒感染的碳处理细胞聚集成较大的粘性聚合体并掉落到海底时,病毒有助于碳的下沉。研究人员开发了基于人工智能的分析方法,从数以千计的病毒中找出少数"VIP"病毒,在实验室中进行培养,并将其作为海洋地球工程的模型系统。塔拉海洋联合会的达米安-埃维拉德(Damien Eveillard)教授开发的这种新的群落代谢模型,有助于他们了解这种方法可能会产生哪些意想不到的后果。沙利文的实验室正在吸取这些海洋方面的经验教训,并将其应用到人类环境中的病毒微生物组工程中,以帮助脊髓损伤后的康复、改善感染艾滋病毒的母亲所生婴儿的预后、对抗烧伤伤口的感染等。海洋以外的应用土木、环境和大地工程学教授沙利文说:"我们正在进行的对话是,'这其中有多少是可以转换的?'我们的总体目标是对微生物组进行工程设计,使其朝着我们认为有用的方向发展。"他还报告了在一个完全不同的生态系统中使用噬菌体作为地球工程工具的早期努力:瑞典北部的永久冻土带,那里的微生物既能改变气候,又能在冻土融化时对气候变化做出反应。俄亥俄州立大学微生物学副教授弗吉尼亚-里奇(Virginia Rich)是美国国家科学基金会资助的EMERGE生物集成研究所的联合主任,该研究所设在俄亥俄州立大学,负责组织瑞典野外现场的微生物组科学研究。里奇还共同领导了之前的研究,该研究发现解冻的永久冻土层土壤中的单细胞生物是甲烷(一种强效温室气体)的重要生产者。里奇与新罕布什尔大学的露丝-瓦尔纳(Ruth Varner)共同组织了美国科学院会议,后者是EMERGE研究所的共同负责人,该研究所的工作重点是更好地了解微生物群如何应对永久冻土融化以及由此产生的气候相互作用。沙利文的演讲题目是"从生态系统生物学到用病毒管理微生物组",是在题为"以微生物组为目标的生态系统管理"的会议上发表的:小角色,大作用"的会议上发表的。海洋方面的工作得到了美国国家科学基金会、戈登和贝蒂-摩尔基金会以及塔拉海洋公司的支持,除美国国家科学基金会外,土壤方面的工作也得到了能源部和格兰瑟姆基金会的资助。编译来源:ScitechDaily ... PC版: 手机版:

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科学家正利用土壤微生物的DNA帮助提高气候模型的准确性 微生物模型利用广泛的基因组数据为土壤碳模拟提供动力。图片来源:Victor O. Leshyk 插图这个新模型使科学家们能够更好地了解某些土壤微生物如何有效地储存植物根系提供的碳,并为农业战略提供信息,以保护土壤中的碳,支持植物生长和减缓气候变化。"我们的研究证明了直接从土壤中收集微生物遗传信息的优势。在此之前,我们只掌握了实验室研究的少数微生物的信息,"论文第一作者、伯克利实验室博士后研究员吉安娜-马施曼(Gianna Marschmann)说。"有了基因组信息,我们就能建立更好的模型,预测各种植物类型、作物甚至特定栽培品种如何与土壤微生物合作,更好地捕集碳。同时,这种合作还能增强土壤健康"。最近发表在《自然-微生物学》杂志上的一篇新论文介绍了这项研究。论文的通讯作者是伯克利实验室的 Eoin Brodie 和劳伦斯利弗莫尔国家实验室的 Jennifer Pett-Ridge,后者领导着"微生物持久存在"土壤微生物组科学重点领域项目,该项目由能源部科学办公室资助,以支持这项工作。看见看不见的东西 - 微生物对土壤健康和碳的影响土壤微生物帮助植物获取土壤养分,抵抗干旱、疾病和虫害。它们对碳循环的影响在气候模型中的体现尤为重要,因为它们会影响土壤中储存的碳量或在分解过程中以二氧化碳形式释放到大气中的碳量。通过利用这些碳构建自己的身体,微生物可以将碳稳定(或储存)在土壤中,并影响碳在地下的储存量和储存时间。这些功能与农业和气候的相关性正受到前所未有的关注。然而,仅一克土壤中就含有多达100 亿个微生物和数千个不同物种,绝大多数微生物从未在实验室中被研究过。直到最近,科学家们才从实验室研究的极少数微生物中获得数据,为这些模型提供依据,其中许多微生物与需要在气候模型中体现的微生物无关。Brodie解释说:"这就好比根据只生长在热带森林中的植物所提供的信息,为沙漠建立生态系统模型。"为了应对这一挑战,科学家团队直接利用基因组信息建立了一个模型,该模型能够适应任何需要研究的生态系统,从加利福尼亚的草原到北极解冻的永久冻土。该模型利用基因组深入了解土壤微生物的功能,研究小组将这种方法用于研究加利福尼亚牧场中植物与微生物组之间的相互作用。牧场在加州具有重要的经济和生态意义,占陆地面积的 40% 以上。研究重点是生活在植物根部周围的微生物(称为根圈)。这是一个重要的研究环境,因为尽管根区只占地球土壤体积的 1-2%,但据估计,根区储存了地球土壤中 30-40% 的碳,其中大部分碳是由根系在生长过程中释放出来的。为了建立这个模型,科学家们利用加州大学霍普兰研究与推广中心提供的数据,模拟了微生物在根部环境中的生长情况。不过,这种方法并不局限于特定的生态系统。由于某些遗传信息与特定的性状相对应,就像人类一样,基因组(模型所基于的)与微生物性状之间的关系可以转移到世界各地的微生物和生态系统中。研究小组开发了一种新方法来预测微生物的重要性状,这些性状会影响微生物利用植物根系提供的碳和养分的速度。研究人员利用该模型证明,随着植物的生长和碳的释放,由于根系化学和微生物性状之间的相互作用,会出现不同的微生物生长策略。特别是,他们发现,生长速度较慢的微生物在植物生长后期会受到碳释放类型的青睐,而且它们在利用碳方面的效率出奇地高这使它们能够在土壤中储存更多的这种关键元素。这一新的观测结果为改进模型中根系与微生物之间的相互作用提供了依据,并提高了预测微生物如何影响气候模型中全球碳循环变化的能力。"这些新发现对农业和土壤健康具有重要意义。通过我们正在建立的模型,我们越来越有可能利用对碳如何在土壤中循环的新认识。这反过来又为我们提供了可能性,使我们能够提出保护土壤中宝贵的碳的策略,从而在可行的范围内支持生物多样性和植物生长,以衡量其影响,"马施曼说。这项研究强调了利用基于遗传信息的建模方法来预测微生物性状的威力,有助于揭示土壤微生物组及其对环境的影响。编译来源:ScitechDaily ... PC版: 手机版:

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科学家计算出体量巨大的全球地下土壤无机碳存量 上层土(蜕皮表层)因有机质大量积累而呈深色,下层土(钙质地层)因碳酸钙的存在而呈白色。根据《中国土壤分类学》,该土壤类型为钙质硅质寒武系。资料来源:张甘霖在发表于《科学》的一项研究中,中国科学院地理科学与资源研究所黄媛媛研究员和中国科学院土壤研究所张甘霖研究员领导的研究人员与合作者一起,量化了SIC的全球存储量,对这一长期存在的观点提出了挑战。研究人员发现,在全球土壤表层两米处以 SIC 形式储存的碳高达 23050 亿吨,是全球所有植被中碳含量总和的五倍多。这个隐藏的土壤碳库可能是了解碳如何在全球移动的关键。"但问题是:这个巨大的碳库很容易受到环境变化的影响,尤其是土壤酸化。酸性物质会溶解碳酸钙,并以二氧化碳气体或直接进入水中的形式将其排出,"黄教授说。"由于工业活动和高强度耕作,中国和印度等国家的许多地区正在经历土壤酸化。如果不采取补救措施和更好的土壤耕作方法,世界很可能在未来三十年内面临 SIC 的干扰。"地球历史上积累的对 SIC 的干扰对土壤健康有着深远的影响。这种破坏损害了土壤中和酸性、调节养分水平、促进植物生长和稳定有机碳的能力。从根本上说,SIC 在储存碳和支持依赖于它的生态系统功能方面发挥着至关重要的双重作用。研究人员发现,每年约有 11.3 亿吨无机碳从土壤流失到内陆水域。这种流失对陆地、大气、淡水和海洋之间的碳传输有着深远的影响,但往往被忽视。虽然社会已经认识到土壤的重要性,认为它是以自然为基础的应对气候变化解决方案的基本组成部分,但大部分关注点都集中在有机碳上。现在,无机碳显然同样值得关注。这项研究强调了将无机碳纳入气候变化减缓战略的紧迫性,将其作为维持和加强碳固存的额外杠杆。旨在每年增加(大部分)0.4% SOC 的"4 per mille initiative"等国际计划也应考虑无机碳在实现可持续土壤管理和气候减缓目标中的关键作用。研究人员希望通过扩大对土壤碳动态的了解,将有机碳和无机碳都包括在内,从而制定出更有效的战略来维护土壤健康、增强生态系统服务和减缓气候变化。编译来源:ScitechDaily ... PC版: 手机版:

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澳大研究团队成功研发近红外发光碳纳米点 #澳门大学 澳门大学应用物理及材料工程研究院教授曲松楠的研究团队提出熔合大共轭分子的策略,于国际上首次制备出在水溶液中近红外波段发光效率最高的碳纳米点。该碳纳米点的制备成本低廉,不到商业近红外染料ICG的百分之一,且其生物相容性好,安全无毒,为开发安全低成本的活体近红外萤光成像试剂提供了新思路。该研究成果已发表于国际知名学术期刊《先进科学》(Advanced Science)...

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