日本发现所有Covid 变体都是实验室制造 大阪医科大学和京都的田中惇贵和宫沢孝幸在他们的研究中追踪SARS-CoV2

日本发现所有Covid变体都是实验室制造日本大阪医科大学和京都大学的田中惇贵和宫沢孝幸在他们的研究中追踪SARS-CoV2，Omicron变体的历史演变。这些变体的存在，似乎为大规模实验室制造和释放新冠病毒提供了确凿的证据。#牛津视觉

研究人员发现对所有治疗性抗体有抗性的新冠病毒亚变体

研究人员发现对所有治疗性抗体有抗性的新冠病毒亚变体感染SARS冠状病毒-2（SARS-CoV-2）或接种COVID-19疫苗后会引发免疫反应，从而产生中和抗体，帮助预防SARS-CoV-2的（再次）感染或疾病的严重过程。通过附着在病毒的穗状蛋白上，中和抗体提供保护并阻止病毒进入细胞。Omicron亚型BA.1、BA.4、BA.5以及Q.1.1在尖峰蛋白上有大量的突变。其中一些突变是逃逸突变，使病毒能够逃避抗体的中和。此外，对生物技术生产的抗体的抗性也在发展，这些抗体是作为预防措施或作为对已确诊的SARS-CoV-2感染的治疗而给高风险患者使用的。Omicron亚系BQ.1.1是第一个对目前由EMA（欧洲药品管理局）和/或FDA（美国食品和药物管理局）批准的所有抗体疗法具有抗性的变体。然而，某些SARS-CoV-2变体，特别是Omicron变体，由于尖峰蛋白的突变，避免了中和抗体，甚至在接种疫苗或康复期的个人中引起有症状的感染。这被称为免疫规避，它对高风险人群构成了危险，包括老年人和免疫系统较弱的人，或者由于疾病或药物治疗所导致。他们往往不能产生足以保护自己免受严重疾病的免疫反应，即使在全面接种疫苗后也是如此。为了保护高风险患者，在确认SARS-CoV-2感染后，以生物技术生产的抗体作为预防措施或作为早期治疗。不同SARS-CoV-2变体的尖峰蛋白的突变赋予了对个别抗体疗法的抗性。因此，定期监测治疗性抗体是否对目前流通的病毒变体继续有效是很重要的。来自德国灵长类动物中心-莱布尼茨灵长类动物研究所感染生物学组和弗里德里希-亚历山大-纽伦堡大学分子免疫学部的一个研究小组调查了已获批准的抗体疗法对目前流通的Omicron亚变体的抑制效率。研究人员发现，在全球范围内正在上升的Omicron亚变体BQ.1.1对所有可用的抗体疗法都有抵抗力。"在我们的研究中，我们将携带选定病毒变体的穗状蛋白的非传播性病毒颗粒与不同稀释度的待测抗体混合，随后测量抑制细胞培养物感染所需的抗体量。"该研究的主要作者PhernaArora解释说："我们总共测试了12种单独的抗体，其中6种在欧洲被批准用于临床，还有4种抗体鸡尾酒抗体组合。"研究人员发现，Omicron亚变体BQ.1.1既不能被单个抗体也不能被抗体鸡尾酒中和。相比之下，目前占主导地位的Omicron亚变体BA.5仍能被一种获批的抗体和两种获批的抗体鸡尾酒中和。"考虑到高风险患者，我们非常关注Omicron亚变体BQ.1.1对所有获批抗体疗法的耐药性。特别是在BQ.1.1广泛存在的地区，医生在治疗受感染的高危患者时不应该仅仅依靠抗体疗法，还应该考虑使用其他药物，如帕克洛韦或莫努匹韦，"研究负责人MarkusHoffmann对该研究结果评论道。发现Omicron亚变体BQ.1.1已经对一种即将在美国获批的新抗体疗法产生耐药性，这突出了开发针对COVID-19的新抗体疗法的重要性。"SARS-CoV-2变体的抗体耐药性的不断发展要求开发新的抗体疗法，专门针对目前流通的和未来的病毒变体。"德国灵长类动物中心-莱布尼茨灵长类动物研究所感染生物学组组长StefanPöhlmann总结说："理想情况下，它们应该针对尖峰蛋白中几乎没有可能发生逃逸突变的区域。"...PC版：https://www.cnbeta.com.tw/articles/soft/1335803.htm手机版：https://m.cnbeta.com.tw/view/1335803.htm

科学家创造强大的新抗体 能中和所有已知的COVID-19变体

科学家创造强大的新抗体能中和所有已知的COVID-19变体随着SARS-CoV-2的变化和变异，在大流行早期有效的治疗性抗体已经失去了效力，而更多最近的变种，特别是奥密克戎（Omicron），已经学会了如何规避我们的系统对疫苗接种产生的抗体。由于波士顿儿童医院创造的一种新的、广泛的中和抗体，我们可能能够更好地防范可能的变异。在测试中，它中和了所有已知的SARS-CoV-2变体，包括所有奥密克戎变异株。波士顿儿童医院细胞和分子医学项目的FrederickAlt博士说：“我们希望这种人源化抗体将被证明在病人身上中和SARS-CoV-2，就像它迄今为止在临床前评估中被证明的那样有效。”在发表在《科学免疫学》上的一项研究中，Alt和SaiLuo博士利用其实验室以前用来寻找针对HIV（另一种经常变异的病毒）的广义中和抗体的人源化小鼠模型的改进版。由于小鼠实际上具有内置的人类免疫系统，该模型与我们的免疫系统用来创造越来越有效的抗体的试错过程非常相似。研究人员最初将两个人类基因片段引入小鼠体内，使它们的B细胞在短时间内创造出广泛的人源化抗体。他们随后将小鼠暴露在病毒的SARS-CoV-2刺突蛋白的原始毒株中，这是我们的抗体和当前疫苗所针对的主要蛋白。改良后的小鼠发展出9个品系或“家族”的人源化抗体，这些抗体在反应中与刺突蛋白结合。Alt和Luo与BartonHaynes博士领导的杜克大学团队一起，评估了这些抗体的功效。九个品系中的三个品系的抗体在中和原始毒株方面是有效的。特别是SP1-77抗体和它的其他成员，表现出极其广泛的活性，可以中和Alpha、Beta、Gamma、Delta以及所有以前和现在的Omicron病毒株。是什么导致SP1-77抗体具有如此广泛的中和作用？由波士顿儿童医院的陈兵博士和张军博士领导的合作小组以及杜克大学的海恩斯小组进行的结构研究表明，SP1-77的工作方式与目前的抗体（无论是治疗性抗体还是我们为应对目前的疫苗而制造的抗体）不同。许多现有的抗体通过在某些区域附着在刺突蛋白的受体结合域（RBD）上发挥作用，阻止SARS-CoV-2与细胞的ACE2受体结合，这是感染的最初步骤。SP1-77抗体也与RBD结合，但以一种完全不同的方式，并不能阻止病毒与ACE2受体结合。波士顿儿童医院的合作者AlexKreutzberger博士和TomasKirchhausen博士使用一个新型活细胞成像平台，表明SP1-77阻止病毒将其外膜与靶细胞的膜融合。这阻挠了向感染敞开大门的最后一个必要步骤。这些特征可能为新的SARS-CoV-2疫苗的设计提供参考。Kirchhausen说：“SP1-77在一个迄今尚未在任何SARS-CoV-2变体中发生突变的部位结合刺突蛋白，通过一种新的机制广泛地中和目前的变体。”...PC版：https://www.cnbeta.com/articles/soft/1312889.htm手机版：https://m.cnbeta.com/view/1312889.htm

研究显示COVID-19感染包括多种SARS-CoV-2病毒变体

研究显示COVID-19感染包括多种SARS-CoV-2病毒变体凯斯西储大学（CWRU）的研究人员对360名COVID-19患者的病毒感染进行了基因排序。他们发现SARS-CoV-2病毒有广泛的遗传变异，表明所有的个体感染都包括病毒的多种变体。研究人员指出，有关该病毒的报告通常强调一个单一的优势毒株。这导致了对病毒遗传变异的报道不足，并可能在公共卫生计划和反应中产生严重后果。PC版：https://www.cnbeta.com/articles/soft/1315833.htm手机版：https://m.cnbeta.com/view/1315833.htm

实验室测试显示一种新抗体能中和所有已知的新冠病毒变种

实验室测试显示一种新抗体能中和所有已知的新冠病毒变种随着COVID-19大流行的持续，SARS-CoV-2的较新变种一直在进化，以逃避我们身体对疫苗接种或先前感染所产生的抗体。突破性的病例已经产生，而曾经有效的抗体治疗也随着时间的推移变得不那么有效。科学家们一直在寻找一种具有广泛中和作用的抗体，能够对抗可能出现的任何病毒变体。哈佛医学院和波士顿儿童医院的研究人员开发的一种抗体现在似乎符合这一要求。在实验室测试中，它中和了目前所有已知的SARS-CoV-2变体，包括所有的Omicron变种。研究结果于8月11日发表在《科学免疫学》上。在阿尔特和波士顿儿童医院儿科的HMS讲师SaiLuo的带领下，该团队首先修改了阿尔特实验室创建的小鼠模型，以寻找针对HIV的广义中和抗体，这是另一种经常变异的病毒。这些小鼠基本上都有内置的人类免疫系统。修改后的模型模仿并完善了我们自己的免疫系统在遇到入侵者时用来创造越来越有效抗体的试验和错误过程。研究人员首先将两个人类基因片段插入小鼠体内。这促使小鼠的免疫细胞迅速产生类似于我们身体可能产生的各种抗体。研究小组随后让小鼠接触SARS-CoV-2尖峰蛋白，这是我们的抗体和目前的疫苗所针对的主要蛋白质。作为回应，小鼠产生了九个不同的"家族"抗体，与尖峰蛋白结合。研究人员随后测试了这些抗体的有效性。九个"家族"抗体中的三个"家族"抗体强烈地中和了原始的新冠病毒。但是一个抗体家族，特别是一个被称为SP1-77的抗体，显示出更广泛的活性，可以中和α、β、γ、δ以及所有以前和现在的omicron病毒株。是什么让SP1-77在中和病毒方面如此出色？由波士顿儿童医院罗莎琳-富兰克林博士的儿科教授BingChen、波士顿儿童医院儿科HMS讲师JunZhang和杜克大学的BartonHaynes领导的合作团队的结构生物学研究表明，这种抗体以一种独特的方式发挥作用。为了感染我们，SARS-CoV-2必须首先附着于我们细胞上的ACE2受体。我们为应对疫苗而制造的许多抗体，以及用于治疗COVID-19的抗体，都能阻止这种结合。它们是通过在特定位置附着在尖峰的受体结合域上来实现的。SP1-77抗体也与受体结合域结合，但以一种不同的方式，它并不阻止病毒与ACE2受体结合。一旦病毒与ACE2结合，它必须完成最后一步：将其外膜与我们的细胞膜融合。这就为感染打开了大门。研究人员使用一个新的活细胞成像平台，表明SP1-77能阻止这一步骤。SP1-77在一个迄今尚未在任何变种中发生突变的部位与穗状蛋白结合，而且它通过一种新的机制中和这些变种，这些特性可能有助于其广泛和有效的活性。如果这些发现最终能在人类身上得到复制，那么这些抗体可能会带来更好的COVID-19疫苗和治疗。研究人员已经为这些抗体和用于生产这些抗体的小鼠模型申请了专利。他们希望看到他们的工作得到商业化发展。PC版：https://www.cnbeta.com/articles/soft/1306057.htm手机版：https://m.cnbeta.com/view/1306057.htm

先进的 RNA 测序技术揭示了 COVID-19 新变异的驱动因素

先进的RNA测序技术揭示了COVID-19新变异的驱动因素了解助长SARS-CoV-2产生变异能力的遗传机制对遏制COVID有很大帮助。在今天（4月22日）发表在《自然-微生物学》（NatureMicrobiology）上的这项研究中，贝勒医学院和合作机构的研究人员开发了一种名为tARC-seq的新技术，它揭示了影响SARS-CoV-2分化的遗传机制，并使研究小组能够计算出SARS-CoV-2的变异率。利用tARC-seq，研究人员还在实验室中捕捉到了受感染细胞中SARS-CoV-2的新突变，再现了全球大流行病毒测序数据所揭示的观察结果。这些发现有助于监测病毒在人类群体中的进化。"SARS-CoV-2病毒使用RNA而不是DNA来存储其遗传信息。我们实验室长期以来一直对研究RNA生物学感兴趣，当SARS-CoV-2出现时，我们决定研究它的RNA复制过程，RNA病毒的复制过程通常容易出错，"通讯作者、贝勒大学分子与人类遗传学教授、分子病毒学与微生物学教授ChristopheHerman博士说。研究人员希望跟踪RNA复制错误，因为这些错误对于了解病毒如何进化、如何在人类群体中传播时发生变化和适应至关重要，但目前的方法缺乏精确性，无法检测到罕见的新SARS-CoV-2变异，尤其是在病毒数量较少的样本中，如来自患者的样本。DanLDuncan综合癌症中心成员赫尔曼说："由于患者样本中的SARS-CoV-2RNA副本非常少，因此很难区分SARS-CoV-2RNA依赖性RNA聚合酶（RdRp）（复制这种病毒RNA的酶）产生的错误和序列分析中使用的其他酶产生的错误。我们开发了一种技术，称为靶向精确RNA共识测序（tARC-seq），它使我们能够测量复制极低量特定RNA时的真实误差。"最初的想法是，由于SARS-CoV-2有一种内部机制来修复RdRp所犯的错误，因此病毒应该不会很快进化或变异。赫尔曼说："这种想法与大流行期间世界各地经常出现新的COVID变种这一事实形成了鲜明对比。自大流行开始以来，我们已经看到了一些突出的变种，包括Alpha、Beta、Delta和Omicron，以及这些群体中的变种"。有了改进后的分析工具，研究人员准确测定了实验室细胞培养物和临床样本中SARS-CoV-2的变异频率和变异类型。赫尔曼说："我们发现变异率高于最初的预期，这有助于解释COVID变体频繁出现的原因他们还发现，SARS-CoV-2RNA中存在一些热点，这些位置比其他位置更容易发生变异。"例如，我们在与尖峰蛋白相对应的RNA区域发现了一个热点，尖峰蛋白是一种能让病毒侵入细胞的蛋白质。此外，尖峰蛋白的RNA也构成了许多疫苗，"赫尔曼说。tARC-seq方法还发现，新变体的产生涉及模板切换。"RdRp在复制一个RNA模板或序列时，会跳转到附近病毒上的另一个模板，然后继续复制RNA，因此产生的新RNA副本是两个RNA模板的混合物，"赫尔曼说。"这种模板切换会导致序列插入或缺失，从而产生病毒变异。我们还观察到了复杂的突变。SARS-CoV-2利用模板切换和复杂突变这两种强大的生物机制，使其能够快速进化，产生变种，以适应并在人类种群中存活。""tARC-seq使我们能够在实验室细胞培养物中捕捉到新突变的出现，这些新突变再现了全球大流行测序数据中观察到的突变，这既有趣又令人兴奋。我们的新技术捕捉到了个体患者临床样本中新突变的快照，可用于监测人类群体中的病毒进化。"编译来源：ScitechDaily...PC版：https://www.cnbeta.com.tw/articles/soft/1428224.htm手机版：https://m.cnbeta.com.tw/view/1428224.htm