科学家首次整理出品类全面的穿山甲基因组资源

科学家首次整理出品类全面的穿山甲基因组资源一项新的研究为穿山甲提供了一个完整的基因组数据库,有助于保护它们。这项研究对多个物种进行了测序,深入了解了它们的进化过程,并将有助于追踪穿山甲的非法贸易。穿山甲由八个现存物种组成,近年来引起了公众的极大关注,保护工作也在不断进行。这主要是因为穿山甲是地球上被贩卖最多的野生哺乳动物,而且最近有人认为它们可能与COVID-19大流行病有关(当然这是不正确的)。穿山甲基因组学的意义尽管穿山甲的保护形势严峻,但对它们的研究仍然不足,在基础物种或种群研究方面仍存在很大差距。研究人员现在越来越重视野生动物研究中的基因组学,因为基因组学提供的数据可以更准确地了解物种或种群的划分、人口信息、多样性、历史轨迹以及动物对全球变化的适应能力。更不用说它在追踪非法交易个体的来源方面的潜力,以便更好地确定偷猎热点和破坏贩运网络。最近在《分子生物学与进化》(MolecularBiologyandEvolution)杂志上发表的一篇文章为穿山甲提供了一个全面的基因组数据库,这对保护穿山甲至关重要。穿山甲是世界上被贩卖最多的野生哺乳动物,分布在亚洲和非洲,一直面临着捕猎和栖息地破坏的威胁。这项研究对穿山甲的研究历来不足,它通过对多个穿山甲物种的测序填补了这一重大空白,甚至确定了一个潜在的新物种。图片来源:DarrenPietersen/《分子生物学与进化》穿山甲基因组研究面临的挑战获取穿山甲的全基因组信息是一项具有挑战性的任务。首先,穿山甲物种之间的地理隔离和有限的化石记录构成了方法上的障碍。亚洲和非洲的穿山甲物种大约在3790万年前分化,因此,如果使用遥远物种的参考基因组,就很难真正了解穿山甲类群的进化过程。其次,穿山甲的行为难以捉摸,而且分布在热带地区,因此基因采样既昂贵又耗时。研究结果和意义研究人员对原产于非洲的巨型穿山甲的首个参考基因组进行了测序、组装和注释,还对黑腹穿山甲、南非穿山甲、印度穿山甲和菲律宾穿山甲的基因组进行了测序和组装。这些新的基因组数据,连同以前发表的关于其余三个物种--白腹穿山甲、巽他穿山甲和中国穿山甲--的信息,提供了第一套完整的穿山甲基因组。在此过程中,研究人员还从之前公布的基因组数据中发现了一个潜在的穿山甲新物种。研究人员认为,这些信息最终将提供穿山甲随着时间推移如何应对不断变化的环境条件而进化的完整信息,将为未来几年如何通过保护优先事项和管理计划来有效保护这些动物提供重要信息。研究成果还将有助于开发追踪穿山甲贸易的DNA工具包。论文作者之一肖恩-海顿(SeanHeighton)说:"这项研究的作者来自非洲、亚洲和欧洲,他们的合作方式使我们首次能够从全基因组的角度深入研究穿山甲在所有八个物种中的进化。我们希望这些基因组将成为进一步开展基因研究的基础,从而有助于保护这些动物"。...PC版:https://www.cnbeta.com.tw/articles/soft/1388301.htm手机版:https://m.cnbeta.com.tw/view/1388301.htm

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科学家给新发现的穿山甲暂名“神秘” 原因或许你根本猜不到

科学家给新发现的穿山甲暂名“神秘”原因或许你根本猜不到读到这里,你或许都要拍桌子了:自己没见过的动物,竟然都能发表新种,还给它起名了。科学研究工作这么不严肃的嘛!先别急,说科学家们没见过这种穿山甲,稍微有一点点不准确。实际上,他们确实见到过这种穿山甲,不过,所见的个体并不完整——甚至连“部分”都说不上。也许你已经猜到了,研究团队是根据“甲片”确定这个新种的。由于众所周知的原因,穿山甲科所有动物都已经被列为重点保护对象。其中,中华穿山甲(M.pentadactyla)是我国的国家一级保护动物。包括中华穿山甲在内,整个穿山甲科都被列入了《濒危野生动植物种国际贸易公约》附录一,任何从野外捕猎的商业用途均被禁止。然而,盗猎穿山甲和非法贸易却屡禁不止。中国多地都曾经破获过大规模穿山甲走私案件。在2012年和2013年,香港海关曾经检出并罚没了27个穿山甲甲片。香港嘉道理农场暨植物园张华荣博士团队对这27枚甲片进行了分析,发现2个新的单倍型与当时已知的8个穿山甲现生物种可能无关。不过,当时检出的基因片段非常有限,所以还无法据此得出更明确的结论。沿着这样的线索,于黎团队分析了2015年和2019年在云南省罚没的两批穿山甲甲片中的样本。最终确定,确实存在一个新的穿山甲物种。将这个物种暂时定名为“神秘穿山甲”,正是这个让人觉得不可思议的研究过程的体现。在查获样品中发现的穿山甲新物种鳞片。图片来源:杨锋(中国香港特别行政区嘉道理农场植物园)此前,人类已知有8种穿山甲,其中4种分布在亚洲,4种分布在非洲。4种亚洲穿山甲全部列入穿山甲属(Manis),亲缘关系较近。而这一次确认的“神秘穿山甲”是于大约500万年前,从菲律宾穿山甲(M.culionensis)和马来穿山甲(M.javanica)中分化出来的。亚洲的穿山甲,分布于中国南方、南亚和东南亚。这一区域环境多样性极高,生境分化明显,因此有大量未知物种尚未被科学家发现。此次第9种穿山甲的发现,显示我们需要对亚洲穿山甲有更多研究。此次发现基于分子生物学的对比研究,并有一定的甲片形态学对比数据。但问题是,科学家并没有办法对甲片进行溯源。目前,所有的穿山甲都是保护物种。理论上来说,没有合法进口的穿山甲。而在非法贸易中,盗猎者通常会把甲片拔下来归在一起运输、贩卖,没有甲片的胴体归在一起。所以,走私的甲片,都是混合在一起的一大堆。近几年几个大案,动辄一吨、两吨甲片,2021年广东海关甚至破获过一起8吨甲片的大案。一只亚洲穿山甲,全身甲片加在一起,大约有0.5千克。也就是说,一吨甲片就意味着来自两千只穿山甲。而且这些非法贸易的甲片,没法追踪到来自哪个国家,也不知道它们来自哪个岛、哪片森林。图片来源于网络所以,目前我们完全无法得知第9种穿山甲长什么样子,更别提分布、数量、栖息地。通过这样的方法,发布一个动物新种,确实是极为罕见的。新研究显示,这个种有较高的近交系数。换句话说,神秘穿山甲个体之间,彼此“近亲结婚”的概率会较高。出现这样的情况,很可能意味着,它们要不就是分布在一个小岛或者孤立的森林里,是个很小的种群;要不就是已经经历过一次大灾难,个体数量已经非常稀少——这个物种本身,就已经在极其脆弱的状态中了。值得一提的是,科学家给这个新种起的“神秘穿山甲”这个名字,是“暂名”。因为严格来说,如果要正式描述并命名一个物种,需要发现这个物种本身,并建立“模式标本”。眼下,我们只是知道它们存在,而看不到它们的样子,无法建立模式标本,无法正式定名。如果不能尽快彻底杜绝野生动物非法贸易,也许科学家、也许我们将永远无法一睹“神秘穿山甲”的真容。它将永远“暂名”下去。参考文献[1]Tong-TongGuetal,Genomicanalysisrevealsacrypticpangolinspecies,ProceedingsoftheNationalAcademyofSciences(2023).DOI:10.1073/pnas.2304096120策划制作作者花蚀科普作家徐来科普作家审核黄乘明中国科学院动物研究所研究员策划徐来责编丨杨雅萍...PC版:https://www.cnbeta.com.tw/articles/soft/1391983.htm手机版:https://m.cnbeta.com.tw/view/1391983.htm

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美内政部称中国穿山甲贸易削弱国际贸易公约中方反驳美国内政部认定中国公民从事穿山甲贸易和捕获活动,正在削弱《濒危野生动植物种国际贸易公约》(CITES)效力,寻求总统介入制裁。中国官方回应称,中国对穿山甲保护付出极大努力,批评这是美国“滥用长臂管辖的又一例证”。美国内政部星期五(9月8日)在官网发布声明称,内政部长哈兰德(DebHaaland)已向美国参议院和众议院提交证明,通过对穿山甲贸易的审查,认定中国公民正通过穿山甲贸易和获取穿山甲,削弱CITES的效力。声明称,依照美国《渔民保护法》培利修正案(PellyAmendment)规定,当内政部发现外国国民正在从事削弱CITES或任何有关保护濒危物种国际合作的贸易或获取行为时,内政部长必须向总统证明这一事实。声明称,在部长提交证明后60天内,总统将向国会通报根据认证采取的任何行动,以帮助采取保护行动防止穿山甲灭绝。 声明也说,美国国务院将继续与中国进行外交接触,促进穿山甲的保护。根据培利修正案,当美国商务部或美国内政部认定某国国民从事买卖或猎取濒临绝种野生物致危及国际合作时,美国总统可行使贸易制栽权,禁止该国的野生动物制品出口美国,并对其他的贸易也实施制裁。中国国家林业和草原局星期六(9月9日)通过官网微信公众号发布声明,回应此事。林草局称,美国内政部无视中国为保护全球穿山甲付出的极大努力和取得的明显成效,认定中国公民从事穿山甲贸易和获取活动,正在削弱CITES效力。“美方此举是其滥用长臂管辖的又一例证,违背了客观、公正的基本准则,极不利于全球穿山甲保护合作”。声明称,中国国家林草局作为中国政府履行CITES的牵头部门,对此表示严重关切,并坚决反对借穿山甲保护问题损害中国保护声誉的企图,中方已经并将继续就此向美方提出严正交涉。中国林草局强调,近十年来,中国政府强化濒危野生动植物保护,例如2020年6月3日将穿山甲所有种调升为国家一级保护野生动物,强化穿山甲野外种群及其栖息地保护和监测,严格禁止猎捕、食用穿山甲,有效促使中国穿山甲野外种群恢复性增长。...

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