早前分析华南海鲜市场样本测序数据,进而反对中疾控“市场病毒人源说”的学者3月20日将有关成果以预印本形式发表。

早前分析华南海鲜市场样本测序数据,进而反对中疾控“市场病毒人源说”的学者3月20日将有关成果以预印本形式发表。 文前序言介绍:作者们今年3月4日在GISAID上发现新出现这批数据,3月9日细看后发现正是中疾控2022年2月论文采用的市场环境样本的宏基因组原始数据的一部分,上传日期标注为2022年6月2日,遂与高福等文章原作者联系,获答复说你可另行作独立研究。3月10日作者告知中方分析发现动物基因材料。3月11日作者发现数据已从GISAID上撤下;当日向世卫汇报了初步发现。3月13日GISAID秘书处函告多位作者,指其可能违反使用条款。 文章申明,尊重中疾控作为原始作者首发文章的权利,自己无意将分析成果向期刊提交发表;中疾控已向世卫汇报进展、并修订文章提交评议,并表示将分享原始数据以资评议,但目前未见行动,为促进透明合作决定先公布己方结论。文章批评GISAID将此等重要数据雪藏八个月之久,实在有辱使命。 GISAID回应此事说,数据是被上传方设置为不可见。 同日,美国国会要求解密DNI更新版新冠溯源评估报告的决议已由总统签署生效。 (路透社,预印本)

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中疾控3月9日向GISAID上传了2020年1月武汉华南海鲜市场采检动物拭子和环境样本的原始数据,但很快又撤下。研究者取得该数据作分析指,应考虑市场中有貉感染新冠病毒的可能性。 中疾控曾在2022年2月发表对上述1380件样本的分析(预印本)指检出病毒阳性与检出人类基因组的统计关联高于与其他动物(如附图)故认为病毒是人患带入市场。 在数据上传至GISAID后,研究者Kristian Andersen、Edward Holmes、Michael Worobey分析指出,市场29号档口的推车、除羽机等阳性环境样本中有高载量的貉基因组,有些比人基因组还高;鉴于华南市场采检拭子的动物并不包括貉,因此虽然动物拭子全部未能检出病毒阳性,但仍应考虑貉感染病毒的可能。 研究者已在3月14日的世卫SAGO新冠溯源组会上汇报有关情况,去年中疾控预印本研究的作者也有出席。会后,中疾控方面已修订文章提交期刊评议。 在此之前,美国众议院3月10日决议要求DNI在90天内解密《华尔街日报》2月底披露的更新版新冠溯源情报评估报告,决议待总统拜登签署生效。 (The Atlantic,Axios)

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中疾控4月5日公布2020年1月华南海鲜市场环境样本的宏基因组原始数据,并在Nature发表经评议的分析文章。中疾控曾在去年2月公布预印本,但当时未提供较细致的宏基因组分析结果,也未公布原始数据。 文章指出,多数新冠阳性的环境样本中,人属(Homo)的基因痕迹最重;部分样本中能检出其他哺乳动物痕迹,如貉(Nyctereutes)猬(Atelerix、Erinaceus),但阴性样本中这些动物更多见,不足以推定该处这些动物有感染新冠病毒,更无法证明传播方向是由动物到人。 文章对宏基因组的分析采取基因组(图中)和线粒体两种匹配方式,匹配出的丰度分布有时分歧巨大;阳性环境样本中甚至匹配出少量大熊猫属(Ailuropoda)的基因。 有学者受访说,市场的环境样本采集于2020年1月1日,“全部阴性”的动物拭子样本更是1月下旬以后,因此对于直接确定武汉疫情起点的价值有限。有学者受访说,对环境样本DNA可进一步研究,看其中是否有动物呈现免疫激活状态的迹象。 中国国新办4月8日就本文开发布会。中疾控主任沈洪兵介绍,早前GISAID撤下的数据原本是用于该文在Nature的审稿评议,但被平台方误操作公开,中方3月11日致电后随即撤下。文章发表后数据已恢复公开。他又“奉劝世卫有关人士回归科学和公正的立场,不要主动或被迫成为个别国家把溯源政治化的工具”。 (Nature,国新办)

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