科学家解决了困扰数十年之久的显微镜问题

科学家解决了困扰数十年之久的显微镜问题DaanBoltje和ErnestvanderWee的实验装置。光学显微镜的镜头(右下角)被空气包围,透过玻璃板观察小球。在玻璃板顶部,样品被置于一滴水中。玻璃板和小球之间的距离可以调节,这样研究人员就可以改变深度。资料来源:代尔夫特理工大学代尔夫特理工大学(DelftUniversityofTechnology)的研究人员现在首次证明,这种扭曲并不是恒定的,这与许多科学家几十年来的假设相反。这一突破发表在《光学》(Optica)杂志上,证实了诺贝尔奖得主斯特凡-海尔(StefanHell)在上世纪90年代的预测。通过在线计算工具和软件,每位研究人员现在都能确定生物样本的正确深度。用显微镜观察生物样本时,如果物镜透镜所处的介质与样本不同,光束就会受到干扰。例如,当使用被空气包围的透镜观察水样时,光线在透镜周围的空气中比在水中弯曲得更厉害。这种干扰会导致测量的样品深度小于实际深度。"因此,样品看起来会变平。这个问题由来已久,从上世纪80年代开始,人们就提出了一些理论来确定一个用于确定深度的校正系数。然而,所有这些理论都假定这一系数是恒定的,与样品的深度无关。尽管后来的诺贝尔奖获得者斯蒂芬-海尔(StefanHell)在上世纪90年代指出,这种比例可能与深度有关,但还是出现了这种情况",雅各布-霍根布姆(JacobHoogenboom)副教授解释道。代尔夫特理工大学的前博士后谢尔盖-洛格诺夫(SergeyLoginov)通过计算和数学模型证明,样品在靠近透镜的地方确实比远离透镜的地方显得更加扁平。博士生DaanBoltje和博士后ErnestvanderWee随后在实验室证实,矫正因子与深度有关。VanderWee:"我们已将结果汇编成网络工具和软件,随文章一起提供。有了这些工具,任何人都可以为自己的实验确定精确的校正因子"。"部分得益于我们的计算工具,我们现在可以非常精确地从生物系统中切出蛋白质及其周围环境,用电子显微镜确定其结构。这种显微镜非常复杂、耗时,而且价格昂贵。因此,确保观察到正确的结构非常重要,"Boltje说。"有了我们更精确的深度测定,我们在错过生物目标的样本上所需花费的时间和金钱就会大大减少。最终,我们可以研究更多相关的蛋白质和生物结构。而确定生物系统中蛋白质的精确结构,对于了解并最终防治异常和疾病至关重要。"在他们制作的网络工具中,您可以填写实验的相关细节,如折射率、物镜孔径角和所用光线的波长:https://axialscaling.pythonanywhere.com/然后,该工具会显示与深度相关的缩放因子曲线。您还可以导出这些数据供自己使用。此外,您还可以将结果与现有理论的结果结合起来绘制。编译来源:ScitechDaily...PC版:https://www.cnbeta.com.tw/articles/soft/1428229.htm手机版:https://m.cnbeta.com.tw/view/1428229.htm

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科学家研制出改进型中红外显微镜 清晰度提高30倍

科学家研制出改进型中红外显微镜清晰度提高30倍这幅插图左上方是用中红外线照射的细菌,下方显微镜发出的可见光帮助捕捉图像。细菌内部的化学图像比传统的中红外显微镜清晰30倍。图片来源:2024Ideguchi等人/《自然-光子学》(NaturePhotonics)研究人员说,这一最新进展产生了120纳米的图像,比典型的中红外显微镜的分辨率提高了30倍。能够在更小的范围内更清晰地观察样本,有助于多个领域的研究,包括传染病研究,并为未来开发更精确的中红外成像技术开辟了道路。微观领域是病毒、蛋白质和分子的栖息地。借助现代显微镜,我们可以大胆地观察自己细胞的内部结构。但即使是这些令人印象深刻的工具也有其局限性。例如,超分辨率荧光显微镜需要用荧光标记标本。这有时会对样本产生毒性,而且在观察时长时间暴露在光线下会漂白样本,这意味着它们不再有用。电子显微镜也能提供令人印象深刻的细节,但样本必须置于真空中,因此无法研究活体样本。相比之下,中红外显微镜可以提供活细胞的化学和结构信息,而无需对细胞进行着色或破坏。然而,由于中红外显微镜的分辨率相对较低,它在生物研究中的应用受到了限制。超分辨荧光显微镜可以将图像缩小到数十纳米(1纳米为一毫米的百万分之一),而中红外显微镜通常只能达到3微米左右(1微米为一毫米的千分之一)。然而,东京大学的研究人员在一项新的突破中,实现了比以往更高的中红外显微镜分辨率。"我们的空间分辨率达到了120纳米,即0.12微米。"东京大学光子科学与技术研究所的TakuroIdeguchi教授解释说:"这一惊人的分辨率大约是传统中红外显微镜分辨率的30倍。"研究小组使用了"合成孔径"技术,该技术结合了从不同照明角度拍摄的多幅图像,以生成更清晰的整体图像。通常情况下,样品被夹在两个透镜之间。然而,透镜会无意中吸收部分中红外光。为了解决这个问题,研究人员将细菌样本(使用了大肠杆菌和RhodococcusjostiiRHA1)放在硅板上,硅板可以反射可见光并透过红外线。这样,研究人员就可以使用单透镜,用中红外光更好地照射样品,获得更详细的图像。"我们对能够如此清晰地观察细菌的胞内结构感到惊讶。我们显微镜的高空间分辨率可以让我们研究抗菌药耐药性等世界性问题,"Ideguchi说。"我们相信,我们可以从多个方向继续改进这项技术。如果我们使用更好的透镜和更短的可见光波长,空间分辨率甚至可以低于100纳米。有了更高的清晰度,我们希望研究各种细胞样本,以解决基础和应用生物医学问题。"编译来源:ScitechDaily...PC版:https://www.cnbeta.com.tw/articles/soft/1428501.htm手机版:https://m.cnbeta.com.tw/view/1428501.htm

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显微镜自由:廉价镜超过数百万美元高档货使用现有超高分辨率和扩展显微镜方法(从左至右1-3)以及ONE显微镜技术(4、5)产生的微管蛋白图像。图片来源:bioRxiv“显微镜技术也应该有某种形式的自由。”Rizzoli指出,该技术的高分辨率适用于很多人,而不是少数有钱的实验室。传统光学显微镜的能力受到光学定律的限制,这意味着观测小于200纳米物体的结果是模糊的。Rizzoli说,研究人员已经开发出获得超越物理学的超高分辨率的方法,可以将这一极限降低到10纳米左右。这种方法获得了2014年诺贝尔化学奖,它使用光学技巧精确定位附着在蛋白质上的荧光分子。2015年,研究人员提出了另一种规避光学限制的方法。美国麻省理工学院神经工程师EdwardBoyden领导的研究小组发现,充气组织(尿布中使用的一种吸收性化合物)可以使细胞彼此远离。这种被称为膨胀显微镜的技术使显微镜分辨率有了飞跃,可以分辨20纳米左右的结构。Shaib和Rizzoli的技术融合了这两种方法,可以达到1纳米以下的分辨率。这种清晰度足以揭示单个蛋白质的形状,而此前通常使用更昂贵的结构生物学方法,如冷冻电镜,或X射线结晶学方法对这些蛋白质进行成像。膨胀显微镜的简单性是其具有吸引力的部分原因,Boyden估计,超过1000个实验室采用了这项技术。样品经过化学处理,将蛋白质固定在一种聚合物上,加入水后,聚合物会膨胀到原来的1000倍,使分子分离。ONE显微镜技术利用热或酶分解蛋白质,这样单个片段在膨胀过程中就会被拉伸到不同的方向。研究人员已经使用新方法获得了一种神经分子GABAA受体的图片,后者与蛋白质的高分辨率冷冻电镜和X射线结晶学图片非常相似。他们还捕捉到一种名为耳铁蛋白的大体积蛋白质的轮廓,这种蛋白质的结构尚未确定,它有助于在大脑中传递音频信号。这个形状类似于AlphaFold深度学习网络作出的结构预测。该方法无法与冷冻电镜的分辨率相匹配,后者在某些情况下可以揭示小于0.2纳米的近原子级细节。冷冻电镜技术既精细又昂贵。Rizzoli说,相比之下,ONE显微镜可以提供一种了解几乎任何分子结构的快速而简单的方法。Rizzoli说,开发这项技术的部分动机是扩大尖端光学显微镜的可及性。ONE显微镜技术简单,适用于20世纪90年代已过时的荧光显微镜。位于埃及的开罗德国大学制药技术专家SalmaTammam计划今年夏天派一名博士生学习这项技术。她的实验室正在研究纳米颗粒如何在细胞中移动,他们想要看到粒子及其运载物的细节。但与低收入和中等收入国家的许多研究人员一样,他们无法获得昂贵的超高分辨率显微镜。德国莱布尼茨分子药理学中心生物学家NoaLipstein说,扩大超高分辨率显微镜的应用范围对资金雄厚机构的科学家也很重要。她最近成立了一个独立的研究小组,并将ONE显微镜应用于对神经突触细节的研究。相关论文信息:https://doi.org/10.1101/2022.08.03.502284《中国科学报》(2023-04-19第2版 国际)...PC版:https://www.cnbeta.com.tw/articles/soft/1355601.htm手机版:https://m.cnbeta.com.tw/view/1355601.htm

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新型二合一显微镜可详细观察细胞内部结构如今,科学家们已经能够使用功能强大的显微镜窥视细胞内部。要了解特定生物分子是如何作用和反应的,这一点非常重要。然而,这些工具也有一些缺点。以超分辨率荧光显微镜(SRM)为例。它非常适合追踪细胞中的单个分子(如蛋白质),但不能向科学家展示附近发生了什么。此外,虽然低温电子断层扫描(cryo-ET)可以获得高分辨率的细胞图像,但它无法精确定位单个分子在做什么。因此,美国能源部斯坦福线性加速器中心(SLAC)国家加速器实验室的研究人员着手将这两种成像技术结合到一台显微镜中。研究报告的第一作者彼得-达尔伯格(PeterDahlberg)说:"我们的目标是保持两种技术的优点。保留了荧光显微镜的分子特异性,所以你知道谁是谁,然后可以把它放在低温电子显微镜的高分辨率结构中。"荧光显微镜技术是用一种较小的分子标记单个分子,这种分子在光线照射下会发光。然后就可以在普通的--尽管分辨率非常高--光学显微镜下追踪该分子。低温电子显微镜使用电子显微镜来研究细胞等速冻样本。将这两种技术相结合后,研究人员立即遇到了需要克服的问题。首先,必须将含有荧光标记分子的细胞投放到直径仅为3毫米的低温电子显微镜网格上,然后快速冷冻,使网格上的水变成玻璃(玻璃化)。一旦冻结,细胞就必须保持冻结状态。第二个问题是冷冻细胞的大小--它们有数千纳米厚--但冷冻CT使用的电子无法穿透200纳米以下的深度。因此,研究人员开发了一种名为"聚焦离子束铣削系统"的设备,该设备附带扫描电子显微镜(FIB-SEM)。聚焦离子束会切割掉细胞材料,留下冷冻ET可以穿透的极薄的冷冻细胞片。然后,扫描电子显微镜向样品发射电子,生成高分辨率图像。原型FIB-SEM有一个问题:它没有连接光学显微镜,这意味着必须移动冷冻-ET网格才能进行荧光显微镜检查。幸运的是,解决方法很简单。Dahlberg说:"从根本上说,我们只是拆开了这台价值150万美元的精密仪器,安装了这个集成的光学显微镜,现在我们有了一个更好的系统。"研究人员在2020年测试了FIB-SEM,追踪细菌细胞内的蛋白质,发现它可以工作,但意识到冷冻ET网格的材料会吸收光线,破坏冷冻样本。因此,他们进行了一些调整,设计了更好的网格,并为光学显微镜制作了更好的平台。现在,研究人员正在设计不同种类的荧光标签--生物传感器--以便在低温条件下工作。生物传感器是一种荧光分子,能根据当地环境改变其发射或激发特性,在一种环境中发出一种颜色,而在另一种环境中则发出不同的颜色。Dahlberg说:"它们可以被调整为对pH值、适应数百种环境变量。因此,除了具体位置和高分辨率结构信息外,你还可以知道我的细胞是健康的还是生病的?即将进行细胞分裂?ATP浓度高吗?它提供了所有这些额外的内容。"研究人员将继续修补FIB-SEM,直到它得到优化并充分发挥其潜力。...PC版:https://www.cnbeta.com.tw/articles/soft/1389293.htm手机版:https://m.cnbeta.com.tw/view/1389293.htm

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史上最小发光二极管面世:可让手机摄像头秒变全息显微镜同时,新型LED在室温下表现出高空间强度(102±48毫瓦/平方厘米),并且在所有已知的硅发射器中具有最小的发射面积(0.09±0.04平方微米)。研究人员随后将这种LED集成到一个不需要透镜或针孔的在线、厘米级全硅全息显微镜中。科学家还构建了一种新颖的、未经训练的深度神经网络架构,该架构能使全息显微镜重建图像并提高图像质量。与需要训练的传统方法不同,新的神经网络架构通过在算法中嵌入物理模型来消除训练的需要,允许研究人员在事先不了解光源光谱或光束轮廓的情况下使用新型光源。据介绍,这种微型LED和神经网络的协同组合,可以用于其他计算成像,例如用于活细胞跟踪的紧凑型显微镜或活植物等生物组织的光谱成像。...PC版:https://www.cnbeta.com.tw/articles/soft/1358773.htm手机版:https://m.cnbeta.com.tw/view/1358773.htm

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一种基于无透镜成像的新方法可以实现近乎完美的高分辨率显微镜观察圆环状光束从具有规则重复结构的物体上反弹产生的散射图案。资料来源:Wang等人,2023年,"Optica"(光学)。功能最强大的无透镜成像技术被称为"层析成像",其工作原理是用类似激光的光束扫描样品,收集散射光,然后利用计算机算法重建样品图像。虽然层析成像技术可以观察到许多纳米结构,但这种特殊的显微镜在分析具有非常规则的重复图案的样品时会遇到困难。这是因为在扫描周期性样品时,散射光不会发生变化,因此计算机算法会感到困惑,无法重建良好的图像。面对这一挑战,刚刚毕业的博士研究员王斌和内森-布鲁克斯与JILA研究员MargaretMurnane和HenryKapteyn合作,开发出一种新方法,利用具有特殊涡旋或甜甜圈形状的短波长光来扫描这些重复表面,从而产生更多不同的衍射图样。这使得研究人员能够利用这种新方法捕捉到高保真的图像重建,他们最近在《光学》(Optica)杂志上发表了这篇论文。这项成果还将在《Optica》杂志的《光学与光子学新闻》(OpticsandPhotonicsNews)2023年光学年度要闻中重点介绍。这种新的成像方法对于纳米电子学、光子学和超材料的应用尤其具有影响力。Murnane解释说:"将可见激光束结构化(或改变其形状)为甜甜圈和其他形状的能力彻底改变了可见光超分辨率显微镜技术。现在,我们有了将这些强大功能应用到更短波长的途径,这非常令人兴奋"。雕刻涡形高次谐波束为了在台式装置中产生类似激光的短波长光束,JILA小组使用了一种称为高次谐波发生(HHG)的过程。当超高速激光脉冲击中一个原子时,高次谐波发生器会将一个电子拉走,然后将其驱回母体原子重新结合。原子在接触时,会将电子的动能转化为极紫外(EUV)光。如果数以百万计的原子都同步发出极紫外光,那么这些光波就会产生类似激光的明亮极紫外光束。为了给重复图案成像,JILA的研究人员需要找到一种改变HHG光束的方法,这样当EUV光束在样品上扫描时,散射光就会发生变化。为了达到这一效果,研究人员将HHG光束从圆盘状转变为涡旋状或甜甜圈状,这就是所谓的轨道角动量(OAM)光束。这种不同的形状对于实现周期性样品的无透镜成像至关重要。当科学家们用漩涡状的HHG光束照射显微镜时(见附图),会产生更复杂的散射图案,这些图案会随着样品的扫描而变化。这些变化编码了样品重复图案的信息,使算法能够提取精确的图像。除了这一令人兴奋的结果之外,与扫描电子显微镜相比,这种新型涡流束无透镜成像技术对脆弱样品的损伤也更小。由于许多软性材料、塑料和生物样本都很脆弱,因此有一种精确而温和的方法来对它们进行成像是非常关键的。此外,涡流束无透镜成像比扫描电子显微镜更能检测出纳米图案中的缺陷,因为扫描电子显微镜往往会融化脆弱的样品。对于为下一代纳米、能源、光子和量子设备制造图案化材料的科学家来说,这一进步能够在不破坏高周期结构的情况下对其进行高分辨率成像。正如Kapteyn所说:"未来,这也有可能以高空间分辨率对微妙的活细胞进行成像"。编译自:ScitechDaily...PC版:https://www.cnbeta.com.tw/articles/soft/1424145.htm手机版:https://m.cnbeta.com.tw/view/1424145.htm

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