新研究揭示钙在身体清除死亡细胞过程中的关键作用

新研究揭示钙在身体清除死亡细胞过程中的关键作用由日本京都大学细胞-材料综合科学研究所(iCeMS)科学家共同领导的研究小组揭示了垂死细胞如何激活一种蛋白质的机制,这种蛋白质会触发免疫细胞发出"吃我吧"的信号,以清理细胞碎片。这些发现最近发表在《自然-通讯》(NatureCommunications)杂志上。这种蛋白质名为Xkr4,是细胞膜中的Xkr家族蛋白质之一。Xkr4能将磷脂磷脂酰丝氨酸从细胞膜内部(通常位于细胞膜内部)扰乱到细胞膜外部。磷脂酰丝氨酸转移到细胞膜外侧是细胞即将死亡的信号,也是吸引吞噬细胞吞噬碎片的信号。细胞外的钙会进入scramblase跨膜区域的一个口袋,引发scramblase的激活。这使得细胞表面的磷脂酰丝氨酸(PS)暴露出来,成为清除无用细胞的独特标记。图片来源:MindyTakamiya/KyotoUniversityiCeMSXkr4的激活过程研究人员之前发现,要成为磷脂酰丝氨酸的扰乱酶,Xkr4的C端胞质尾部必须先被裂解,与另一个Xkr4形成二聚体,并暴露出一个结合位点。然后,这个结合位点与另一个名为XRCC4的蛋白质片段相连接。然而,在实验环境中,XRCC4与Xkr4的结合本身并不足以激活Xkr4。这表明还需要其他成分。钙离子的作用日本的研究小组发现,钙离子是激活Xkr4的必要条件。细胞环境外带正电荷的钙离子与Xkr4蛋白质两个"螺旋"上带负电荷的三个氨基酸结合。这种结合使Xkr4从中间状态变为完全激活状态。iCeMS生物化学家JunSuzuki解释说:"我们发现,细胞外钙起到了Xkr4跨膜螺旋的分子粘合剂的作用,激活了Xkr4。"钙的意外作用和未来研究令人惊讶的是,众所周知细胞外钙参与调节细胞内外环境中蛋白质的活性,但细胞膜本身却不参与调节。铃木说:"我们意外地发现,细胞外钙渗入蛋白质的跨膜区域,连接两个跨膜螺旋。"这项研究还表明,钙离子对激活Xkr蛋白家族的其他成员,特别是Xkr8和Xkr9可能很重要,这有助于阐明这些和其他扰乱酶蛋白的作用机制。研究小组下一步将研究Xkr4在神经细胞中的功能,并探索它们在大脑中的作用。参考文献PanpanZhang、MasahiroMaruoka、RyoSuzuki、HikaruKatani、YuDou、DanielM.Packwood、HidetakaKosako、MotomuTanaka和JunSuzuki于2023年9月11日在《自然-通讯》上发表的论文:"细胞外钙作为跨膜螺旋的分子粘合剂激活扰乱酶Xkr4"DOI:10.1038/s41467-023-40934-2编译来源:ScitechDaily...PC版:https://www.cnbeta.com.tw/articles/soft/1402173.htm手机版:https://m.cnbeta.com.tw/view/1402173.htm

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细胞回收背后的通用途径或为我们揭示对抗衰老的新线索溶酶体是一种微小的结构,它可以分解并清除分子废物,以保持细胞的年轻与新鲜,因而这套机制有时也被称作细胞回收系统。此前已有许多研究揭示了它与衰老相关的疾病有牵连,例如癌症、阿尔兹海默病、以及帕金森氏症。但若能对这些细胞器的自我修复方式产生新的认知,或为我们指明一条阻止相关疾病发展的全新道路。荧光显微图像-绿色的内质网网络,包裹着红色的受损溶酶体(来自:JayXiaojunTan)研究一作、来自匹兹堡大学医学院细胞生物学系的谭小军(音译)表示:溶酶体损伤是衰老和许多疾病的标志,尤其是阿尔茨海默病等神经退行性疾病。我们的新研究已确定一系列步骤,并且认为它是溶酶体修复的普遍机制。此外为了向匹兹堡大学致敬,我们最终决定将其命名为‘PITT’途径。研究配图1-识别PI4K2A介导的PtdIns4P信号在快速溶酶体修复中的作用溶酶体功能的关键,在于一种膜——其重要目的是容纳它们用来吞噬分子废物的强大消化酶。通过将这些酶隔离开,细胞膜可让细胞的其余部分保持健康和完整。该膜可以迅速渗漏,但健康细胞能够迅速堵塞缝隙、并使溶酶体恢复全部功能。而在这项新研究中,该校团队试图通过观察实验室培养细胞中受损的溶酶体,来了解支持这一修复过程的过程。研究配图2-PtdIns4P驱动ORP栓系的ER-溶酶体接触,以实现快速膜修复。科学家们看到有蛋白质会落在受伤的细胞器上,且其中一个尤其引人注目——它就是能够迅速到达、并产生大量被称作PtdIns4P信号分子的PI4K2A酶。Tan表示——PtdIns4P就像一面红旗,它会告知这里存在问题,然后警报系统就会招募另一组被称作ORP的蛋白质。ORP能够像系绳一样工作,其一端连接到溶酶体PtdIns4P、另一端则连接到称为内质网的细胞结构。这种结构在蛋白质和脂质的合成中发挥了作用,后续研究发现它会产生胆固醇(cholesterol)、以及一种被称作磷脂酰丝氨酸(phosphatidylserine)的脂质。研究配图3-通过ER到溶酶体的磷脂酰丝氨酸,转移介导快速溶酶体修复。由于能够修补膜上的孔洞,上述产物也被认为是整个溶酶体修复过程的关键。此外研究人员发现,磷脂酰丝氨酸可以激活另一种称作ATG2的蛋白质。该蛋白质有助于在修复过程的最后一步,将脂质转运至溶酶体。后续实验中,研究人员尝试剔除编码PI4K2A酶的基因,结果发现与阿尔茨海默病相关的tau原纤维会自由生长。科学家们认为,在年轻和健康人群中,溶酶体可通过这一途径加以快速修复,但衰老和疾病会损害其功能——导致渗漏的溶酶体积累、进而加速衰老和某些疾病的发作。研究配图4-激活脂质转运,介导直接、快速的溶酶体修复。下一步,科学家们打算探索如何利用PITT途径,来保护实验小鼠免受阿尔兹海默病的影响。研究资深作者TorenFinkel解释称:这套机制的美妙之处,在于已知的PITT通路的所有成分都存在,但不清楚它们谁在这个序列中相互作用、或发挥溶酶...PC版:https://www.cnbeta.com/articles/soft/1314097.htm手机版:https://m.cnbeta.com/view/1314097.htm

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“再见”基因:果蝇在细胞凋亡过程中使用的蛋白质与哺乳动物类似RIKEN遗传学家在果蝇中发现了一种许多教科书上说不存在的蛋白质。这种蛋白质检测细胞中的压力,并在它们承受过度压力时让它们走上自我毁灭的道路。我们体内受损的细胞通过启动称为细胞凋亡的程序性细胞死亡的自杀过程来自我消除。这个过程对我们的健康和确保细胞不会癌变至关重要。这一过程背后的分子级联反应非常复杂,但它是由属于BH3-only蛋白质家族的一种蛋白质触发的。这些蛋白质感知细胞中的压力,并且存在于包括哺乳动物和线虫在内的许多动物中。然而,在过去的二十年里,在实验室中以果蝇为代表的所有昆虫都被认为缺乏BH3-only蛋白。相反,他们被认为依赖于不同的细胞死亡程序。但是现在,RIKEN生物系统动力学研究中心的SaKanYoo及其同事有一个惊人的发现,他们发现果蝇确实含有一种仅含有BH3的蛋白质。他们以日语中的“告别”一词命名了为其编码的基因sayonara。SaKanYoo和YukoIkegawa。图片来源:2023RIKEN当该团队使sayonara基因在果蝇翅膀中表达时,他们观察到发生细胞凋亡,导致翅膀萎缩(图1)。根据Yoo的说法,该基因隐藏在众目睽睽之下。“我们没有做任何花哨的事情,仅仅是使用了人类BH3-only蛋白的基因序列,并核对了果蝇的基因组是否具有相似的序列——这是在果蝇中寻找与人类基因相对应的基因的一种非常常见的方法。”Yoo怀疑果蝇基因组的不完整测序可以解释为什么研究人员在20年前没有在果蝇中发现该基因。“当时基因组测序还不完整,所以科学家们可能无法找到该基因,过了一段时间他们就放弃了。”果蝇缺乏BH3-only蛋白随后被载入教科书。但对Yoo来说,这是一个有趣的挑战。“我认为检查它可能会很有趣,而仅仅几个小时后,我就发现了一些看起来很像BH3-only蛋白质的东西。”这一发现表明,果蝇,可能还有其他昆虫,在细胞凋亡方面和人类以及其它物种并没有太大不同。“这意味着果蝇并不例外或有点奇怪,”Yoo说。“相反,我们发现它们具有与人类和线虫相似的调节细胞凋亡的机制。”该团队现在正在探索BH3-only蛋白被激活后究竟会发生什么。他们还在研究其他昆虫是否含有BH3-only蛋白。...PC版:https://www.cnbeta.com.tw/articles/soft/1365787.htm手机版:https://m.cnbeta.com.tw/view/1365787.htm

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