欧洲殖民如何导致了南部非洲的蓝羚羊灭绝

欧洲殖民如何导致了南部非洲的蓝羚羊灭绝 提取高覆盖率蓝羚羊核基因组的标本:来自瑞典自然历史博物馆的一只年轻雄性羚羊。来源:Hempel et al:Hempel et al.确定已灭绝的蓝羚羊(Hippotragus leucophaeus)标本的真实数量。资料来源:瑞典自然历史博物馆这项研究结果发表在《当代生物学》(Current Biology)杂志上,研究结果表明,该物种很可能适应了小规模的种群,并以这种方式生存了数千年。然而,这也使它们容易受到突然的影响,比如猎杀,而欧洲人在南部非洲殖民后,猎杀的数量有所增加。蓝羚羊(Hippotragus leucophaeus)是一种披着蓝灰色皮毛的非洲羚羊,与紫貂羚羊和红羚羊有亲缘关系。最后一只蓝羚羊是在 1800 年左右被射杀的,距离首次对其进行科学描述仅过去了 34 年。由迈克尔-霍夫赖特(Michael Hofreiter)博士教授领导的波茨坦进化生物学家组成的研究小组现已成功地从瑞典自然历史博物馆的一个标本中获得了40倍高覆盖率的基因组。这是仅有的五个经过DNA验证的蓝羚羊历史博物馆标本之一。基因组多样性低和种群规模小通常被认为是一种不利因素,因为它们会导致物种的适应性和适应能力下降。迈克尔-霍夫赖特解释说:"然而,蓝羚羊在1800年左右灭绝之前的许多千年里,种群规模一直很小。"伊丽莎白-亨普尔(Elisabeth Hempel)补充说,她在波茨坦大学和柏林自然历史博物馆的博士论文中对蓝羚羊进行了研究。对长期种群数量的分析还表明,冰河时期的气候波动并未对其产生影响。这对于大型食草哺乳动物来说是出乎意料的,因为这些周期应该会导致栖息地可用性的变化。这一结果表明,该地区目前的长期生态系统动态模型可能需要改进。蓝色羚羊图来源:P:P. L., Thomas, O. 《羚羊之书》第 4 卷 - 伦敦:1899-1900 年。Pl.LXXVI 资料来源:生物多样性遗产图书馆研究人员从他们的研究结果中得出结论,只要不受到快速作用的干扰,种群规模较小的物种也能存活很长时间。因此,在17世纪欧洲殖民南部非洲期间,人类的突然影响很可能是导致该物种灭绝的主要原因。在 DNA 分析过程中,还在基因组中发现了两个基因,这两个基因可能是造成该物种蓝色皮毛的原因,而蓝色皮毛正是蓝羚羊名字的由来。这要归功于与研究人员合作的生物技术公司 Colossal Bioscience 所提供的最先进的计算分析软件。Colossal 生物科学公司联合创始人兼首席执行官本-拉姆(Ben Lamm)说:"作为 Colossal 公司持续关注古 DNA、基因型与表型关系以及生态系统恢复的一部分,我们很荣幸能与霍夫莱特教授及其团队合作开展这项开创性工作。该项目的研究目标使我们的团队能够共同应用一些最新的Colossal古DNA和比较基因组算法来了解是什么真正使蓝羚羊成为独特的物种。"编译来源:ScitechDaily ... PC版: 手机版:

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长毛象的最后一战:弗兰格尔岛的生存秘密和神秘灭绝

长毛象的最后一战:弗兰格尔岛的生存秘密和神秘灭绝 弗兰格尔岛上的长毛猛犸象来自一个非常小的初始种群,尽管存在遗传障碍,但它们还是维持了 6000 年。它们的突然灭绝仍是一个谜,为当代的保护工作提供了借鉴。图片来源:Beth Zaiken一万年前,由于海平面上升,位于西伯利亚沿海的弗兰格尔岛上的长毛猛犸象的最后一个种群与大陆分离,与世隔绝。新的基因组研究表明,这个与世隔绝的种群在岛上生活了6000年,最初只有8个个体,在20代内扩大到200到300个个体。这项研究发表在6月27日的《细胞》(Cell)杂志上,研究表明弗兰格尔岛猛犸象表现出近亲繁殖和遗传多样性低的迹象,但这些因素本身并不能解释它们神秘和最终灭绝的原因。西伯利亚大陆獠牙。图片来源:Love Dalén资深作者洛夫-达伦(Love Dalén)是古遗传学中心的进化遗传学家,该中心是瑞典自然历史博物馆和斯德哥尔摩大学的合作机构。"这意味着很可能只是某个随机事件导致了它们的灭绝,如果那个随机事件没有发生,那么我们今天就还会有猛犸象。"爱-达伦图片来源:伊恩-沃茨除了揭示长毛猛犸象的种群动态,对弗兰格尔岛长毛猛犸象的分析还有助于为当今濒危动物的保护战略提供信息。第一作者、古遗传学中心的玛丽安-德哈斯克(Marianne Dehasque)说:"长毛象是了解当前生物多样性危机以及从遗传学角度了解一个物种经历种群瓶颈时会发生什么的绝佳系统,因为它们反映了当今许多种群的命运。"玛丽安-德哈斯克(Marianne Dehasque)在古 DNA 实验室工作。图片来源:Love Dalén为了了解弗兰格尔岛瓶颈对猛犸象种群造成的基因组后果,研究小组分析了21头长毛猛犸象的基因组,其中14头来自弗兰格尔岛,7头来自瓶颈发生前的大陆种群。这些样本跨越了长毛猛犸象存在的最后5万年,为了解长毛猛犸象基因多样性如何随时间发生变化提供了一个窗口。与大陆祖先相比,弗兰格尔岛猛犸象基因组显示出近亲繁殖和遗传多样性低的迹象。除了总体遗传多样性较低之外,它们在主要组织相容性复合体中的多样性也有所降低,而这组基因在脊椎动物的免疫反应中起着至关重要的作用。弗兰格尔岛的象牙。图片来源:Love Dalén研究人员的研究表明,在长毛象居住在弗兰格尔岛的6000年中,种群的遗传多样性持续下降,但下降速度非常缓慢,这表明长毛象的种群数量直到最后一直保持稳定。尽管在长达6000年的时间里,岛上的猛犸象种群逐渐积累了中等程度的有害变异,但研究人员发现,该种群正在缓慢地清除最有害的变异。德哈斯克说:"如果一个个体发生了极其有害的突变,它基本上就无法存活,因此随着时间的推移,这些突变逐渐从种群中消失,但另一方面,我们看到猛犸象几乎一直在积累轻微有害的突变,直到它们灭绝。对于当今的保护计划来说,重要的是要牢记,仅仅让种群数量恢复到适当的规模是不够的;你还必须积极地对其进行基因监测,因为这些基因组的影响可能会持续 6000 多年"。虽然这项研究分析的猛犸象基因组跨越了很大的时间跨度,但并不包括该物种存在的最后300年。不过,研究人员已经出土了猛犸象最后时期的化石,并计划在未来进行基因组测序。达伦说:"最后发生了什么仍然是一个谜我们不知道为什么它们在6000年的时间里一直很好,但我们认为这是突然发生的事情。我想说的是,我们仍然有希望找出它们灭绝的原因,但不能保证。"编译自/ScitechDaily ... PC版: 手机版:

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缅甸发现"令人费解"的竹叶青蛇类新品种

缅甸发现"令人费解"的竹叶青蛇类新品种 陈健安博士在缅甸发现的新物种伊洛瓦底蝮蛇说明了蝮蛇物种分化的复杂性。该物种同时具有红尾竹叶青和红树林竹叶青的特征,起初被认为是一种杂交种,但通过基因组分析证实其与众不同。图片来源:Wolfgang Wüster在另一个极端,单个物种的变异程度可能很高,给人造成不同物种的错觉。但如果同时遇到这两个极端,会发生什么情况呢?爬行动物学家陈健安( Chan Kin Onn)博士(曾在新加坡李光前自然历史博物馆工作,现供职于美国堪萨斯大学生物多样性研究所和自然历史博物馆)领导了一项研究,描述了缅甸的一种蝮蛇新物种,该物种与其姊妹物种既相似又不同。这一发现发表在开放获取期刊《ZooKeys》上。区分亚洲蝮蛇面临的挑战"竹叶青属的亚洲蝮蛇是出了名的难以区分,因为它们的形态变化多端。有些蝮蛇群中有多个外形相似的物种,而有些蝮蛇群体中的品种虽然外形大相径庭,但实际上却是同一个物种,"他们说。红尾竹叶青(Trimeresuruserythrurus)分布在缅甸北部沿海地区,通体绿色,身上没有任何斑纹。缅甸南部还有一种红树林竹叶青(Trimeresuruspurpureomaculatus)。这种蝮蛇的背部通常有明显的斑点,而且背部颜色多变,包括灰色、黄色、棕色和黑色,但绝不是绿色。有趣的是,在缅甸中部,夹在红尾竹叶青和红树林竹叶青的分布区之间,存在一个独特的种群,它是绿色的,带有不同程度的斑点,似乎是红尾竹叶青和红树林竹叶青的混合体。缅甸伊洛瓦底地区 Pyapon 县 Meinmahla Kyun 野生动物保护区的 Trimeresurus ayeyarwadyensis 标本。图片来源:Hla tun研究人员说:"缅甸中部的这个神秘种群让我们感到困惑,我们最初认为它可能是一个杂交种群。在另一篇论文中,Chan 博士利用现代基因组技术确定缅甸中部的种群实际上是一个独特的物种,而不是一个杂交种群。"但这并不是故事的结束。研究人员在研究这种蛇的形态特征时发现了另一个惊喜:他们发现这种新物种的变异性也很高。某些种群呈深绿色,有明显的斑点,很容易与近亲红尾竹叶青区分开来,后者呈鲜绿色,没有斑点。然而,新物种的某些种群则是鲜绿色,没有斑点,看起来与红尾竹叶青几乎完全相同。陈博士说:"这是一个有趣的现象,一个物种与其近亲(红尾竹叶青)既相似又不同。我们认为,在过去的某个时期,新物种可能与北方的红尾竹叶青和南方的红树林竹叶青交换了基因。"这个新物种被称为伊洛瓦底竹叶青(Trimeresurusayeyarwadyensis),指的是缅甸最大、最重要的河流之一伊洛瓦底江。伊洛瓦底江形成了一个广阔的三角洲,西面以柏德林河为界,东面以仰光河为界。这些河流及其相关流域也是伊洛瓦底竹叶青分布的最西端和最东端。编译自//scitechdaily ... PC版: 手机版:

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冰河时代的幸存者:棕熊是如何战胜灭绝的?

冰河时代的幸存者:棕熊是如何战胜灭绝的? 棕熊(Ursus arctos)是第四纪晚期巨型动物灭绝的幸存者之一。然而,尽管棕熊广泛分布于整个北冰洋地区,但其分布范围却大为缩小,在某些地理区域甚至已经灭绝。以前利用遗传数据进行的研究为了解棕熊的进化史提供了宝贵的资料。然而,大多数研究仅限于当代个体或线粒体 DNA,从而限制了对现今之前种群过程的了解。研究人员在论文中展示了来自日本本州和西伯利亚东部的两只晚更新世棕熊的基因组数据,并将其与已发表的棕熊全北极分布区的当代和古代基因组数据相结合,研究棕熊种群之间的时空进化关系。通过纳入在目前分布范围之外采样的晚更新世和全新世个体的基因组数据,发现了当代种群中不存在的多样性。值得注意的是,虽然当代个体显示出地理结构上的种群,很可能是由距离隔离驱动的,但这种模式在不同地区的古代样本中有所不同。将古棕熊纳入分析为棕熊的进化史提供了新的视角,有助于理解在晚第四纪消失的棕熊种群和多样性。棕熊的生态适应性很强,饮食范围很广。虽然棕熊是肉食动物,但它们的食物也可以主要由植物组成,这使它们能够适应环境的变化。然而,棕熊在上一个冰河时期也经历了广泛的分布范围缩小和地区性灭绝。棕熊曾生活在包括爱尔兰、日本第一大岛本州和加拿大魁北克在内的更广阔的区域。某些地区熊种群数量的减少或消失,是因为熊离开了这些地方,去了它们目前仍然生活的更好的地方,还是具有独特基因的独特熊群栖息在这些地区并灭绝,导致物种整体多样性的丧失?丹麦哥本哈根大学和日本山梨大学的研究人员通过研究距今3800年至6万年前的古棕熊基因组(包括棕熊现分布区以外的几个个体),试图通过调查棕熊之间跨越时空的进化关系来解决这个问题。他们的研究表明,棕熊并没有简单地随着环境的变化而迁移,而是出现了种群灭绝。远古棕熊代表了当今棕熊种群所不具备的遗传多样性。虽然棕熊在全球大灭绝中幸存了下来,但它们的历史分布范围和遗传多样性却遭受了相当大的损失。这一新观点强调了棕熊历史上的一个关键时期,以及它们在上一个冰河时代期间和之后也面临着挑战。该研究的资深作者迈克尔-韦斯特伯里(Michael Westbury)补充说:"在我们继续努力应对人类与野生动物共存的挑战时,从深远的过去获得的洞察力对于塑造可持续的未来非常宝贵。尽管研究最近的标本可以提供一些见解,但通过纳入过去和某一物种不再存在的地区的样本,我们可以更好地量化当前多样性模式是如何产生的,并为预测它们如何应对未来的环境变化提供信息。"参考文献:Takahiro Segawa、Alba Rey-Iglesia、Eline D. Lorenzen 和 Michael V. Westbury 于 2024 年 1 月 24 日发表于《英国皇家学会会刊B》,题为"从过去和现在棕熊种群的基因组推断全北极棕熊种群的起源和多样化"(The origins and diversification of Holarctic brown bear populations inferred from genomes of past and present populations)。DOI: 10.1098/rspb.2023.2411编译来源:ScitechDaily ... PC版: 手机版:

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基因组研究支持反刍动物角和鹿角的进化过程不是独立的假设

基因组研究支持反刍动物角和鹿角的进化过程不是独立的假设 作为小路易斯·格斯特纳 (Louis V. Gerstner, Jr.) 核心藏品的一部分,博物馆的理查德·吉尔德科学、教育和创新中心展出了各种各样的哺乳动物头饰。 图片来源:Alvaro Keding/AMNH这一发现由美国自然历史博物馆、巴鲁克学院和纽约市立大学研究生中心的研究人员发表在《通讯生物学》杂志上。“角和鹿角是极其多样化的结构,长期以来,科学家们一直在争论它们的进化起源,”巴鲁克学院和纽约市立大学研究生中心的助理教授、博物馆的研究员扎卡里·卡拉马里(Zachary Calamari)说。 “这项基因组研究不仅让我们更接近解决进化之谜,而且还帮助我们更好地了解所有哺乳动物的骨骼形成方式。”大约有 170 种现代反刍有蹄哺乳动物物种带有头饰,化石记录中的数量还有更多。 我们今天看到的头饰有四种类型:鹿角、角、骨角和叉角,它们有多种用途,包括用于防御、识别该物种的其他成员和交配。 直到最近,科学家们还不确定这些不同的骨制头饰是在每个反刍动物群体中独立进化的,还是来自共同的祖先。研究作者扎卡里·卡拉马里(Zachary Calamari)在美国自然历史博物馆扫描麋鹿头骨。 图片来源:Matt Shanley/AMNH作为比较生物学博士。 作为博物馆理查德·吉尔德研究生院的学生,Calamari 开始使用基因组和基于计算机的 3D 形状分析来研究这个问题。 卡拉马里与博物馆的弗里克哺乳动物化石馆长约翰·弗林合作,专注于对头饰的转录组进行测序,转录组是在特定时间在组织中表达的基因。 他们的研究支持这样一种观点,即所有反刍动物头饰的形式都是从一个共同的祖先进化而来的,是动物“前额”(头骨额骨附近的区域)的成对骨质生长物。弗林说:“我们的研究结果提供了更多证据,证明角是由颅神经嵴形成的,颅神经嵴是形成面部的胚胎细胞层,而不是由形成头部两侧和后部骨骼的细胞形成。令人惊讶的是,这些细胞与形成鹿角的细胞相同。 与其他骨骼和皮肤组织“对照”相比,牛角和鹿角的独特基因表达模式提供了令人信服的证据,证明这些壮观的骨骼结构的基本方面与古代祖先的共同起源。”通过将新测序的牛角转录组与鹿茸和猪皮转录组进行比较,Calamari 和 Flynn 首次利用转录组证实,头饰中的家族特异性差异很可能是随着从共同祖先遗传的一般骨骼结构的阐述而进化而来的。卡拉马里说:“除了支持角和鹿角单一起源的基因表达模式之外,我们的结果还表明这些结构中基因表达模式的调节可能与其他骨骼不同。这些结果帮助我们了解角和鹿角的进化历史,并可能表明其他反刍动物颅附属物(如骨角和叉角羚)的差异也是对共同祖先颅附属物的阐述。”编译来源:ScitechDaily ... PC版: 手机版:

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中国研究:诺氏驼或因“挑食”加速走向灭绝

中国研究:诺氏驼或因“挑食”加速走向灭绝 中国科研人员对已灭绝诺氏驼的古基因组进行研究后,揭示了旧大陆骆驼属动物演化历史的复杂性,发现诺氏驼因“挑食”在末次盛冰期加速走向灭绝。 新华社报道,中国地质大学科研人员与中国国家博物馆、丹麦哥本哈根大学等机构联合就“与现生双峰驼有着交叉亲缘关系的诺氏驼为何在晚更新世末期走向灭绝”等问题进行研究,发现“挑食”或是导致诺氏驼加速灭绝的主要原因之一。 论文通讯作者之一盛桂莲教授介绍,骆驼对干旱恶劣气候环境有很强的耐受性,是学界探究生物环境适应性的理想物种,其演化历史一直备受关注。早更新世晚期以来,分布在欧亚大陆的骆驼以现生的单峰驼、家双峰驼、野双峰驼和已灭绝的双峰驼诺氏驼为主。 研究团队获取了中国东北地区七个晚更新世时期诺氏驼化石材料的完整线粒体基因组及部分核基因组,利用骆驼属动物灭绝种与现生种的遗传学数据,结合形态学、年代学、稳定同位素数据开展跨学科分析,并对诺氏驼与现生双峰驼祖先种群可能存在的基因流动进行了分析。 发现在骆驼属动物的演化史上,欧亚大陆双峰驼不同物种存在广泛的基因流动,诺氏驼与家双峰驼、野双峰驼之间的演化关系不能模式化概括为简单的分叉树,推测其应为网状结构,其演化历史比学界已有认知更为复杂。 研究人员通过对诺氏驼样品的碳同位素分析发现,随着时间推移,诺氏驼食性变化不大,饮食习惯较单一,比较“挑食”。相比现生家双峰驼和野双峰驼,诺氏驼的核苷酸(nucleotide)多样性更低,这可能反映了在深海氧同位素3阶段期间诺氏驼种群就已发生了收缩,随后到来的末次盛冰期严酷气候环境成为压垮诺氏驼的“最后一根稻草”,大大加速了其灭绝进程。 这项研究成果日前在线发表在国际知名学术期刊《当代生物学》上。 2024年5月17日 9:08 PM

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DK博物大百科:自然界的视觉盛宴

DK博物大百科:自然界的视觉盛宴 描述:本书的出版是史密森博物院国家自然历史博物馆的一个里程碑,本书展示了对地球自然历史的无与伦比的视觉盛宴。清楚地概述了自然世界的分类。本书涵盖超过6000种博物学世界的物种,众多独家的照片,着眼于成干上万的标本和物种展示,观看本书就像行走在视觉画廊中,让读者踏上一段难以置信的旅程,从自然界最基本的板块,到最简单的生命形式微生物,再到植物,真菌和动物。 链接:https://www.aliyundrive.com/s/Bf1cfUssWiK 大小:300MB 标签:#book #电子书 #DK #博物 来自:雷锋 版权:版权反馈/DMCA 频道:@shareAliyun 群组:@aliyundriveShare 投稿:@aliyun_share_bot

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