科学家揭示蜜蜂群落中黄曲霉菌的隐秘共生

科学家揭示蜜蜂群落中黄曲霉菌的隐秘共生 黄曲霉菌对在蜂群中生存有独特的适应性。资料来源:Ling-Hsiu Liao西方蜜蜂(Apis mellifera )以蜜蜂"面包"的形式储存大量食物,作为蜂群的主要营养。这种营养丰富的食物尽管呈酸性且含水量低,却能吸引各种微生物。此外,蜜蜂面包上还涂有蜂胶这种抗菌物质,为微生物的生存创造了一个具有挑战性的环境。尽管蜂巢中的面包不适合蜜蜂食用,但蜂巢中的微生物群包括多种细菌和真菌,它们对蜜蜂食物的准备、储存和消化非常重要。贝伦鲍姆(IGOH/GEGC/GNDP)实验室的研究生丹尼尔-布什(Daniel Bush)说:"大多数关于蜜蜂面包的研究都集中在细菌上,人们认为真菌并没有发挥很大的作用,因为细菌让面包对真菌来说太不友好了。在与真菌学家交谈后,我怀疑事实并非如此,于是我开始证明真菌能够成功地在蜜蜂面包中生存。"在这项研究中,研究人员使用了三种黄曲霉菌株:一种是蜂巢中没有的菌株,一种是从伊利诺伊州中部的蜂巢中分离出来的菌株,还有一种是从感染了石蒜病的蜜蜂群中分离出来的致病菌株。他们首先测试了菌株对 pH 值和温度的反应是否存在差异。之所以研究后者,是因为蜂巢全年的温度都高于外部环境,这对许多微生物来说都是一个挑战。虽然这些菌株都能在不同的温度范围内生长,但它们在不同的 pH 值条件下生长差异明显。从蜂巢中分离出来的菌株能够承受低 pH 值,而其他两种菌株则不能。这些菌株还在不同的日照电位(衡量可用水分的多少)和对蜂胶的反应条件下进行了测试。布什说:"我们看到,来自蜂巢的菌株能够应对来自菌落特定来源的极端环境压力。有趣的是,它能够处理蜂胶,而蜂胶被认为具有杀菌特性。"为了更好地了解与蜂巢相关的真菌物种是如何适应环境的,研究人员还对黄曲霉菌株进行了测序,发现它有几种基因突变,能够耐受蜜蜂面包环境的恶劣条件。布什说:"我们认为,这些迹象表明,真菌有一定程度的适应性,可以帮助它与蜜蜂共同生活。我们怀疑这两种生物之间存在某种互利关系,但我们还没有找到足够的证据。"研究人员现在希望研究这种真菌在蜜蜂生命周期中对不同成分的蜜蜂面包的作用。他们希望,他们的研究工作能够揭示,常规用于保护蜂巢的杀真菌剂将如何影响这些微生物。编译来源:ScitechDaily ... PC版: 手机版:

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中国科学家发现让茶叶口感更佳的秘密

中国科学家发现让茶叶口感更佳的秘密 研究表明,茶叶的品质不仅取决于茶树的品种,还取决于茶树根部的微生物,改变这些微生物群落可以提高氨基酸含量,从而显著改善茶叶品质。"通过微生物组学研究,我们在不同品质的茶树根部发现了微生物群落的显著差异,尤其是与氮代谢相关的微生物,"中国福建农林大学的许通达说。"最关键的是,通过从优质茶树根系中分离和组装合成微生物群落,我们成功地显著提高了不同茶树品种的氨基酸含量,从而改善了茶叶品质"。这张照片显示的是中国福建武夷山的茶山茶叶栽培的挑战和微生物解决方案中国拥有丰富的茶树遗传资源。但是,研究人员解释说,通过分子遗传育种方法提高茶叶品质具有挑战性。人们有兴趣寻找其他方法来改造和提高茶叶品质,或许包括使用微生物制剂。早先的研究表明,生活在植物根部的土壤微生物会影响植物吸收和利用养分的方式。在新的研究中,研究人员希望进一步了解根部微生物对茶叶品质的具体影响。他们发现,茶叶根部的微生物会影响其对氨的吸收,进而影响茶氨酸的产生,而茶氨酸是决定茶叶口感的关键。他们还发现,不同茶叶中定植的微生物存在差异。通过比较茶氨酸含量不同的茶叶品种,他们确定了一组微生物,这些微生物有望改变氮代谢,提高茶氨酸的含量。接下来,他们构建了一个被称为"SynCom"的合成微生物群落,该群落与一种名为"Rougui"的高丙氨酸茶叶品种的微生物群落非常相似。当他们将 SynCom 应用于茶叶根部时,发现它提高了茶氨酸的水平。这种微生物还能让拟南芥这种常用于基础生物学研究的植物更好地耐受低氮条件。对农业的广泛影响该研究的合著者唐文新说:"人们最初对从优质茶树根部提取的合成微生物群落的期望是提高劣质茶树的品质。然而,我们惊讶地发现,合成微生物群落不仅能提高低品质茶树的品质,还能对某些高品质茶叶品种产生显著的促进作用。而且,这种效果在低氮土壤条件下尤为明显"。这张照片显示的是中国福建武夷山的茶山研究结果表明,合成微生物群落可以改善茶叶的品质,尤其是在缺氮的土壤条件下生长的茶叶。由于茶树需要大量的氮,这一发现有助于减少化肥的使用,同时提高茶树的品质。这些发现可能会对更广泛的农作物产生重要影响。"根据我们目前的实验结果,加入 SynCom21 微生物群落不仅改善了不同茶叶品种对铵态氮的吸收,还增强了拟南芥对铵态氮的吸收,"许说。"这表明,SynCom21的铵态氮吸收促进功能可能适用于各种植物,包括其他作物。"例如,它可以培育出品质更好的水稻,包括蛋白质含量更高的水稻。他们现在计划进一步优化 SynCom,并评估其在田间试验中的应用。他们还希望进一步了解根部微生物如何影响茶树的其他次生代谢物。编译来源:ScitechDaily ... PC版: 手机版:

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科学家在人类体内发现全新类型的"生物实体"

科学家在人类体内发现全新类型的"生物实体" 我们随身携带的微生物组非常庞大,并且仍在了解有关其构成及其如何影响我们健康的新知识。我们时常会在微生物组中发现新的细菌或病毒菌株,但科学家很少会发现一组全新的、不属于任何已知类别的实体。斯坦福大学的研究小组称它们为"方尖碑"(Obelisks),这要归功于它们的杆状结构。前者我们都很熟悉,而病毒则是更简单的 RNA 分子,可以通过分解和重组基因组进行复制,但不产生蛋白质,也没有保护壳。方尖碑具有类病毒的基本结构,但与病毒一样,它们简单的基因组似乎也能编码科学家称之为"方尖碑蛋白"的未知蛋白质。事实证明,方尖碑非常常见,而且种类繁多,令人惊讶。科学家们从世界各地 400 多人的微生物组样本中发现了近 3 万种不同类型的方尖碑。在大约 50% 的口腔微生物组测试样本和 7% 的肠道样本中都发现了它们。迄今为止,它们似乎还没有被发现,因为它们看起来并不像我们所知道的其他任何东西。研究人员在论文中写道:"我们发现,方尖碑形成了自己独特的系统发育群,与已知的生物制剂没有可检测到的序列或结构相似性。"它们在我们体内究竟做了什么,目前仍是一个谜。它们可能帮助宿主,也可能伤害宿主,宿主可能不是我们,而是以我们的身体为家的细菌或真菌。到目前为止,最主要的候选菌是存在于牙菌斑中的血链球菌。血链球菌生活在人类口腔中,是一组新描述的 RNA 实体的宿主。图片来源:英国卫生安全局/科学图片库研究人员说,这种易于培养的细菌物种将是进一步研究方尖碑的最佳起点。该研究尚未通过同行评审,但已作为预印本在bioRxiv 上发布。 ... PC版: 手机版:

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科学家发现制作不同颜色蓝纹奶酪的方法

科学家发现制作不同颜色蓝纹奶酪的方法 左侧。Pencillium roqueforti(野生型在最右侧)产生的颜色菌株光谱。右侧。使用该真菌的原始菌株(深蓝绿色)或新颜色菌株(红眉毛、亮绿色、白化)制作的奶酪横截面。资料来源:诺丁汉大学色彩变化背后的科学全世界都在使用青霉菌生产蓝纹奶酪,如斯蒂尔顿、洛克福尔和戈贡佐拉。其独特的蓝绿色和风味来自真菌生长形成的色素孢子。真菌生物学教授保罗-戴尔博士领导的研究小组利用生物信息学、定向基因缺失和异源基因表达相结合的方法,了解了蓝绿色色素的产生方式。研究人员发现,蓝色色素是通过生化途径逐渐形成的,从白色开始,逐渐变成黄绿色、红褐粉红色、深褐色、浅蓝色,最后变成深蓝绿色。研究小组随后利用一些经典的食品安全(非转基因)技术,在某些环节上"阻断"了这一途径,从而创造出具有新颜色的菌株,可用于奶酪生产。保罗-戴尔博士。资料来源:诺丁汉大学奶酪口味和外观的创新戴尔博士说:"我们对奶酪真菌的兴趣已经有 10 多年了,传统上,当生产霉变奶酪时,我们会得到蓝纹奶酪,比如斯蒂尔顿(Stilton)、洛克福(Roquefort)和戈尔贡佐拉(Gorgonzola),这些奶酪使用的是蓝绿色的固定真菌菌株,我们想知道的是能否开发出具有新口味和新外观的新菌株。方法是诱导真菌进行有性生殖,因此我们第一次能够产生各种具有新口味的菌株,包括诱人的新的温和口味和浓郁口味。然后,我们又为其中一些新菌株制作了新的彩色版本。"彩色衍生物。资料来源:诺丁汉大学研究小组用新的颜色菌株制作出奶酪后,便使用实验室诊断仪器来观察奶酪的味道。戴尔博士说:"我们发现,它们的味道与最初的蓝色菌株非常相似。有细微的差别,但不是很大。有趣的是,当我们制作出一些奶酪后,我们与来自全校的志愿者进行了一些品尝试验,我们发现,当人们品尝浅色菌株时,他们认为它们的味道更温和,深色菌株的味道更浓郁。同样,对于偏红棕色和浅绿色的大麻,人们认为它们带有水果香味,而实验室仪器显示它们的味道非常相似。这表明,人们确实不仅通过品尝,还通过视觉来感知味道"。未来发展和商业前景该团队包括首席研究生马特-克莱尔(Matt Cleere),现在将与诺丁汉郡和苏格兰的奶酪生产商合作,生产出新颜色的蓝纹奶酪。此外,还成立了一家名为Myconeos的大学衍生公司,以研究这些菌株是否可以商业化。戴尔博士补充说:"我个人认为,人们在食用这些新奶酪时会有一种非常满足的感官享受,希望能吸引一些新人进入市场。"编译来源:ScitechDaily ... PC版: 手机版:

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科学家正利用土壤微生物的DNA帮助提高气候模型的准确性

科学家正利用土壤微生物的DNA帮助提高气候模型的准确性 微生物模型利用广泛的基因组数据为土壤碳模拟提供动力。图片来源:Victor O. Leshyk 插图这个新模型使科学家们能够更好地了解某些土壤微生物如何有效地储存植物根系提供的碳,并为农业战略提供信息,以保护土壤中的碳,支持植物生长和减缓气候变化。"我们的研究证明了直接从土壤中收集微生物遗传信息的优势。在此之前,我们只掌握了实验室研究的少数微生物的信息,"论文第一作者、伯克利实验室博士后研究员吉安娜-马施曼(Gianna Marschmann)说。"有了基因组信息,我们就能建立更好的模型,预测各种植物类型、作物甚至特定栽培品种如何与土壤微生物合作,更好地捕集碳。同时,这种合作还能增强土壤健康"。最近发表在《自然-微生物学》杂志上的一篇新论文介绍了这项研究。论文的通讯作者是伯克利实验室的 Eoin Brodie 和劳伦斯利弗莫尔国家实验室的 Jennifer Pett-Ridge,后者领导着"微生物持久存在"土壤微生物组科学重点领域项目,该项目由能源部科学办公室资助,以支持这项工作。看见看不见的东西 - 微生物对土壤健康和碳的影响土壤微生物帮助植物获取土壤养分,抵抗干旱、疾病和虫害。它们对碳循环的影响在气候模型中的体现尤为重要,因为它们会影响土壤中储存的碳量或在分解过程中以二氧化碳形式释放到大气中的碳量。通过利用这些碳构建自己的身体,微生物可以将碳稳定(或储存)在土壤中,并影响碳在地下的储存量和储存时间。这些功能与农业和气候的相关性正受到前所未有的关注。然而,仅一克土壤中就含有多达100 亿个微生物和数千个不同物种,绝大多数微生物从未在实验室中被研究过。直到最近,科学家们才从实验室研究的极少数微生物中获得数据,为这些模型提供依据,其中许多微生物与需要在气候模型中体现的微生物无关。Brodie解释说:"这就好比根据只生长在热带森林中的植物所提供的信息,为沙漠建立生态系统模型。"为了应对这一挑战,科学家团队直接利用基因组信息建立了一个模型,该模型能够适应任何需要研究的生态系统,从加利福尼亚的草原到北极解冻的永久冻土。该模型利用基因组深入了解土壤微生物的功能,研究小组将这种方法用于研究加利福尼亚牧场中植物与微生物组之间的相互作用。牧场在加州具有重要的经济和生态意义,占陆地面积的 40% 以上。研究重点是生活在植物根部周围的微生物(称为根圈)。这是一个重要的研究环境,因为尽管根区只占地球土壤体积的 1-2%,但据估计,根区储存了地球土壤中 30-40% 的碳,其中大部分碳是由根系在生长过程中释放出来的。为了建立这个模型,科学家们利用加州大学霍普兰研究与推广中心提供的数据,模拟了微生物在根部环境中的生长情况。不过,这种方法并不局限于特定的生态系统。由于某些遗传信息与特定的性状相对应,就像人类一样,基因组(模型所基于的)与微生物性状之间的关系可以转移到世界各地的微生物和生态系统中。研究小组开发了一种新方法来预测微生物的重要性状,这些性状会影响微生物利用植物根系提供的碳和养分的速度。研究人员利用该模型证明,随着植物的生长和碳的释放,由于根系化学和微生物性状之间的相互作用,会出现不同的微生物生长策略。特别是,他们发现,生长速度较慢的微生物在植物生长后期会受到碳释放类型的青睐,而且它们在利用碳方面的效率出奇地高这使它们能够在土壤中储存更多的这种关键元素。这一新的观测结果为改进模型中根系与微生物之间的相互作用提供了依据,并提高了预测微生物如何影响气候模型中全球碳循环变化的能力。"这些新发现对农业和土壤健康具有重要意义。通过我们正在建立的模型,我们越来越有可能利用对碳如何在土壤中循环的新认识。这反过来又为我们提供了可能性,使我们能够提出保护土壤中宝贵的碳的策略,从而在可行的范围内支持生物多样性和植物生长,以衡量其影响,"马施曼说。这项研究强调了利用基于遗传信息的建模方法来预测微生物性状的威力,有助于揭示土壤微生物组及其对环境的影响。编译来源:ScitechDaily ... PC版: 手机版:

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科学家发现两种益生菌能促进狗狗减肥

科学家发现两种益生菌能促进狗狗减肥 美国微生物学会期刊《微生物频谱》(Microbiology Spectrum)最近发表的一项研究显示,研究人员发现两种益生菌株能有效减轻肥胖犬的体重。在这项新研究中,研究小组调查了伴侣动物的代谢疾病,并着手确定适合长期安全治疗的益生菌。这项研究的主要研究者、韩国首尔国立大学农业与生命科学学院农业生物技术系教授、博士生导师金英勋(Younghoon Kim)介绍说,最初的挑战是选择特定的代谢疾病进行研究,这让他们把重点放在了'宠物肥胖症'这一普遍问题上。值得注意的是,全球老年宠物的肥胖症发病率较高,约占各年龄组宠物总数的 50%。这些宠物中有很大一部分正在接受治疗,包括饮食干预。Kim说:"在这种情况下,我们团队启动了实验,主要目标是找出能够降低宠物体内脂肪比例的益生菌。主要目标之一是提高人们对进一步研究宠物专用益生菌的迫切需要的认识,同时强调潜在应用的益生菌种类繁多。"益生菌在宠物健康中的作用除了认识到益生菌在解决特定问题方面的作用,金还主张认识到益生菌在治疗伴侣动物多种疾病方面的广泛可能性。Kim说:"通过提高人们的这种认识,我的愿望是促进科学界更多的关注、资助和合作,以探索益生菌在宠物健康中的广泛应用。"为了确定适合伴侣动物的候选益生菌,Kim 及其同事仔细研究了幼犬和老龄犬肠道微生物群组成的变化,发现老龄犬体内乳酸菌、双歧杆菌和肠球菌的数量有所下降。在这一洞察力的指导下,他们决定采用这些特定菌株。特定益生菌株的成功实验在实验阶段,他们将这些选定的菌株、粪肠球菌IDCC 2102 和乳双歧杆菌IDCC 4301 与高脂肪饮食一起喂给一组小猎犬。结果令人信服,证明了这些菌株在减少体内脂肪和纠正肥胖引起的肠道微生物菌群失衡方面的有效性。Kim说:"我们精心挑选的菌株在降低狗的体脂率方面取得了显著的成功。这些菌株的与众不同之处在于,它们不仅能限制饮食摄入或促进排泄以减轻体重,更重要的是,它们还能激活能量代谢。即使暴露于高热量饮食中,我们也观察到体重下降、皮下脂肪堆积减轻以及能量代谢增加。这证实了人体新陈代谢的方向已转向脂肪消耗,而不是脂肪堆积。"重要的是,由于脂肪堆积通常会导致全身炎症和激素代谢紊乱,这项研究揭示了值得注意的改善。在摄入选定菌株的小组中,研究人员观察到炎症水平降低,胰岛素分泌等基本代谢活动增强。此外,研究人员还成功地增加了共生细菌的比例,这些细菌通常驻留在人体内,起到抵御有害细菌和提高免疫力的作用。尤其令人鼓舞的是,这些变化并非转瞬即逝。相反,它们会在狗的体内持续存在,确保观察到的积极变化能够长期保持。这种持久的影响强调了将这些益生菌株纳入伴侣动物健康方案的潜在长期益处。随着饲养伴侣动物的人越来越多,人们对健康功能食品,尤其是针对宠物益生菌的认识也在不断提高。尽管人们对益生菌的兴趣与日俱增,但与针对人类的研究相比,针对所有伴侣动物(包括本研究中的狗类)的定制益生菌研究仍然明显不足。"虽然适合人类消费或商业牲畜的益生菌类型已经确定和确立,但伴侣动物缺乏标准化指南是一个明显的缺陷,"Kim 说。"我们的研究旨在解决这一不足,努力扩大适用于各种环境下宠物的益生菌范围。"编译来源:ScitechDaily ... PC版: 手机版:

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科学家揭示变暖世界中树木与真菌之间的隐秘斗争

科学家揭示变暖世界中树木与真菌之间的隐秘斗争 巴塔哥尼亚森林地面上的一种外生菌根蘑菇。图片来源:SPUN/Mateo Barrenengoa现在,科学家们发现,造成这种滞后的原因可能就在地下。今天(5 月 27 日)发表在《美国国家科学院院刊》(PNAS)上的一项研究表明,树木,尤其是遥远的北方地区的树木,可能正在迁移到没有真菌生命支持的土壤中。科西嘉岛上生长的一棵巨型松树,那里的气候变化影响极为严重。图片来源:SPUN/Quentin van den Bossche菌根真菌是一种生长在土壤中的丝状微小真菌,能与植物根系连接,为植物提供重要的养分以交换碳。北纬地区的大多数大型针叶树都与一种叫做外生菌根真菌的菌根真菌建立了关系。第一作者、地下网络保护协会(SPUN)真菌生态学家迈克尔-范-努兰德(Michael Van Nuland)说:"在研究这些共生关系的未来时,我们发现,树木与真菌之间35%的伙伴关系会受到气候变化的负面影响。"菌根蘑菇 Cortinarius spp.图片来源:SPUN/Mateo Barrenengoa作者发现,在北美,最容易受到这种气候错配影响的树木是松科的树木。特别值得关注的地区是物种分布区的边缘,那里的树木往往面临着最恶劣的条件。在这里,作者发现,在这些地方存活率较高的树木拥有更多样化的菌根真菌,这表明这些共生关系可能对帮助树木抵御气候变化的影响至关重要。"外生菌根真菌与气候的关系不同于外生菌根树木,"合著者、SPUN数据科学家克拉拉-秦(Clara Qin)说。"我们发现的证据表明,树木必须对这些差异做出回答。"意大利亚平宁山脉的外生菌根森林。SPUN/Seth Carnill这项研究揭示了气候变化可能对共生生物产生的影响。秦说:"虽然我们预计气候驱动的迁徙会受到非生物因素的限制,比如高纬度和高海拔地区的可用空间,但我们通常不会考虑生物因素的限制,比如共生伙伴的可用性。"Van Nuland 说:"我们必须继续努力了解气候变化如何影响菌根共生关系,这一点绝对至关重要。这些关系是地球上所有生命的基础我们必须了解并保护它们。这一行动呼吁强调了研究和保护这些基本生态互动关系的重要性。"编译来源:ScitechDaily ... PC版: 手机版:

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