科学家以前所未有的"实时"视角揭示大脑的复杂性
科学家以前所未有的"实时"视角揭示大脑的复杂性要掌握这种复杂程度的信息极具挑战性,因此我们必须采用先进的技术,在微观层面上解码大脑内部发生的微小而复杂的相互作用。因此,成像技术成为神经科学领域的关键工具。约翰-丹泽尔(JohannDanzl)在国际科学与技术协会(ISTA)的研究小组开发的新型成像和虚拟重建技术是大脑活动成像技术的一大飞跃,并被恰当地命名为LIONESS-即实时信息优化纳米镜成像技术(LiveInformationOptimizedNanoscopyEnablingSaturatedSegmentation)。LIONESS是一个用于成像、重建和分析活体脑组织的管道,其全面性和空间分辨率是迄今为止无法实现的。a:复杂的神经元环境b:LIONESS可以对样本进行成像和重建,从而阐明活体脑组织中的许多动态结构和功能。资料来源:JohannDanzl"有了LIONESS,我们第一次有可能对活脑组织进行全面、密集的重建。通过对组织进行多次成像,LIONESS让我们能够观察和测量大脑中的动态细胞生物学过程,"第一作者PhilippVelicky说。"输出结果是细胞排列的三维重建图像,时间是第四维,因为样本可以在几分钟、几小时或几天内成像。"LIONESS的优势在于精良的光学技术和构成其核心的两级深度学习(一种人工智能方法):第一级提高图像质量,第二级识别密集神经元环境中的不同细胞结构。该管道是丹泽尔小组、比克尔小组、乔纳斯小组、诺瓦里诺小组、ISTA科学服务单位以及其他国际合作者的合作成果。"ISTA的约翰-丹兹尔(JohannDanzl)说:"我们的方法是组建一个充满活力的科学家小组,他们拥有独特的跨学科综合专长,共同致力于填补脑组织分析领域的技术空白。重建活体脑组织的管道。通过优化的激光聚焦采集显微镜图像--图像处理(DL)--分割(DL)--三维视觉分析。图片来源:JohannDanzl跨越障碍以前可以通过电子显微镜重建脑组织。这种方法根据样本与电子的相互作用对样本进行成像。尽管电子显微镜能捕捉几纳米(百万分之一毫米)分辨率的图像,但它要求样本固定在一种生物状态,需要对样本进行物理切片才能获得三维信息。因此,无法获得动态信息。另一种以前已知的技术是光学显微镜,它可以通过"光学"而不是物理切片来观察活体系统和记录完整的组织体积。然而,由于光波产生图像的特性,光显微镜的分辨率受到严重影响。其最佳分辨率为几百纳米,过于粗糙,无法捕捉脑组织中重要的细胞细节。利用超分辨率光学显微镜,科学家们可以打破这一分辨率障碍。这一领域的最新研究成果被称为"超分辨率阴影成像"(SUSHI,Super-resolutionShadowImaging),它表明,在细胞周围的空间中涂抹染料分子,并应用获得诺贝尔奖的超分辨率技术STED(受激辐射损耗)显微镜,就能显示出所有细胞结构的超分辨率"阴影",从而将它们在组织中可视化。LIONESS可以对样本进行成像和重建,从而阐明活体脑组织中的许多动态结构和功能。资料来源:朱莉娅-柳奇克(JuliaLyudchikISTA)尽管如此,要想通过提高分辨率来对整个体积的脑组织进行成像,从而与脑组织复杂的三维结构相匹配,这一直是不可能的。这是因为在提高分辨率的同时,还需要对样本进行高负荷的成像光照,这可能会损坏或"损坏"微妙的活体组织。这就是LIONESS的优势所在,根据作者的说法,LIONESS是在"快速、温和"的成像条件下开发的,因此能保持样本的活力。该技术在提供各向同性超分辨率的同时--即在所有三个空间维度上都同样出色--还能以三维纳米级分辨率的细节观察组织的细胞成分。在成像步骤中,LIONESS从样本中收集的信息越少越好。随后进行第一个深度学习步骤,在称为"图像复原"的过程中填充有关脑组织结构的额外信息。通过这种创新方式,它可以实现约130纳米的分辨率,同时又足够温和,可以对活脑组织进行实时成像。这些步骤共同实现了深度学习的第二步,这一次是让极其复杂的成像数据变得有意义,并以自动化的方式识别神经元结构。ISTA科学家约翰-丹兹尔(JohannDanzl)在奥地利科技研究所的实验室中。图片来源:NadinePoncioniISTA定位Danzl说:"跨学科的方法使我们能够打破解析力和活体系统光照的相互交织限制,使复杂的三维数据变得有意义,并将组织的细胞结构与分子和功能测量结合起来。"在虚拟重建方面,Danzl和Velicky与视觉计算专家合作:ISTA的Bickel小组和哈佛大学HanspeterPfister领导的小组,他们在自动分割(自动识别组织中的细胞结构的过程)和可视化方面贡献了自己的专业知识,ISTA的图像分析科学家ChristophSommer也提供了进一步的支持。在复杂的标记策略方面,来自爱丁堡、柏林和国际科学与技术机构的神经科学家和化学家也做出了贡献。因此,在同一活体神经元回路中进行功能测量(即读出细胞结构和生物信号活动)成为可能。这项工作是通过与ISTA的Jonas小组合作,对进入细胞的钙离子通量进行成像并测量细胞电活动来完成的。小组提供了人脑有机体,这种有机体通常被昵称为迷你大脑,可以模拟人脑的发育过程。作者强调,所有这一切都得益于ISTA顶尖科学服务部门的专业支持。大脑的结构和活动是高度动态的;其结构随着大脑执行和学习新任务而不断演变。大脑的这一特性通常被称为"可塑性"。因此,观察大脑组织结构的变化对于揭开其可塑性背后的秘密至关重要。国际科学与技术协会开发的新工具通过揭示亚细胞结构并捕捉这些结构如何随时间发生变化,显示出了解脑组织以及其他潜在器官功能结构的潜力。...PC版:https://www.cnbeta.com.tw/articles/soft/1382361.htm手机版:https://m.cnbeta.com.tw/view/1382361.htm