现代人类与尼安德特人杂交增加了其遗传多样性

现代人类与尼安德特人杂交增加了其遗传多样性 大约 6 万年前,现代人类进入欧洲遇到了尼安德特人,通过与尼安德特人杂交而继承了其部分 DNA。而在人类的历史长河里,这种杂交和 DNA 继承是双向的,现代人类曾经多次走出非洲,多次与尼安德特人有过杂交,而尼安德特人也因此继承了部分现代人类的 DNA。虽然在最后一次交流中他们被压倒性的现代人类席卷而过,最终灭绝。根据发表在《科学》期刊上的一项研究,距今 12 万年的西伯利亚 Altai 地区尼安德特人基因组中发现了现代人类的 DNA,这一时间远早于 6 万前的走出非洲事件。研究人员提出,现代人类在 20 万年前曾走出非洲,与西伯利亚的尼安德特人相遇。研究指出,当时的尼安德特人规模较少,遗传多样性很低,现代人类的 DNA 增加了其遗传多样性。 via Solidot

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现代人从尼安德特人那里继承的基因被发现越来越多 自闭症也是其中之一

现代人从尼安德特人那里继承的基因被发现越来越多 自闭症也是其中之一 分别位于南卡罗来纳州和新奥尔良的克莱姆森大学和洛约拉大学的研究人员进行了一项新研究,考察了现代人从尼安德特人那里继承的遗传特征,并首次发现了与自闭症的关联。克莱姆森大学遗传学和生物化学系教授亚历克斯-费尔特斯(Alex Feltus)说:"据我所知,这是第一个真正表明尼安德特人的DNA与自闭症有关的证据。"尼安德特人(Homo neanderthalensis)是一个独特的物种,并不是现代人(Homo sapiens)的直接祖先。然而,基因组分析表明,他们之间存在杂交,尽管规模有限。在欧亚人群中发现的尼安德特人 DNA 比例较小,这表明这两个物种在现代人离开非洲之后,但在他们扩散到亚洲和欧洲之前就已经繁衍了。以前的研究发现,这种遗传遗产与神经、精神、免疫系统和皮肤疾病有关。在本项研究中,研究人员从公开数据库中获取数据,研究自闭症患者及其未受影响的兄弟姐妹与种族匹配的对照组相比,是否富含尼安德特人的DNA。他们研究了单核苷酸多态性或SNPs(读作"snips"),这是人与人之间最常见的基因变异类型。每个 SNP 代表一个 DNA 构建块(称为核苷酸)的差异。当 SNP 出现在基因内或基因附近的调控区域时,它们可能会影响基因的功能,从而在疾病中发挥作用。研究人员在分析中发现了25个与大脑发育有关的SNP,这些SNP在自闭症患者中明显富集即代表性过高。不过,研究人员说,这些源自尼安德特人的变异并不总是会导致自闭症。相反,这与自闭症的易感性有关。"假设并不是'尼安德特人给了我们自闭症'"。费尔特斯说。"而是尼安德特人给了我们一些基因调整,使我们更容易患上自闭症。自闭症是一种复杂的性状。它由很多很多基因控制。我们实验室的一大工作就是试图了解其复杂程度。在人类基因组的 6 万个基因中,当你患上自闭症、癌症或其他复杂性状时,有多少个基因在起作用?我们接受复杂性。我们不试图抹杀复杂性。"研究人员希望,他们的研究将有助于进一步研究尼安德特人的古老基因对现代大脑发育、智力和整体人类健康的持续影响,包括进一步了解自闭症的复杂性。这项研究发表在《自然》杂志的《分子精神病学》上。 ... PC版: 手机版:

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4.7万年前智人和尼安德特人疯狂杂交 科学家却发现Y染色体有点不对

4.7万年前智人和尼安德特人疯狂杂交 科学家却发现Y染色体有点不对 只有一条染色体除外,那就是Y染色体,尼安德特人的Y染色体在现代智人中完全找不到。那么,有趣的问题是,尼安德特人的 Y 染色体到底怎么了?尼安德特人的基因组大约76.5万至55万年前,尼安德特人和现代智人祖先在非洲各奔东西。当时,尼安德特人迁徙到欧洲,而现代智人的祖先则留在了原地。在13万到11万年前,现代智人的祖先第一次走出非洲,但这次迁徙以失败告终,并最终在近东地区逐渐消失。直到5 万至4万年前,现代智人再次迁徙到欧洲和亚洲。现代智人的重大转变被认为发生在7万年前前后变得有别于其它人属物种,所以这次迁徙直接让尼安德特人消失在了历史舞台。得益于保存完好的欧洲和亚洲尼安德特人骨骼和牙齿的DNA,科学家已经恢复了完整的男性和女性尼安德特人的基因组副本。不出所料,尼安德特人的基因组与我们非常相似,他们同样包含约20000多个基因,捆绑在23条染色体上。另一方面,他们也有22对常染色体两个副本分别来自父母,还有一对性染色体,女性拥有两条X染色体,而男性则拥有一条X染色体和一条Y染色体。科学家有许多方法在智人的基因组中寻标记到尼安德特人的DNA序列片段,所以我们现在知道,除起源于非洲的人类谱系外,现在所有人的体内都包含有尼安德特人的基因。其中,欧洲起源的人类谱系的基因组中包含了2%的尼安德特人基因系列,而亚洲和印度的谱系比例还会更高一点。不过,尼安德特人的基因似乎正在被我们逐渐剔除,因为已知一些古代智人基因组中含有的尼安德特人 DNA 序列更多,有些达到6%左右。也正因为我们知道什么基因来自尼安德特人,所以我们知道哪些特征是尼安德特人带给我们的。其中包括红头发等外表特征,还有关节炎、狼疮等疾病都与尼安德特人的基因有关,当然他们的基因也带给了我们对许多疾病的抵抗力。但是,所有这些基因都与Y染色体无关,目前没有发现现代智人携带尼安德特人Y染色体的任何部分。Y染色体很难测序,因为它含有大量重复的“垃圾DNA”,因此尼安德特人的Y染色体基因组仅进行了部分测序。科学家在已测序的尼安德特人Y染色体上发现了现代智人Y 染色体中几种相同基因的样本,但没有在现代智人的Y染色体上发现尼安德特人的部分。值得一提的是,在现代人类中,一个名为SRY的Y染色体基因启动了男性的发育,SRY基因在所有猿类中都发挥着这一作用,或许也包括尼安德特人,但目前还没有发现尼安德特人的SRY基因。尼安德特人的 Y 染色体怎么了?其实,有许多原因都会导致尼安德特人的Y染色体在今天不出现在现代智人身体中。有人认为,尼安德特人的Y 染色体从未出现在跨物种杂交中,因为只有现代智人的男性爱上(或者其它暴力手段)尼安德特女性,而没有尼安德特人男性爱上现代智人女性。不过,这个想法很难与现代人类中没有尼安德特人线粒体DNA的痕迹(仅限于女性系)的发现相协调。也有人认为,由于尼安德特人种群数量非常少,所以拥有有害基因积累的可能性非常高,所以尼安德特人的 Y 染色体在工作方面不如其竞争对手智人那么出色。由于那些带有特别有用的基因的 Y 染色体(比如产生更多、更好或更快的精子)会迅速取代群体中的其他 Y 染色体,所以随着时间推移,尼安德特人的Y染色体基因组在现代智人中完全消失。另外,考虑到人类的 Y 染色体总体上正在退化,所以也可能尼安德特人的 Y 染色体中 SRY 基因已经丢失,他们靠其它方式决定性别,所以他们的Y染色体远没有现代智人的有用,也就逐渐就消失了。还有一种最有可能的原因,就是尼安德特人的Y染色体无法与现代人类其他染色体上的基因一起工作,导致带有Y染色体的混血不育。狮虎兽在物种杂交中,如果有一方不育、罕见或不健康,那么它基本都是具有不同性染色体的那一方。这个被称为霍尔登法则,比如在哺乳动物中,雄性拥有XY染色体,那么雄性杂交后代不健康或不育的比例就更高;而在鸟类中,雄性有ZZ染色体,雌性有ZW染色体,所以它们是雌性杂交后代不健康或不育的比例就更高。霍尔登法则的具体原因还不是很明确,但是它确实普遍影响生物,例如你可能知道狮子和老虎杂交的狮虎兽,它们雌性有生育能力,但雄性都不育,就是这种情况。携带尼安德特人Y染色体的混血不生儿子或者根本就不生孩子,那么Y染色体自然就会消失了。尼安德特人到底如何灭绝的?你会发现,无论出于哪种原因,碰到现代智人并与之杂交后,尼安德特人自己的繁育肯定出了巨大的问题。他们要么因为可生育人口减少了被现代智人占有,要么因为混血不育或者有害基因的存在被淘汰,总之碰到现代智人之后,他们种群肯定是萎缩了,这对于本身就人丁凋落的他们来说是雪上加霜。每个人都想知道尼安德特人是如何灭绝的,其实现在有一个认可度较高的原因,那就是他们真的生育出现了问题。尼安德特人和现代智人在欧洲共同生活了4000-10000年,2019年一项研究指出,这个重叠的时间要远长于现代智人通过战争或流行病等方式灭绝尼安德特人所需的时间。这项研究还指出,只要生育率略有下降,那么随着时间推移,这种积累就会成为他们最终走向灭绝的重要因素。其实,不仅现代智人通过这种“基因污染”的方式让尼安德特人最终灭亡,现在许多强势的入侵物种也都是这么做的。我们知道入侵物种通常会和本土相同生态位上的物种存在资源的竞争,这通常被认为是本土物种灭绝的主要原因。其实,对于许多物种来说,基因污染也是相当关键,甚至可能就是摧毁一个物种的最后一根稻草。报道原文: ... PC版: 手机版:

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《现代人小丛书(套装共4册)》

《现代人小丛书(套装共4册)》 深入剖析现代生活困境,提供思想解药,激发对自我与社会的重新思考。 #思想启蒙 #现代人小丛书 #人文社科 2025-07-12 03:24:14 https://pan.quark.cn/s/b11b7fe5b5d2

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继承自尼安德特的基因与自闭症相关

继承自尼安德特的基因与自闭症相关 现代人类在其演化过程中与尼安德特人可能有过多次交往,继承的来自尼安德特人的基因影响了我们对抗疾病的方式甚至外表。一项新研究显示,部分继承自尼安德特的基因与自闭症相关。研究人员分析了 3442 人的 DNA,其中包括自闭症患者和非自闭症患者,结果显示尼安德特 DNA 在自闭症患者中更为常见,这一关联性在非西裔黑人、西裔白人和非西裔白人中都存在。 via Solidot

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尼安德特人的骨骼中隐藏着已知最古老的人类病毒

尼安德特人的骨骼中隐藏着已知最古老的人类病毒 布里奥内斯和他的同事分析了在俄罗斯 Chagyrskaya 洞穴中发现的两具男性尼安德特人骨骼中的 DNA。他们发现了导致现代人感冒症状的腺病毒、可导致唇疱疹的疱疹病毒以及可导致生殖器疣和癌症的性传播乳头瘤病毒的残留物。它们是迄今发现的最古老的人类病毒,超过了在西伯利亚东北部发现的智人牙齿中发现的距今 3.1 万年的病毒。布里奥内斯说,通过将基因序列与现代病毒进行比较,研究小组排除了病毒来自处理过遗骸的当代人类或以遗骸为食的捕食者的可能性。他说:"综合来看,我们的数据表明,这些病毒可能代表了真正感染尼安德特人的病毒。"一些研究人员推测,病毒可能是尼安德特人灭绝的原因之一。研究小组的结果增加了这种可能性的分量,但无法证实。要支持他们提出的具有启发性的有趣假设,就必须证明至少可以在尼安德特人的遗骸中发现这些病毒的基因组,这就是团队目前所做的。一个尼安德特人可能感染三种病毒的事实并不令人惊讶,因为今天的人类在一生中平均要感染大约 10 种不同的病毒。澳大利亚昆士兰科技大学的莎莉-瓦塞夫(Sally Wasef)说,这项研究表明,很有可能进一步发现过去可能影响解剖学上的现代人和我们已经灭绝的人类近亲的疾病。对古病毒的研究仍然是一个需要更多探索的新领域。目前用于鉴定人类远古DNA结果的工具可能不适用于病毒,因为病毒的DNA链默认较短。瓦塞夫介绍说,布里奥内斯的目标是重现古代病毒,这将是一个挑战:"我对能否实现这一目标持怀疑态度,因为我们还不完全了解病毒的DNA是如何受损的,以及如何将复原的DNA片段重建为完整的病毒基因组。此外,宿主与病毒之间的相互作用,尤其是在完全不同的环境中,也是需要考虑的问题。"参考资料 bioRxiv DOI: 10.1101/2023.03.16.532919 ... PC版: 手机版:

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来自远古的DNA可以帮助了解关于“我们是谁”的信息

来自远古的DNA可以帮助了解关于“我们是谁”的信息 中国科学院古脊椎动物与古人类研究所(IVPP)的傅巧梅和安德鲁-贝内特(E. Andrew Bennett)在《细胞》杂志创刊50周年纪念特刊上撰写评论文章,探讨了古基因组学对我们理解现代人类进化的贡献。鉴于她通过分析古人类和早期现代人基因组在人类进化领域做出的众多贡献,《细胞》杂志邀请傅教授撰写评论文章,回顾我们从古DNA中了解到的现代人身份进化的情况。这篇名为《古代基因组与现代人类的进化之路》的文章发表于2024年2月29日。探寻人类起源人类起源的故事在世界各地的信仰体系中扮演着核心角色,这证明了人类对自身起源之谜的持久迷恋。考古学和古人类学的发现有助于描述现代人类的最早形态,以及人类有别于其他生物的最初行为。20 多年前,第一个人类基因组的测序将比较基因组学的力量带到了有关人类与类人猿差异的问题上。但是,现代人类与黑猩猩我们在世的近亲相距大约 600 万年的进化过程,使得这种方法无法用于时间上更接近现代人类特征出现的研究。同样,"千人基因组计划"让我们得以了解现代人基因多样性的广度,但混杂现象和对史前人群基因结构的不完全了解,限制了我们仅利用现代基因组对更深层次事件的探索。最近获得的早期现代人基因组数据以及尼安德特人和丹尼索瓦人的古基因组数据,为我们提供了更好地追踪现代人起源的基因变化的手段。现代人类史前史中提高了整体人口适应性的事件,反过来又支持了全球现代人类人口的进一步生存和扩张。资料来源:IVPP在评论中,作者回顾了我们目前基于古人类学和考古学领域对现代人类形态和行为进化的理解。随后,他们总结了古基因组学对我们理解"作为人类"的贡献。傅巧梅和贝内特决定将这些贡献分为两种不同的方法:一种是直接方法,即试图根据现代人和古人类基因组序列的直接比较来确定现代人特有的基因变化;另一种是更间接的方法,即研究人员试图根据古代 DNA 来重建古人类和早期现代人的生活史。他们的文章指出,这两种研究方法都有能力探索新出现的现代人类种群的不同方面;然而,每种方法都有其特定的一系列复杂问题需要克服。从理论上讲,基于序列的方法可以确定所有现代人所共有的、区别于尼安德特人和丹尼索瓦人的基因变化,但由于我们对古人类和早期现代人种群的基因多样性了解不全面,这种方法的实用性目前受到了限制。例如,对非洲不同地区的现代基因组进行的扩大测序发现,以前只在古人类基因组中发现的一些等位基因也存在于现代人群中。人口研究与遗传多样性与此相反,间接方法试图破译古代基因组中留下的信号,这些信号可以帮助我们更好地了解过去的行为和种群特征,如种群规模、家庭结构和交配方式,以及对不断变化的气候、当地病原体和生活方式创新的适应。这些用以前的方法无法获得的细节为我们了解人类起源增添了新的维度。作者回顾了几项研究,得出结论认为,尽管目前可用的数据很少,但早期现代人与古人类之间的一些差异已经显现出来。虽然早期现代人和尼安德特人似乎都实行女性外婚制,即从亲缘关系较近的群体之外选择女性配偶,但早期现代人似乎比他们的古人类保持了更大的遗传多样性,他们的直系祖先之间的亲缘关系更远。虽然还没有找到单一的遗传原因来解释为什么现代人种群扩大,而古人种群收缩和消失,但傅和贝内特讨论了属于一个更大、联系更紧密的种群网络如何会产生几种个体健康优势。这些种群层面的优势在种群生物学中被称为"阿利效应"(Allee effects),可以提高资源开发、防御和配偶选择等活动的成功率,可能足以解释早期现代人和古人类种群的不同结果。评论还指出,尽管取得了这一成功,但许多基因组多样性也在这一过程中消失了,古代 DNA 研究发现了过去几个不同的现代人类种群,但这些种群在今天的人类中没有留下任何后裔。古代基因数据还有助于描述人类适应当地环境的起源,例如在上一个冰河时期出现在东亚北部的 EDAR 变异,或者可能是从丹尼索瓦人那里引入的 EPAS1 等位基因,它有助于在高海拔地区生存。类似的适应当地饮食和病原体的情况也有记载,还有适应新创新的情况,如牛驯化后乳糖酶的持续存在。现代人类离开非洲后,其流动性和适应性不断增强,这确保了仍有许多古老的基因组数据有待发现和研究。通过将古 DNA 的最新发现与古人类学和考古学的最新发现结合起来,傅巧梅和贝内特的评论拓展并更新了对人类起源的讨论。编译自//scitechdaily ... PC版: 手机版:

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