【豆瓣8.6 科普】《基因组-人类自传》本书通过在每一对染色体上选择一个新近发现的基因并讲述其故事,马特·里德利叙述了我们这个物

【豆瓣8.6 科普】《基因组-人类自传》本书通过在每一对染色体上选择一个新近发现的基因并讲述其故事,马特·里德利叙述了我们这个物种及祖先从生命出现之初到未来医学边缘的历程。他探讨了由于基因组的图谱绘制而出现的科学、哲学等问题。

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巨猿研究揭示 Y 染色体比 X 染色体进化更快

巨猿研究揭示 Y 染色体比 X 染色体进化更快 猿类性染色体研究来自宾夕法尼亚州立大学、美国国家人类基因组研究所和华盛顿大学的一个国际研究小组为五个类人猿物种和一个较小类人猿物种的性染色体制作了完整的"端对端"参考基因组。他们的研究揭示了雄性特异性 Y 染色体的快速进化变化。这些发现加深了我们对性染色体进化的理解,有助于我们了解影响类人猿和人类的遗传疾病。类人猿中 Y 和 X 染色体的重要性"Y染色体对人类的生育能力非常重要,而X染色体则蕴藏着对生殖、认知和免疫至关重要的基因,"宾夕法尼亚州立大学生命科学维恩-威拉曼讲座教授、生物学教授兼研究小组组长卡捷琳娜-马科娃(Kateryna Makova)说。"我们的研究为今后研究性染色体、它们如何进化以及与之相关的疾病打开了大门。我们研究的非人类巨猿物种都濒临灭绝。获得它们完整的性染色体序列将有助于研究它们在野外的性别特异性散布及其对繁殖和生育的重要基因"。宾夕法尼亚州立大学和美国国家人类基因组研究所的研究人员领导的一项国际合作新生成了六个灵长类物种的性染色体的完整基因组,揭示了类人猿Y染色体的快速进化。这些结果可以为保护这些濒危物种提供信息,并揭示人类和我们近亲中与性有关的遗传疾病。图片来源:设计:鲍勃-哈里斯;摄影:圣地亚哥动物园和塔尔萨动物园从 Y 染色体变异性看进化的启示这种参考基因组是一个具有代表性的例子,有助于今后对这些物种的研究。研究小组发现,与 X 染色体相比,Y 染色体在不同猿类物种之间的差异很大,而且含有许多物种特有的序列。然而,它仍然受到纯化自然选择的影响这种进化力量通过清除有害突变来保护其遗传信息。这项新研究最近发表在《自然》杂志上。基因组测序的技术进步马科瓦说:"2001年,研究人员对人类基因组进行了测序,但实际上并不完整。当时可用的技术意味着某些空白没有被填补,直到2022-23年由端粒到端粒(Telomere-to-Telomere,简称T2T)联盟领导的一项新的努力。我们利用人类T2T联盟开发的实验和计算方法,确定了我们在世近亲类人猿性染色体的完整序列。"类人猿的比较基因组学研究小组为五种类人猿黑猩猩、倭黑猩猩、大猩猩、婆罗洲猩猩和苏门答腊猩猩以及一种较小的类人猿暹罗猿制作了完整的性染色体序列。他们为每个物种的一个个体生成了序列。生成的参考基因组可作为基因和其他染色体区域的图谱,帮助研究人员对该物种其他个体的基因组进行测序和组装。这些物种以前的性染色体序列不完整,或者婆罗洲猩猩和暹罗猩猩的性染色体序列不存在。该研究的共同第一作者、宾夕法尼亚州立大学博士后研究员 Karol Pál 说:"Y 染色体的测序一直是个挑战,因为它包含许多重复性区域,而且由于传统的短线程测序技术是在短时间内对序列进行解码,因此很难将得到的片段按照正确的顺序排列。T2T方法使用长读数测序技术,克服了这一难题。我们与美国国家卫生与遗传研究所(NHGRI)的亚当-菲利皮(Adam Phillippy)研究小组合作,结合计算分析的进步,使我们能够完全解决以前难以测序和组装的重复区域。通过比较 X 染色体和 Y 染色体之间以及不同物种之间的差异,包括与之前生成的人类 X 染色体和 Y 染色体的 T2T 序列的差异,我们了解到了有关它们进化的许多新情况。"Y 染色体的高变异性宾夕法尼亚州立大学医学基因组学中心主任马科瓦说:"性染色体开始时与其他任何一对染色体一样,但 Y 染色体由于在其大部分长度上不与其他染色体交换遗传信息,因此在积累许多缺失、其他突变和重复元素方面一直独树一帜。"因此,研究小组发现,在六个猿类物种中,Y 染色体在包括大小在内的各种特征上的变化要比 X 染色体大得多。在所研究的猿类中,X 染色体的大小从黑猩猩和人类的 1.54 亿个 ACTG 字母(代表组成DNA的核苷酸)到大猩猩的 1.78 亿个字母不等。相比之下,Y染色体的大小从暹罗猩猩的3000万个DNA字母到苏门答腊猩猩的6800万个字母不等。例如,人类和黑猩猩之间约有 98% 的 X 染色体是一致的,但它们之间只有约三分之一的 Y 染色体是一致的。研究人员发现,部分原因是 Y 染色体更有可能被重新排列或部分遗传物质被复制。此外,在 Y 染色体上,重复序列所占染色体的百分比变化很大。根据物种的不同,重复元素占 X 染色体的 62% 到 66%,而占 Y 染色体的 71% 到 85%。与人类基因组中的其他染色体相比,X 和 Y 染色体上的这些百分比都更高。Y 染色体生存策略马科瓦说:"我们发现猿猴的Y染色体正在缩小,积累了许多突变和重复,并丢失了基因。那么,为什么Y染色体没有像以前的一些假说所说的那样消失呢?我们与坦普尔大学的谢尔盖-科萨科夫斯基-庞德等人合作发现,Y染色体上仍有许多基因在净化选择一种保持基因序列完整的自然选择下进化。其中许多基因对精子发生非常重要。这意味着 Y 染色体不可能很快消失。"研究人员发现,Y 染色体上的许多基因似乎采用了两种生存策略。第一种是利用基因冗余染色体上存在同一基因的多个拷贝这样基因的完整拷贝就能补偿可能发生突变的拷贝。研究小组首次完成了猿类性染色体上多拷贝基因家族的图谱,从而量化了这种基因冗余。第二种生存策略是利用回文,即 DNA 字母表中的字母序列后跟有相同但倒置的序列,例如 ACTG-GTCA。当基因位于回文染色体内时,就能从回文染色体纠正突变的能力中获益。帕尔说:"我们发现,Y染色体可以在两个回文染色体臂的重复序列之间与自身交换遗传信息。当同一基因的两个拷贝位于回文染色体内,其中一个拷贝发生突变时,可以通过与另一个拷贝进行基因交换来挽救突变。这可以弥补Y染色体与其他染色体遗传信息交换的不足。"研究小组还首次获得了猿类性染色体上回文染色体的完整序列,因为以前很难对它们进行测序和研究。他们发现,猿猴 Y 染色体上的回文染色体特别多而且特别长,但它们通常只在近亲物种之间共享。猿类基因组研究的进展研究人员还与约翰-霍普金斯大学的迈克尔-沙茨及其团队合作,对 129 只大猩猩和黑猩猩的性染色体进行了研究,以更好地了解每个物种内部的遗传变异,并寻找自然选择和其他进化力量作用于它们的证据。宾夕法尼亚州立大学生物学助理教授、论文作者之一 Zachary Szpiech 说:"通过将大猩猩和黑猩猩的性染色体测序读数与我们的新参考序列进行比对,我们从之前研究过的大猩猩和黑猩猩个体中获得了大量新信息。虽然未来增加样本量将非常有助于提高我们检测不同进化力量特征的能力,但在与濒危物种合作时,这在伦理和后勤方面都可能具有挑战性,因此我们能最大限度地利用现有数据是至关重要的。"研究人员探索了能够解释大猩猩内部和黑猩猩内部 Y 染色体变异的各种因素,这一分析揭示了 Y 染色体上净化选择的额外特征。对未来研究和保护工作的影响宾夕法尼亚州立大学生物学助理教授克里斯蒂安-胡贝尔(Christian Huber)是这篇论文的作者之一,他说:"我们将生物信息学技术和进化分析有力地结合在一起,使我们能够更好地解释我们的近亲类人猿性染色体的进化过程。"此外,我们制作的参考基因组将有助于未来对灵长类进化和人类疾病的研究。"编译来源:ScitechDaily ... PC版: 手机版:

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4.7万年前智人和尼安德特人疯狂杂交 科学家却发现Y染色体有点不对

4.7万年前智人和尼安德特人疯狂杂交 科学家却发现Y染色体有点不对 只有一条染色体除外,那就是Y染色体,尼安德特人的Y染色体在现代智人中完全找不到。那么,有趣的问题是,尼安德特人的 Y 染色体到底怎么了?尼安德特人的基因组大约76.5万至55万年前,尼安德特人和现代智人祖先在非洲各奔东西。当时,尼安德特人迁徙到欧洲,而现代智人的祖先则留在了原地。在13万到11万年前,现代智人的祖先第一次走出非洲,但这次迁徙以失败告终,并最终在近东地区逐渐消失。直到5 万至4万年前,现代智人再次迁徙到欧洲和亚洲。现代智人的重大转变被认为发生在7万年前前后变得有别于其它人属物种,所以这次迁徙直接让尼安德特人消失在了历史舞台。得益于保存完好的欧洲和亚洲尼安德特人骨骼和牙齿的DNA,科学家已经恢复了完整的男性和女性尼安德特人的基因组副本。不出所料,尼安德特人的基因组与我们非常相似,他们同样包含约20000多个基因,捆绑在23条染色体上。另一方面,他们也有22对常染色体两个副本分别来自父母,还有一对性染色体,女性拥有两条X染色体,而男性则拥有一条X染色体和一条Y染色体。科学家有许多方法在智人的基因组中寻标记到尼安德特人的DNA序列片段,所以我们现在知道,除起源于非洲的人类谱系外,现在所有人的体内都包含有尼安德特人的基因。其中,欧洲起源的人类谱系的基因组中包含了2%的尼安德特人基因系列,而亚洲和印度的谱系比例还会更高一点。不过,尼安德特人的基因似乎正在被我们逐渐剔除,因为已知一些古代智人基因组中含有的尼安德特人 DNA 序列更多,有些达到6%左右。也正因为我们知道什么基因来自尼安德特人,所以我们知道哪些特征是尼安德特人带给我们的。其中包括红头发等外表特征,还有关节炎、狼疮等疾病都与尼安德特人的基因有关,当然他们的基因也带给了我们对许多疾病的抵抗力。但是,所有这些基因都与Y染色体无关,目前没有发现现代智人携带尼安德特人Y染色体的任何部分。Y染色体很难测序,因为它含有大量重复的“垃圾DNA”,因此尼安德特人的Y染色体基因组仅进行了部分测序。科学家在已测序的尼安德特人Y染色体上发现了现代智人Y 染色体中几种相同基因的样本,但没有在现代智人的Y染色体上发现尼安德特人的部分。值得一提的是,在现代人类中,一个名为SRY的Y染色体基因启动了男性的发育,SRY基因在所有猿类中都发挥着这一作用,或许也包括尼安德特人,但目前还没有发现尼安德特人的SRY基因。尼安德特人的 Y 染色体怎么了?其实,有许多原因都会导致尼安德特人的Y染色体在今天不出现在现代智人身体中。有人认为,尼安德特人的Y 染色体从未出现在跨物种杂交中,因为只有现代智人的男性爱上(或者其它暴力手段)尼安德特女性,而没有尼安德特人男性爱上现代智人女性。不过,这个想法很难与现代人类中没有尼安德特人线粒体DNA的痕迹(仅限于女性系)的发现相协调。也有人认为,由于尼安德特人种群数量非常少,所以拥有有害基因积累的可能性非常高,所以尼安德特人的 Y 染色体在工作方面不如其竞争对手智人那么出色。由于那些带有特别有用的基因的 Y 染色体(比如产生更多、更好或更快的精子)会迅速取代群体中的其他 Y 染色体,所以随着时间推移,尼安德特人的Y染色体基因组在现代智人中完全消失。另外,考虑到人类的 Y 染色体总体上正在退化,所以也可能尼安德特人的 Y 染色体中 SRY 基因已经丢失,他们靠其它方式决定性别,所以他们的Y染色体远没有现代智人的有用,也就逐渐就消失了。还有一种最有可能的原因,就是尼安德特人的Y染色体无法与现代人类其他染色体上的基因一起工作,导致带有Y染色体的混血不育。狮虎兽在物种杂交中,如果有一方不育、罕见或不健康,那么它基本都是具有不同性染色体的那一方。这个被称为霍尔登法则,比如在哺乳动物中,雄性拥有XY染色体,那么雄性杂交后代不健康或不育的比例就更高;而在鸟类中,雄性有ZZ染色体,雌性有ZW染色体,所以它们是雌性杂交后代不健康或不育的比例就更高。霍尔登法则的具体原因还不是很明确,但是它确实普遍影响生物,例如你可能知道狮子和老虎杂交的狮虎兽,它们雌性有生育能力,但雄性都不育,就是这种情况。携带尼安德特人Y染色体的混血不生儿子或者根本就不生孩子,那么Y染色体自然就会消失了。尼安德特人到底如何灭绝的?你会发现,无论出于哪种原因,碰到现代智人并与之杂交后,尼安德特人自己的繁育肯定出了巨大的问题。他们要么因为可生育人口减少了被现代智人占有,要么因为混血不育或者有害基因的存在被淘汰,总之碰到现代智人之后,他们种群肯定是萎缩了,这对于本身就人丁凋落的他们来说是雪上加霜。每个人都想知道尼安德特人是如何灭绝的,其实现在有一个认可度较高的原因,那就是他们真的生育出现了问题。尼安德特人和现代智人在欧洲共同生活了4000-10000年,2019年一项研究指出,这个重叠的时间要远长于现代智人通过战争或流行病等方式灭绝尼安德特人所需的时间。这项研究还指出,只要生育率略有下降,那么随着时间推移,这种积累就会成为他们最终走向灭绝的重要因素。其实,不仅现代智人通过这种“基因污染”的方式让尼安德特人最终灭亡,现在许多强势的入侵物种也都是这么做的。我们知道入侵物种通常会和本土相同生态位上的物种存在资源的竞争,这通常被认为是本土物种灭绝的主要原因。其实,对于许多物种来说,基因污染也是相当关键,甚至可能就是摧毁一个物种的最后一根稻草。报道原文: ... PC版: 手机版:

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比人类基因组更复杂 甘蔗基因组图谱的绘制标志着一个科学里程碑

比人类基因组更复杂 甘蔗基因组图谱的绘制标志着一个科学里程碑 现代杂交甘蔗简介现代杂交甘蔗是地球上收获最多的作物之一,用于制造糖、糖蜜、生物乙醇和生物基材料等产品。它也拥有最复杂的基因蓝图。迄今为止,甘蔗复杂的遗传学使其成为最后一种没有完整和高度精确基因组的主要作物。科学家们开发并结合多种技术,成功绘制出甘蔗的遗传密码图。有了这张地图,他们就能验证抗褐锈病的具体位置,这种褐锈病如果不加以控制,就会对糖料作物造成毁灭性打击。研究人员还可以利用基因序列更好地了解糖类生产中涉及的许多基因。甘蔗遗传研究进展这项研究是美国能源部联合基因组研究所(JGI)社区科学计划的一部分,JGI是能源部科学办公室在劳伦斯伯克利国家实验室(伯克利实验室)的用户设施。该研究于3月27日发表在《自然》杂志上,基因组可通过JGI的植物门户网站Phytozome获取。"这是我们迄今为止完成的最复杂的基因组序列,"JGI 植物项目负责人、哈德逊阿尔法生物技术研究所(HudsonAlpha Institute for Biotechnology)研究员杰里米-施穆茨(Jeremy Schmutz)说。"这表明我们已经取得了很大进展。这种事情在 10 年前人们认为是不可能的。我们现在能够实现我们认为在植物基因组学领域不可能实现的目标"。甘蔗的基因组之所以如此复杂,一方面是因为它体积庞大,另一方面是因为它比一般植物含有更多的染色体拷贝,这一特征被称为多倍体。甘蔗有大约 100 亿个碱基对(DNA 的组成单位);相比之下,人类基因组大约有 30 亿个碱基对。甘蔗 DNA 的许多片段在不同染色体内部和之间都是相同的。因此,在重建完整基因蓝图的同时,正确重组所有小段 DNA 是一项挑战。研究人员将多种基因测序技术结合起来,包括一种新开发的名为 PacBio HiFi 的测序方法,这种方法可以准确确定较长 DNA 片段的序列,从而解决了这一难题。了解和利用甘蔗基因组有了完整的"参考基因组",研究甘蔗就更容易了,研究人员可以将甘蔗的基因和通路与其他研究得比较透彻的作物(如高粱或其他感兴趣的生物燃料作物,如开关草和马齿苋)的基因和通路进行比较。通过与其他作物进行比较,可以更容易地了解每个基因是如何影响相关性状的,例如哪些基因在制糖过程中高度表达,或者哪些基因对抗病性很重要。这项研究发现,负责抵抗棕色锈病的基因只存在于基因组的一个位置,而棕色锈病是一种真菌病原体,曾给甘蔗作物造成数百万美元的损失。这张图片显示的是基因排序图(使用 GENESPACE 创建),它比较了相关植物物种的基因组组装情况。水平白线代表染色体,连接染色体的彩色编织线表示保守的基因块。这样,研究人员就能将研究得比较透彻的作物(如双色高粱,一种特殊的高粱)中的保守基因追踪到更复杂的基因组中,如野生甘蔗和栽培品种 R570,从而更好地了解它们的功能。为了形成对比,上一行提供了 R570 先前的单倍体组合,其中基因组中的多个染色体拷贝被表示为一个单一的马赛克组合。图片来源:Adam Healey 和 John Lovell/HudsonAlpha论文第一作者、HudsonAlpha 公司研究员亚当-希利(Adam Healey)说:"当我们对基因组进行测序时,我们填补了围绕褐锈病的基因序列空白。甘蔗基因组中有数十万个基因,但只有两个基因共同发挥作用,保护植物免受病原体的侵害。据我们所知,在所有植物中,以类似方式进行保护的情况屈指可数。更好地了解甘蔗的这种抗病性是如何起作用的,有助于保护其他面临类似病原体的作物。"研究人员对一种名为 R570 的甘蔗栽培品种进行了研究,几十年来,该品种一直被世界各地用作了解甘蔗遗传学的模型。与所有现代甘蔗栽培品种一样,R570 也是由甘蔗驯化品种(产糖能力强)和野生品种(携带抗病基因)杂交而成的。对农业和生物能源的潜在影响该论文的最后一位作者、法国国际发展农业研究中心(CIRAD)甘蔗研究员安热莉克-德洪(Angélique D'Hont)说:"了解 R570 的完整遗传图谱将使研究人员能够追踪哪些基因来自哪个亲本,从而使育种人员能够更容易地确定控制相关性状的基因,以提高产量。"改良未来的甘蔗品种在农业和生物能源领域都有潜在的应用前景。改进甘蔗的产糖方式可以提高农民的作物产量,在相同的种植面积上提供更多的糖分。甘蔗是生产生物燃料(尤其是乙醇)和其他生物产品的重要原料或起始材料。甘蔗压榨后剩下的残渣被称为甘蔗渣,是一种重要的农业残渣,也可被分解和转化为生物燃料和生物产品。联合生物能源研究所是伯克利实验室领导的能源部生物能源研究中心,该研究所的首席科技官布雷克-西蒙斯(Blake Simmons)说:"我们正在努力了解植物中的特定基因与下游生物质质量的关系,然后我们可以将生物质转化为生物燃料和生物产品。""有了对甘蔗遗传学的深入了解,我们就能更好地理解和控制植物基因型,从而生产出我们所需的糖类和蔗渣衍生中间体,实现与生物经济相关的规模化可持续甘蔗转化技术"。到目前为止,甘蔗复杂的遗传学使其成为最后一种没有完整和高精度基因组的主要作物。研究人员结合多种技术,成功绘制出甘蔗的DNA图谱,并确定了关键区域包括与糖的生产和运输以及对褐锈病的抗病性有关的几个区域。甘蔗的参考基因组可用于帮助培育抗逆性更强的作物或提高糖产量,并可应用于农业和生物能源领域。 ... PC版: 手机版:

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甘蔗基因组的完整图谱首次完成绘制 蕴藏将甘蔗转化为绿色燃料的方法

甘蔗基因组的完整图谱首次完成绘制 蕴藏将甘蔗转化为绿色燃料的方法 共同作者、昆士兰农业和食品创新联盟的罗伯特-亨利教授说,甘蔗是世界上 20 种主要作物中最后一种绘制了基因组图谱的作物。亨利教授说:"这标志着甘蔗基因组革命的开始,现在我们拥有了与其他作物公平竞争的知识。虽然这一基因组测绘将成为帮助创造更多抗性甘蔗作物的工具,但它也是我们将甘蔗和其他植物生物质转化为航空燃料的其他研究向前迈出的重要一步"。这张图片显示的是基因排序图(使用 GENESPACE 创建),它比较了相关植物物种的基因组组装情况。水平白线代表染色体,连接染色体的彩色编织线表示保守的基因块。这样,研究人员就能将研究得比较透彻的作物(如双色高粱,一种特殊的高粱)中的保守基因追踪到更复杂的基因组中,如野生甘蔗和栽培品种 R570,从而更好地了解它们的功能。为了形成对比,上一行提供了 R570 先前的单倍体组合,其中基因组中的多个染色体拷贝被表示为一个单一的马赛克组合。图片来源:Adam Healey 和 John Lovell/HudsonAlpha可再生碳和甘蔗的潜力亨利教授正在开发从植物生物质中提取的可再生碳产品,以用作具有成本效益和可持续发展的航空燃料,这是澳大利亚研究理事会植物替代化石碳工程研究中心(ARC Research Hub for Engineering Plants to Replacement Fossil Carbon)工作的一部分。他说:"传统上,甘蔗只是为了制糖而培育的,但现在随着净零排放目标的实现,人们对世界上产量最高的作物之一成为可再生碳源产生了浓厚的兴趣。这张基因组图谱将帮助我们生产出甘蔗,它是替代化石碳的更好原料"。对甘蔗研究和产业的影响首席研究员、澳大利亚联邦科学与工业研究组织(CSIRO)研究科学家凯伦-艾特肯(Karen Aitken)博士说,基因组测绘方面的突破通过利用以前无法获得的甘蔗遗传多样性,解决了蔗糖产量停滞不前的严峻挑战。艾特肯博士说:"这是甘蔗研究向前迈出的重要一步,将提高我们对甘蔗产量、对不同环境条件的适应性以及抗病性等复杂性状的认识。这是首个完成的优质甘蔗品种基因组,代表了全球科学家 10 年合作努力的重大科学成就。这些知识为我们提供了新的工具,以加强世界各地针对这种宝贵的生物能源和粮食作物的育种计划。"澳大利亚糖业研究中心细胞遗传学家 Nathalie Piperidis 博士说,该序列的公布将创造大量机会,澳大利亚糖业研究协会为参与这一了不起的成就感到无比自豪。"这项工作不仅有望增进我们对这种神奇作物的了解,而且还将提供前所未有的方法来推动行业内的育种技术,以生产一系列可再生和商业上可行的产品,其中包括但远不止蔗糖"。研究论文发表在《自然》杂志上。编译自:ScitechDaily ... PC版: 手机版:

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科学家开发出形成人类人工染色体的新技术

科学家开发出形成人类人工染色体的新技术 能在人体细胞内发挥作用的人造人类染色体有可能彻底改变基因疗法包括某些癌症的治疗方法,并有许多实验室用途。然而,巨大的技术挑战阻碍了它们的发展。现在,宾夕法尼亚大学佩雷尔曼医学院研究人员领导的团队在这一领域取得了重大突破,有效地绕开了一个常见的绊脚石。在最近发表在《科学》(Science)杂志上的一项研究中,研究人员解释了他们是如何设计出一种高效技术,利用单个长的设计DNA构建体来制造HACs的。以前制造 HACs 的方法一直受到以下事实的限制:用于制造 HACs 的 DNA 构建体往往会以不可预测的长序列和不可预测的重排方式连接在一起"多聚化"。新方法可以更快、更精确地制作 HAC,从而直接加快 DNA 研究的速度。假以时日,再加上有效的传输系统,这项技术就能为癌症等疾病带来更好的工程细胞疗法。全面改造 HAC 设计宾夕法尼亚大学生物化学与生物物理学埃尔德里奇-里夫斯-约翰逊基金会教授本-布莱克(Ben Black)博士说:"从根本上说,我们彻底改变了HAC设计和输送的旧方法。我们制造的 HAC 对于生物技术应用的最终部署非常有吸引力,例如,需要对细胞进行大规模基因工程的应用。另外一个好处是,它们与天然染色体同时存在,而无需改变细胞中的天然染色体。"首批人工染色体组是 25 年前开发的,人工染色体组技术在细菌和酵母等低等生物较小、较简单的染色体方面已经非常先进。而人类染色体则是另一回事,这主要是因为人类染色体的体积更大,中心粒(即 X 型染色体臂连接的中心区域)更复杂。研究人员已经能够用添加到细胞中的自连接DNA长度来形成小型的人造人类染色体,但这些DNA长度的多聚体具有不可预测的组织和拷贝数这使它们的治疗或科学用途变得复杂,而且由此产生的HAC有时甚至最终结合了宿主细胞中的天然染色体位点,使对它们的编辑变得不可靠。在他们的研究中,宾夕法尼亚大学医学院的研究人员通过多种创新设计出了改进的 HAC:其中包括含有更大、更复杂中心粒的更大初始 DNA 构建体,这使得 HACs 能够从这些构建体的单个拷贝中形成。在向细胞递送时,他们使用了一种基于酵母细胞的递送系统,该系统能够携带更大的载荷。布莱克说:"例如,我们没有试图抑制多聚化,而是绕过了这个问题,增加了输入 DNA 构建的大小,使其自然倾向于保持可预测的单拷贝形式。"研究人员的研究表明,与标准方法相比,他们的方法能更有效地形成有活力的 HAC,并能产生在细胞分裂过程中能自我繁殖的 HAC。优势和未来应用人工染色体的潜在优势有很多假定它们可以很容易地输送到细胞中,并像天然染色体一样运作。与基于病毒的基因递送系统相比,人工染色体将为表达治疗基因提供更安全、更高效、更持久的平台,而基于病毒的基因递送系统可能会引发免疫反应,并涉及有害的病毒插入天然染色体。细胞中正常的基因表达还需要许多局部和远距离的调控因子,而这些因子几乎不可能在类似染色体的环境之外进行人工复制。此外,人工染色体与相对狭窄的病毒载体不同,它允许表达大型、合作性的基因组合,例如构建复杂的蛋白质机器。布莱克预计,他的研究小组在这项研究中采用的同样广泛的方法将有助于为其他高等生物制造人工染色体,包括用于农业应用的植物,如抗虫、高产作物等。编译自:ScitechDaily ... PC版: 手机版:

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人类基因组项目未被讲述的故事

人类基因组项目未被讲述的故事 10 男 10 女共 20 名志愿者在 1997 年春天自愿参加了被誉为世界最大科学项目的人类基因组计划(Human Genome Project),将自己的基因组贡献给科学家进行测序。科学家告诉志愿者,如果基因公开,媒体或批评者可能会联络他们;如果公开的基因序列显示某种令人担忧的遗传状况,他们可能会被雇主或保险公司歧视。志愿者也被告知科学家会采取保护措施,匿名化基因序列,公开的基因组不是来自一个人而是由多人基因组组合而成。但科学家的保证最后落空了。当人类基因组工作草案在 2001 年公布时,近 75% 的基因组来自于一名代号为 RP11 的男性志愿者。领导该项目的科学家 Aristides Patrinos 表示一个原因是他们压力很大,必须按时完成任务。RP11 本人可能并不知道他在人类基因组项目上扮演了如此重要的角色,科学家至今没有通知他,Patrinos 表示他们受制于伦理委员会决定的束缚。 via Solidot

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