DNA记录揭示:5900年前 丹麦境内的狩猎采集者曾被农耕族群从地图上抹去

DNA记录揭示:5900年前 丹麦境内的狩猎采集者曾被农耕族群从地图上抹去 新石器时代的 Porsmose 人,被两支带骨尖的箭射死。 新的证据表明,从狩猎采集者到最初的农民,权力的交接并不那么和平。 丹麦国家博物馆/隆德大学通过追踪 DNA 时间轴,研究人员发现,石器时代晚期,狩猎采集者已被迅速消灭,他们怀疑这是一场非常血腥、非常彻底的接管。隆德大学放射性碳测定实验室主任、地质学研究员安妮-比尔吉特-尼尔森(Anne Birgitte Nielsen)说:"这种转变以前被认为是平静的。然而,我们的研究表明情况恰恰相反。除了暴力死亡之外,来自牲畜的新病原体很可能导致许多采集者死亡。"然而,似乎有得必有失。大约 1000 年后,也就是 4850 年前,这些农耕族群遭遇了类似的命运,一个"大块头"的半游牧族群来到了这里,这个族群的起源与俄罗斯南部的雅姆纳亚人(Yamnaya)畜牧业息息相关。DNA证据再次表明,激烈的战斗和新病原体的引入导致了另一次迅速的基因动荡。新来的移民驯养动物、饲养牲畜,并用马车在这片土地上行走,他们在这一地区占了上风;在这一动荡时期之后,与亚姆纳亚人和东欧新石器时代的人一起定居在这一地区。今天,这些定居者的遗传特征在丹麦仍占主导地位,完全没有第一批农民或他们之前的狩猎采集者的痕迹。由于独特的 DNA 更替速度很快,而且缺乏混合基因,所有迹象都表明,激烈的冲突使现有的群落完全消亡。研究人员补充说,这些新信息颠覆了以往的理论,同时也揭示了病原体的迁移和移动。科学家们对古 DNA(aDNA)测序技术的进步寄予厚望,希望它能很快帮助人们更好地了解和治疗当今的疾病。尼尔森说:"我们的研究成果有助于增进我们对遗传的了解,以及对某些疾病发展的认识。从长远来看,这对医学研究等方面是有益的。"这项研究发表在《自然》杂志上。 ... PC版: 手机版:

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考古遗址上发现的榛子壳可以记录采集时的环境 揭示我们祖先生活的世界

考古遗址上发现的榛子壳可以记录采集时的环境 揭示我们祖先生活的世界 考古学家采集土壤中的花粉样本,以了解遗址植被的变化:这是作者分析榛子壳的辅助技术。图片来源:Nils Forshed考古学家研究古代遗址中榛子的碳同位素值,以了解当地树林的特征。《环境考古学前沿》(Frontiers in Environmental Archaeology)一文的第一作者、牛津大学的艾米-斯泰林(Amy Styring)博士说:"通过分析从瑞典南部考古遗址(从中石器时代的狩猎采集者营地到北欧最大、最丰富的铁器时代定居点之一)中发现的榛子中的碳,我们发现榛子是从逐渐开放的环境中收获的。"几千年来,北欧的人类一直将榛子树作为材料和食物的来源。对于在中石器时代和新石器时代遗址中采集数百枚榛子的人们来说,榛子是一种宝贵的资源。文章的资深作者、瑞典隆德大学的 Karl Ljung 博士说:"坚果是一种极好的能量和蛋白质来源,可以长期储存,整粒或磨碎后食用。果壳也可以用作燃料"。与所有植物一样,榛树也含有碳,碳以不同的形式存在,即同位素。不同碳同位素的比例受叶片细胞和周围环境中二氧化碳浓度比例的影响而改变。在榛树等植物中,这一比例受阳光和水分供应的影响很大;在瑞典等不缺水的地方,阳光对这一比例的影响更大。在争夺阳光的其他树木较少、光合作用率较高的地方,榛树的碳同位素值会更高。Ljung 解释说:"这意味着,在考古遗址上发现的榛子壳可以记录采集时的开放环境。这反过来又告诉我们更多关于当时人们觅食的栖息地的信息。"收集信息为了测试考古样本中是否存在这种影响,科学家们从瑞典南部三个地点不同光照度下生长的树木上采集了榛子,并分析了其碳同位素值的变化以及这些值与树木所处光照度之间的关系。然后,他们研究了同样在瑞典南部考古遗址中发现的榛子壳的碳同位素值。他们从四个中石器时代遗址和十一个从新石器时代到铁器时代的遗址中选择了贝壳碎片,其中一些遗址曾在不止一个时期被人占据。利用参考值和考古结果,考古学家建立了一个模型,将榛子样本归入三个类别之一:封闭、开放和半开放。由于单个榛子的碳同位素自然会与生长在类似环境中的其他榛子的碳同位素略有不同,因此科学家们使用了每个遗址的多个样本,并评估了生长在封闭或开放环境中的榛子的比例。增长变化科学家们发现,中石器时代的坚果是从较为封闭的环境中采集的,而近代的坚果则是在较为开阔的环境中采集的。到了铁器时代,为这项研究采集榛子样本的大多数人都是从开阔地而不是林地采集坚果的,他们的微生境已经完全改变,这与花粉分析得出的环境重建结果是一致的,但在花粉记录稀少的地方,同位素分析可以用来直观地描述当地环境。Styring说:"我们的研究为将环境变化与人类的觅食活动直接联系起来并重建他们所利用的微生境提供了新的可能性。我们希望直接对更多考古遗址和环境中的榛子壳进行放射性碳年代测定和碳同位素测量。这将更详细地了解过去的林地和景观,有助于考古学家更好地理解人类对环境的影响,或许还能帮助我们以不同的方式思考今天林地的使用和变化。"编译来源:ScitechDaily ... PC版: 手机版:

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越发展越致命:考古遗址中的DNA揭示了鸡病毒的进化飞跃

越发展越致命:考古遗址中的DNA揭示了鸡病毒的进化飞跃 由考古学家和生物学家组成的研究小组从过去1000年的考古鸡身上恢复并重建了古老的MDV序列。通过比较来自现代鸟类和古代鸟类的病毒基因组,他们确定了导致现代病毒毒力增强的基因改变。根据古老的基因序列,他们还能够利用细胞测定法复活古老的生物过程,证明古老的菌株比现代的菌株要温和得多。这一突破不仅揭示了 MDV 的进化史,而且有望开发出更有效的疗法来防治这种毁灭性的家禽疾病。这项新研究基于从欧洲和近东 140 个考古遗址中发掘出的鸡骨中分离出的 DNA。这些古老的基因组显示,MDV 在 1907 年首次被描述之前至少 1000 年就已在欧洲鸡群中广泛传播。这凸显了保存考古遗迹的重要性,尤其是考虑到它们能够揭示病毒性进化的宝贵信息。马雷克氏病病毒颗粒在受感染细胞核中复制的电子显微镜图像。图片来源:皮尔布莱特研究所生物成像小组最初描述这种疾病时,老鸡只出现轻微症状。随着 20 世纪 50 和 60 年代鸡肉消费量的急剧增加,MDV 不断演变,尽管已开发出多种疫苗,但其侵袭性却越来越强。第一作者 Steven Fiddaman 博士(牛津大学生物学系)说:"我们的发现不仅揭开了马雷克氏病病毒的进化史,还为加深我们目前对病原体毒力的理解奠定了基础。通过将古老的DNA技术与现代基因组学相结合,我们打开了一扇了解过去的窗口,可以指导未来管理病毒性疾病的策略。"这项研究的首席考古学家纳奥米-赛克斯教授(埃克塞特大学)说:"这项研究强调了保存在考古学和博物馆藏品中的生物材料的深远意义,因为我们无法预见对它们的研究在未来会有怎样的变革性应用。"该研究的共同第一作者劳伦特-弗朗茨教授(慕尼黑大学)说:"我们的工作彰显了跨学科合作的力量,将古遗传学家、病毒学家、考古学家和生物学家聚集在一起,揭开了一种对经济和农业具有重大影响的病原体的复杂进化史。"共同第一作者格雷格-拉森教授(牛津大学)评论说:"我们已经看到,减轻疾病往往会产生一种选择压力,从而增强病毒的毒性。通过对古老病毒基因组的测序,我们能够观察到这一过程的发生,这表明在过去的一个世纪中,MDV的毒力有了多么显著的提高。"共同第一作者阿德里安-史密斯教授(牛津大学生物学系)说:"古DNA为我们提供了一个独特的视角,让我们了解MDV作为一种致命的鸡病毒的出现,并可能为我们提供适用于控制其他具有医学和兽医学重要性的病毒感染的经验教训。"皮尔布莱特研究所荣誉科学家 Venugopal Nair 教授说:"这篇论文中关于毒力起源的发现,尤其是与古老的马立克氏病病毒基因序列相关的发现,将为探索这种病毒毒力增强的分子机制提供巨大的科学机遇,而这种病毒的毒力增强恰好与 20 世纪 60 年代以来家禽养殖业的强化相吻合"。编译来源:ScitechDaily ... PC版: 手机版:

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欧洲最早的农民在5000年前神秘消失 考古学家可能已经找到了原因

欧洲最早的农民在5000年前神秘消失 考古学家可能已经找到了原因 在 Frälsegården 通道墓穴中发现的完整骸骨之一(B/FRA043 号个体)。这是一具 30-40 岁女性的骸骨,与亲缘关系树中的个体仅有二级亲缘关系。根据她牙齿中的锶同位素,她出生在法尔比登沉积地质之外,可能是在瑞典西部的邻近地区。颅骨早些时候在发掘过程中被移走。资料来源:Karl-Göran Sjögren全球研究所的研究人员与瑞典哥德堡大学的研究人员合作,对 5000 年前死亡的 108 人的古牙齿和骨骼中的 DNA 进行了分析。从骨骼和牙齿中提取的古代DNA表明,鼠疫导致了石器时代人口的减少。新的研究对之前的假设提出了质疑,表明鼠疫对欧洲人口的影响远早于中世纪的大规模爆发。"分析表明,这些人中有 18 人(17%)在死亡时感染了鼠疫。此外,我们的研究结果表明,我们发现的最年轻的鼠疫菌株可能具有流行潜力,"领导 DNA 分析的博士后 Frederik Seersholm 说。右侧分支中两个第二代个体 FRA022 和 FRA023 的头骨,放置在覆盖着祖先个体 FRA021 的石灰石板旁边。图片来源:Karl-Göran Sjögren这意味着,当时的瘟疫可能是导致新石器时代末期人口崩溃(即新石器时代衰落)的一个因素。这次人口崩溃导致斯堪的纳维亚和西北欧的大部分农业人口在短短几个世纪内消失,距今已有 5000 年。"我们现在还不能证明事情就是这样发生的。但我们现在能够证明它可能是这样发生的,这一点意义重大。"Frederik Seersholm 说:"我们很早就知道种群数量下降的原因,但这一直是争论的焦点。"所分析的考古材料主要来自瑞典的通道墓,但其中一人来自丹麦 Stevns 的一个石棺。研究人员采用了一种名为"深度枪式测序"的方法进行分析,这种方法使研究人员能够从考古材料中提取非常详细的信息,即使古代DNA往往受到严重破坏或退化。研究人员检查了新石器时代的牙齿和骨骼材料中的 DNA,研究了这些个体的家族关系和疾病。"我们已经能够全面绘制鼠疫血统图,并在 DNA 数据中详细描述其他微生物。同时,通过这些分析,我们能够从广阔的视角到局部的视角甚至到个人层面来观察人类 DNA,从而了解当时存在的社会组织,"地球研究所的马丁-西科拉副教授说,他也是这项研究的幕后成员。在对其 DNA 进行分析后发现,17% 的人患有鼠疫,这表明在石器时代晚期,鼠疫在斯堪的纳维亚地区很常见。在其中一个被分析的家族中,在研究人员能够绘制的该家族六代人中,至少有三次鼠疫爆发。关于在巨石古墓中发现的骸骨和牙齿之间可能存在的亲属关系问题,至少已经争论了 200 年。哥德堡大学考古学副教授卡尔-戈兰-斯约格伦(Karl-Göran Sjögren)也参与了这项新研究。新的研究结果推翻了之前认为鼠疫不会导致人口减少的理论。"关于新石器时代末期的人口减少,有人认为与战争和包括鼠疫在内的传染病爆发有关。"Frederik Seersholm 说:"有几种涉及鼠疫的理论,其中一种认为鼠疫不可能引起流行病,但这种假设已不再成立。"编译自/ScitechDaily ... PC版: 手机版:

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类似梅毒的疾病在哥伦布抵达美洲之前就已广泛传播

类似梅毒的疾病在哥伦布抵达美洲之前就已广泛传播 巴西古代骸骨中梅毒的证据推翻了哥伦布将这种疾病传入欧洲的说法,表明类似梅毒的疾病早在 15 世纪之前就在全球范围内存在。上图为巴西朱比卡比拉二世遗址中的一具骸骨。图片来源:何塞-菲利皮尼博士发表在科学杂志《自然》上的这一新发现对之前有关西班牙征服者传播梅毒的理论提出了质疑。在COVID-19 大流行之前,传染病的出现和传播史就对全球健康具有重要意义,利用现代实验室方法,研究人员现在可以从史前发现的病原体中检测到最微量的DNA。这意味着他们可以追溯这些病原体在历史上的传播方式及其进化发展过程。由巴塞尔大学(前苏黎世大学)的维莱娜-舒内曼教授领导的一个国际研究小组与苏黎世联邦理工学院、维也纳大学和圣保罗大学合作,对 2000 年前死在巴西圣卡特琳娜沿海地区的四具史前遗骨进行了研究。在其中一些人的史前骸骨上发现了明显的病理变化,这可能表明死者患有类似梅毒的疾病。研究人员使用牙医的钻孔工具,在无菌条件下取出微小的骨骼样本。从这些样本中,他们分离出了属于梅毒病原体的史前遗传物质(古 DNA)。他们的研究发表在著名的科学杂志《自然》(Nature)上,研究结果表明,所有已经调查过的细菌基因组都可以归属于梅毒螺旋体特异株也就是导致梅毒的病原体。梅毒是性传播疾病家族中的标志性成员,若不及时医治会对机体产生极其严重的后果,对全球健康构成威胁。Schünemann 说:"我们的研究表明,大约 2000 年前,巴西的潮湿地区就已经出现了梅毒。这意味着,早在哥伦布抵达新大陆的 1000 多年前,人们就已经感染了地方性梅毒,可能是通过皮肤接触。"梅毒类疾病起源于哥伦布之前1492 年,克里斯托弗-哥伦布的水手和士兵返回旧大陆时,是否将通过性传播的梅毒从新大陆带到了旧大陆,这一问题至今仍在专家和医学史学家之间引起激烈争论。从 15 世纪末开始,梅毒迅速蔓延,尤其是在港口城市。巴塞尔大学博士后研究员、该研究的主要作者之一 Kerttu Majander 说:"事实上,这些发现代表的是一种地方性传播疾病,而不是性传播梅毒,这使得性传播梅毒的起源仍然悬而未决。不过,作者们认为,有很多证据表明,在哥伦布时代之前,梅毒已经在欧洲广泛传播。""我们在南美洲没有发现任何通过性传播的梅毒,因此哥伦布把梅毒带到欧洲的理论似乎更加不可能。事实上,她的研究小组早些时候在芬兰和波兰等地的发现表明,某些形式的梅毒在欧洲也已经存在。"重组可能推动了梅毒样疾病的发展许多细菌物种通过所谓的水平基因转移或重组,交换有利于进化的性状。将巴西骨骼中的史前 DNA 与今天的病原体进行比较后发现,确实发生了这种重组事件。通过 DNA 比对,还可以推断出梅毒螺旋体家族出现的时间。他们的研究表明,这些病原体出现于公元前12000年至公元前550年之间的某个时期。因此,这些病原体的历史要比之前推测的久远得多。"尽管梅毒的起源仍有想象的余地,但至少我们现在毫无疑问地知道,在欧洲人探索美洲大陆之前的几个世纪里,生活和死亡的美洲居民对梅毒螺旋体并不陌生,"Schünemann总结道。她和她的团队相信,史前 DNA 分析的进步也可能会带来梅毒起源的新发现。编译来源:ScitechDaily ... PC版: 手机版:

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生物学家探究远古时代的细菌性疾病 现时常见病是石器时代的致命威胁

生物学家探究远古时代的细菌性疾病 现时常见病是石器时代的致命威胁 一项研究显示,斯堪的纳维亚半岛的石器时代居民由于居住环境封闭和没有抗生素,经常患上细菌性疾病,如脑膜炎和食物中毒,甚至死亡。林雪平 Bergsgraven 的石器时代遗迹。资料来源:Östergötland 博物馆书中描述了不同类型的微生物,既有健康人应该感染的微生物,也有一定会造成痛苦和问题的微生物:脑膜炎奈瑟氏菌会通过人与人之间的密切接触传播,例如接吻时;耶尔森氏菌(Yersinia entrecolitica)通常会从受污染的食物和水中感染;而沙门氏菌(Salmonella enterica)则是当今食物中毒的常见原因。"特别是肠炎沙门氏菌的案例向我们展示了应对它的难度。"斯德哥尔摩大学动物学系的 Nora Bergfeldt 说:"在林雪平的 Bergsgraven 战斧文化墓葬中,我们发现了两个受感染的个体,实际上我们有可能正在目睹他们的死因。"今天,我们在这些个体中发现的这种细菌性疾病和其他细菌性疾病很容易用抗生素治疗,但在当时,它们可能是致命的"。在这项研究中,对来自农民和狩猎采集者的 38 个个体进行了微生物筛查。调查的材料来自挪威南部的 Hummerviksholmen(距今 9500 年)和瑞典林雪平的 Bergsgraven(距今 4500 年)。细菌等微生物和一些病毒的遗传物质都是由DNA 组织的,就像我们人类一样。这就是为什么在受感染人类的遗骸中可以发现这种微生物 DNA 的原因。科学家们正是利用这种微生物 DNA 追溯斯堪的纳维亚石器时代的细菌性疾病。从狩猎采集到农耕生活方式的转变尤其令人感兴趣,因为这可能反映在细菌性疾病上。乌普萨拉大学人类进化项目的海伦娜-马尔姆斯特伦(Helena Malmström)说:"我们知道斯堪的纳维亚半岛的人们是什么时候开始转向农耕的,但我们仍然不知道这种生活方式的改变是如何影响人们的总体健康的。她的研究主要集中在石器时代生活方式的转变上。""人们交往越多,相互感染的可能性就越大。但是,即使我们确实遇到了像鼠疫耶尔森菌这样有可能影响社会的细菌,在这项研究中,通过食物传播的感染在各种生活方式中最为突出,"这项研究项目的负责人安德斯-戈瑟斯特伦(Anders Götherström)说。他看到了研究领域的潜力:"对我们来说,能够开始研究史前社会的一部分是令人惊奇的,而到目前为止,我们还不可能对这部分进行研究"。编译自:ScitechDaily ... PC版: 手机版:

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古代牙齿样本揭示了早期人类的饮食选择

古代牙齿样本揭示了早期人类的饮食选择 来自摩洛哥塔福拉特洞穴的人类牙齿,显示出严重的磨损和龋齿。图片来源:© Heiko Temming研究人员采用全面的多同位素方法,包括牙釉质中的锌和锶同位素分析,胶原蛋白中的碳、氮和硫分析,以及人类和动物遗骸的氨基酸分析,揭示了古代饮食习惯的惊人奥秘。该研究的主要结论清楚地表明,这些狩猎采集者的饮食中包含了相当大比例的地中海物种植物,这比该地区农业的出现要早几千年。在遗址中发现的考古植物遗骸,如橡子、松子和野生豆类,进一步证实了这一观点。此外,该研究还表明,植物性食物也被引入婴儿饮食,并可能成为这一人群的断奶食品。这一发现具有重要意义,因为它表明,与以前认为的狩猎采集社会规范相比,农业社会前期的断奶习俗可能更早。这挑战了前农业时代人类饮食主要以动物蛋白为主的普遍观念,并提出了全新世初期北非缺乏农业发展的问题。该研究的第一作者 Zineb Moubtahij 解释说:"我们的研究结果不仅让我们了解了前农业人类群体的饮食习惯,还凸显了不同地区人类生存策略的复杂性。了解这些模式对于揭示更广泛的人类进化故事至关重要。"此外,这项研究还首次利用保存在珐琅质中的锌同位素来确定非洲古人类的饮食习惯。北非是研究人类进化和现代人类扩散的关键地区。有了这样一种工具,我们就能进一步探索该地区人类饮食的深层时间,这将为我们了解人类的饮食模式和在不同环境中的适应性提供宝贵的资料。展望未来,研究小组希望探索北非更多的旧石器时代遗址,并利用创新技术更深入地了解古代饮食习惯及其对人类进化的影响。编译来源:ScitechDaily ... PC版: 手机版:

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