研究显示COVID-19感染包括多种SARS-CoV-2病毒变体

研究显示COVID-19感染包括多种SARS-CoV-2病毒变体凯斯西储大学(CWRU)的研究人员对360名COVID-19患者的病毒感染进行了基因排序。他们发现SARS-CoV-2病毒有广泛的遗传变异,表明所有的个体感染都包括病毒的多种变体。研究人员指出,有关该病毒的报告通常强调一个单一的优势毒株。这导致了对病毒遗传变异的报道不足,并可能在公共卫生计划和反应中产生严重后果。PC版:https://www.cnbeta.com/articles/soft/1315833.htm手机版:https://m.cnbeta.com/view/1315833.htm

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强大的新药可迫使COVID-19的SARS-CoV-2病毒自相残杀

强大的新药可迫使COVID-19的SARS-CoV-2病毒自相残杀高级作者、StepFamilyEndowedChair和ScrippsResearch教授StuartLipton博士说:"这种药物的奇妙之处在于,我们实际上是在让病毒对抗自己。我们用小分子弹头来武装它,最终阻止它感染我们的细胞;这是我们对病毒的报复。"斯克里普斯研究所的科学家们开发的一种药物可以防止SARS-CoV-2(蓝色)与ACE2受体(粉色)结合来感染人类细胞。这种药物附着在病毒上,然后在被药物包裹的病毒接近受体时向ACE2添加一个类似于硝化甘油的"硝基基团"。资料来源:斯克里普斯研究所Lipton和他的同事们长期以来一直在研究药物美金刚的变体,Lipton在20世纪90年代创造了美金刚并申请了专利,主要用于治疗阿尔茨海默氏症等神经系统疾病。虽然美金刚起源于20世纪60年代的一种抗流感药物,但临床医生在看到一位患有帕金森病的妇女在服用该药治疗流感时症状得到改善后,开始研究它用于其他疾病。Lipton说:"我的团队已经使这些抗病毒药物对大脑更好,当COVID-19出现时,我们想知道我们是否也在这个过程中使它们成为更好的抗病毒药物。"Lipton和他的同事们测试了一个化合物库,其整体结构与美金刚相当,但有额外的药理"弹头"。他们发现NMT5是一种具有两个关键特性的候选药物:它可以检测并附着在SARS-CoV-2表面的一个孔上,而且它可以使用硝化甘油的片段作为"弹头"对人类ACE2进行化学修饰。该团队意识到,这可以将病毒转化为其自身毁灭的载体。在这篇新论文中,Lipton的研究小组在分离的细胞和动物中对NMT5进行了表征和测试。他们展示了当病毒在体内移动时,NMT5如何紧紧地附着在SARS-CoV-2病毒颗粒上。然后,他们揭示了该药物如何在足够接近时将一种化学物质(类似于硝化甘油)添加到某些分子中的细节。当病毒靠近ACE2来感染一个细胞时,这就转化为NMT5向受体添加一个"硝基基团"。当ACE2以这种方式被修改时,它的结构会暂时发生变化--大约12小时--这样SARS-CoV-2病毒就不能再与它结合而导致感染。Lipton说:"真正美妙的是,这只是在病毒向它袭来时击倒了ACE2的局部可用性。它并没有阻碍ACE2在身体其他地方的所有功能,允许这种蛋白质的正常功能。"在测试SARS-CoV-2的Omicron变种能如何附着在人类ACE2受体上的细胞培养实验中,该药物阻止了95%的病毒结合。在患有COVID-19的仓鼠中,NMT5将病毒水平降低了100倍,消除了动物肺部的血管损伤,并改善了炎症。该药物还显示对COVID-19的近十种其他变体有效,包括α、β、γ和δ病毒株。大多数抗病毒药物通过直接阻断病毒的一部分发挥作用--这可能迫使病毒对药物产生抗药性。由于NMT5只是将病毒作为载体,研究人员认为这种药物可能对SARS-CoV-2的许多其他变体有效。高级职员科学家和新论文的第一作者Chang-kiOh说:"我们预计这种化合物将继续有效,即使新的变体出现,因为它不依赖于攻击病毒中通常变异的部分。"尽管他们只在动物模型中研究了这种化合物,但该团队现在正在制造一种药物版本,以评估其对人类的用途,同时在动物身上进行额外的安全性和有效性试验。共同作者ArnabChatterjee博士说:"这些令人振奋的发现提出了一条新的药物开发途径,需要药物组合来进行有效的大流行病准备。"了解更多:https://www.nature.com/articles/s41589-022-01149-6#citeas...PC版:https://www.cnbeta.com.tw/articles/soft/1331485.htm手机版:https://m.cnbeta.com.tw/view/1331485.htm

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研究:大多数人感染了COVID-19奥密克戎变体而不自知

研究:大多数人感染了COVID-19奥密克戎变体而不自知根据西达赛奈医疗中心调查人员的一项新研究,大多数可能感染了SARS-CoV-2的奥密克戎变体(导致COVID-19的病毒)的人不知道他们感染了这种病毒。该研究结果于2022年8月17日发表在《美国医学会杂志》网络版上。医学博士SusanCheng说:“每两个感染奥密克戎的人中就有一个以上不知道自己感染了它。”Susan是西达赛奈医疗中心Smidt心脏研究所心脏病科健康老龄化研究所的主任,也是该研究的通讯作者。“认识将是让我们超越这种大流行的关键。”以前的研究估计,至少25%,甚至可能多达80%的SARS-CoV-2感染者可能不会出现任何症状。与其他SARS-CoV-2变体相比,奥密克戎变体的症状一般不太严重,可能包括疲劳、头痛、咳嗽、喉咙痛或流鼻涕。“我们的研究结果增加了未诊断的感染可以增加病毒传播的证据,”西达赛奈医疗中心的调查员、该研究的第一作者SandyY.Joung说。“低水平的感染意识可能促成了奥密克戎的快速传播。”调查人员在两年多前开始收集医护人员的血液样本,作为研究COVID-19的影响和疫苗的影响的一部分。2021年秋天,就在奥密克戎变体感染病例激增开始之前,由于SapientBioanalytics公司提供的研究基础设施和生物样本处理支持,调查人员能够扩大招募范围,将患者纳入其中。在参与研究的医护人员和患者中,研究人员发现有2479人在奥密克戎感染病例开始之前或之后就提供了血样。根据他们血液中新出现的SARS-CoV-2抗体阳性水平,调查人员确定有210人可能感染了奥密克戎变体。接下来,调查人员邀请研究参与者通过访谈和调查提供最新的健康状况。在新的SARS-CoV-2抗体阳性的研究参与者中,只有44%的人知道自己感染了该病毒。大多数人(56%)不知道最近有任何COVID-19感染。在不知道的人中,只有10%报告说最近有一些症状,他们把这些症状归结为普通感冒或其他类型的感染。据研究者称,需要进行更多涉及不同种族和社区的人的研究,以了解哪些具体因素与缺乏感染意识有关。“我们希望人们在阅读这些研究结果后会想到,‘我刚刚参加了一个聚会,有人检测出阳性’;或者,‘我刚刚开始觉得天气有点不好。也许我应该去做个快速检测’。我们越是了解自己的风险,我们就越能保护公众和自己的健康,”西达赛奈医疗中心女性心血管健康和人口科学主席ErikaJ.Glazer说。Susan和她的同事还在研究再感染的模式和预测因素,以及他们对SARS-CoV-2提供长期免疫的潜力。除了提高认识之外,这些信息还可以帮助人们管理他们的个人风险。PC版:https://www.cnbeta.com/articles/soft/1306309.htm手机版:https://m.cnbeta.com/view/1306309.htm

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研究发现SARS-CoV-2在感染后可在肺部存留长达18个月之久

研究发现SARS-CoV-2在感染后可在肺部存留长达18个月之久一项突破性研究揭示,由于先天性免疫系统失效,SARS-CoV-2可在肺部潜伏数月之久,无法被发现,并可能导致Long-COVID。感染COVID一到两周后,SARS-CoV-2病毒一般就无法在上呼吸道中检测到了。但这是否意味着病毒已不存在于人体内呢?为了弄清这个问题,巴斯德研究所(InstitutPasteur)艾滋病专业小组与法国公共研究机构替代能源和原子能委员会(CEA)合作,对动物模型的肺细胞进行了研究。研究结果表明,SARS-CoV-2不仅在某些人的肺部存在长达18个月之久,而且其持续存在似乎与先天性免疫(抵御病原体的第一道防线)失效有关。这项研究发表在《自然-免疫学》(NatureImmunology)杂志上。在COVID-19中发现病毒储库有些病毒在引起感染后会以隐蔽和难以察觉的方式在体内存留。它们被称为"病毒库"。艾滋病病毒就是这种情况,它潜伏在某些免疫细胞中,随时可能重新激活。导致COVID-19的SARS-CoV-2病毒也可能是这种情况。至少,这是巴斯德研究所的一个科学家小组在2021年提出的假设,现在已在非人灵长类动物的临床前模型中得到证实。"我们观察到,在感染了SARS-CoV-2的灵长类动物身上,炎症会持续很长时间。因此,我们怀疑这可能是由于病毒在体内的存在,"巴斯德研究所艾滋病毒、炎症和持久性研究小组负责人米夏埃尔-穆勒-特鲁特温(MichaelaMüller-Trutwin)解释说。研究显示,SARS-CoV-2病毒通过桥状细胞突起从一个巨噬细胞传播到另一个巨噬细胞,从而实现传播。细胞核以粉红色标出,病毒蛋白NSP3以绿色标出。图片来源:©MarieLazzerini,NicolasHuot,InstitutPasteur研究结果为了研究SARS-CoV-2病毒的持久性,巴斯德研究所的科学家们与CEA的IDMIT(用于创新疗法的传染病模型)中心合作,对感染了该病毒的动物模型的生物样本进行了分析。研究的初步结果表明,尽管在上呼吸道或血液中检测不到病毒,但在感染6至18个月后,一些人的肺部发现了病毒。另一项发现是,Omicron菌株在肺部持续存在的病毒数量低于SARS-CoV-2原始菌株。这项研究的第一作者、巴斯德研究所艾滋病毒、炎症和持久性研究组的研究员尼古拉斯-胡特(NicolasHuot)指出:"我们非常惊讶地发现,在经过如此长的时间之后,在某些免疫细胞--肺泡巨噬细胞--中发现了病毒,而常规的PCR检测结果是阴性的。更重要的是,我们培养了这些病毒,并利用我们开发的研究艾滋病毒的工具观察到它们仍然能够复制。"为了了解先天性免疫在控制这些病毒库中的作用,科学家们随后将注意力转向了NK(自然杀伤)细胞。MichaelaMüller-Trutwin说:"先天性免疫的细胞反应是人体的第一道防线,但直到现在对SARS-CoV-2感染的研究还很少。然而,人们早就知道NK细胞在控制病毒感染方面发挥着重要作用。这项研究表明,在一些动物体内,感染了SARS-CoV-2的巨噬细胞对NK细胞的破坏具有抵抗力,而在另一些动物体内,NK细胞能够适应感染(被称为适应性NK细胞)并破坏抵抗性细胞,在这种情况下就是巨噬细胞。"因此,这项研究揭示了一种可能解释"病毒库"存在的机制:长期感染病毒或感染很少病毒的人体内会产生适应性NK细胞,而感染较多病毒的人体内不仅没有适应性NK细胞,而且NK细胞的活性也会降低。因此,先天免疫似乎在控制持续性SARS-CoV-2病毒方面发挥了作用。"我们将开始对大流行开始时感染SARS-CoV-2的人群进行研究,以确定所发现的病毒库和机制是否与长期COVID病例有关。MichaelaMüller-Trutwin说:"但这里的结果已经代表了在了解病毒库的性质和调节病毒持续存在的机制方面迈出的重要一步。"参考文献"SARS-CoV-2病毒在肺泡巨噬细胞中的持续存在受IFN-γ和NK细胞的控制",作者:NicolasHuot、CyrilPlanchais、PierreRosenbaum、VanessaContreras、BeatriceJacquelin、CarolinePetitdemange、MarieLazzerini、EmmaBeaumont、AurelioOrta-Resendiz、FélixA.Rey、R.KeithRey、FélixA.Rosenbaum。Rey、R.KeithReeves、RogerLeGrand、HugoMouquet和MichaelaMüller-Trutwin,2023年11月2日,《自然-免疫学》。DOI:10.1038/s41590-023-01661-4编译来源:ScitechDaily...PC版:https://www.cnbeta.com.tw/articles/soft/1403855.htm手机版:https://m.cnbeta.com.tw/view/1403855.htm

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科学家发现能阻止包括COVID-19在内的多种冠状病毒的人类抗体

科学家发现能阻止包括COVID-19在内的多种冠状病毒的人类抗体公共bnAbs的详细结构图以及它们与SARS-CoV-2(绿色螺旋线)和MERS-CoV(橙色螺旋线)结合的位置。这些bnAbs识别病毒穗状蛋白的S2区域,该区域相对保守,可能有助于带来开发广泛的冠状病毒疫苗和相关的抗体疗法。资料来源:斯克里普斯研究所2023年2月15日,《免疫》杂志报道了科学家们对抗体及其病毒结合点的详细研究,这可能会导致开发一种广泛的冠状病毒疫苗和相关的抗体疗法。两者都可以用来对付未来的冠状病毒大流行,以及SARS-CoV-2的任何未来变种。"有个别的人类单克隆抗体可以找到,可以防止最近所有三种致命的冠状病毒。SARS-CoV-1、SARS-CoV-2和MERS-CoV,"该研究的共同第一作者、斯克里普斯研究所免疫学和微生物学系的研究所调查员RaieesAndrabi博士说。斯克里普斯研究所的其他共同高级作者是免疫学和微生物学系教授兼James和JessieMinor主席DennisBurton博士,以及结构生物学汉森教授兼综合结构和计算生物学系主任IanWilson博士。来自UNC的共同高级作者是RalphBaric教授,博士,和LisaGralinski助理教授,博士。SARS-CoV-2与SARS-CoV-1(2002-04年SARS爆发的原因)和MERS-CoV(致命的中东呼吸综合征的原因)一起,属于被称为betacoronaviruses的冠状病毒的一个大组。这些病毒的变异率不高,给针对它们的疫苗和抗体疗法的开发带来了重大挑战。因此,在SARS-CoV-2的案例中,尽管现有的疫苗对限制该大流行病的疾病和死亡人数非常有帮助,但新的SARS-CoV-2变种已经出现,甚至可以在疫苗接种者中传播。然而,在过去的两年里,Andrabi/Burton和Wilson实验室一直在寻找证据,证明SARS-CoV-2和其他betacoronaviruses有一个不怎么变异的脆弱部位。这个位点位于病毒尖峰蛋白的S2区(或基点),在感染各种动物物种的betacoronaviruses上是相对保守的。相比之下,目前的SARS-CoV-2疫苗主要针对病毒尖峰蛋白相对易变的S1区,病毒通过该区与宿主细胞受体结合。S2位点在betacoronaviruses如何从受体结合进展到膜融合,使其进入呼吸道的宿主细胞中起着关键作用。在去年报告的一项研究中,Andrabi/Burton和Wilson实验室发现,一些人类抗体可以与SARS-CoV-2上的这个位点结合,其方式显然会破坏病毒融合并阻止感染。这种脆弱位点的存在提出了针对它的可能性,以提供针对betacoronaviruses的长效和广泛的保护。因此,在新的研究中,研究人员在人类志愿者的血液样本中对抗S2抗体进行了更全面的搜索。这些志愿者是已经从COVID-19病毒中恢复过来的人,他们已经接种过疫苗,或者已经从COVID-19病毒中恢复过来,然后又接种过疫苗。令研究人员惊讶的是,他们发现在后一组中的绝大多数志愿者--从COVID-19病毒中康复后又接种了疫苗的人--都存在易感的S2部位的抗体,但在其他人中出现的频率则低得多。总的来说,研究人员确定并描述了这些S2靶向抗体中的32种。在UNC的实验室病毒中和研究和小鼠病毒挑战研究中,研究人员发现这些抗体中的几个提供了前所未有的保护--不仅针对SARS-CoV-2,而且还针对SARS-CoV-1和MERS-CoV的betacoronaviruses。原则上,能够诱导这种抗体的疫苗接种策略有可能提供针对各种betacoronaviruses的广泛保护。对几种与S2结合的抗体进行的结构研究阐明了它们共同的结合部位和结合方式,提供了关键信息,有助于未来针对这一区域的疫苗开发。有针对性的合理疫苗策略可以利用这些抗体与S2结构域相互作用的分子信息,为泛巴氏病毒疫苗的设计提供信息。事实上,研究人员已经将他们的发现用于初步设计和测试一种潜在的"泛北卡罗来纳病毒"候选疫苗,如果成功的话,可以储存起来以限制未来的大流行病。研究人员还设想了一种不同的S2靶向抗体的治疗组合,也许是与其他尖峰区域的抗体一起使用,可以用来预防新型betacoronavirus的感染或减少已感染者的疾病。...PC版:https://www.cnbeta.com.tw/articles/soft/1350397.htm手机版:https://m.cnbeta.com.tw/view/1350397.htm

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SARS-CoV-2病毒破坏了肠道细菌的正常组合 增加诱发其他感染风险

SARS-CoV-2病毒破坏了肠道细菌的正常组合增加诱发其他感染风险根据今天(11月1日)将在《自然-通讯》杂志上发表的一份新报告,感染SARS-CoV-2,即引发COVID-19大流行的病毒已被证明可以减少一个人的肠道中的细菌种类数量。这种减少的微生物组多样性为危险的微生物创造了蓬勃发展的空间。PC版:https://www.cnbeta.com.tw/articles/soft/1331509.htm手机版:https://m.cnbeta.com.tw/view/1331509.htm

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研究人员发现引发COVID-19的冠状病毒的关键"弱点"

研究人员发现引发COVID-19的冠状病毒的关键"弱点"英属哥伦比亚大学的研究人员发现了SARS-CoV-2病毒的所有主要变体的一个关键漏洞,包括新发现的BA.1和BA.2Omicron亚变体。中和抗体可以针对这一弱点,有可能为对各种变体普遍有效的治疗打开大门。冷冻电子显微镜显示了VHAb6抗体片段(红色)如何附着在SARS-CoV-2尖峰蛋白(灰色)的脆弱部位,以阻止病毒与人类ACE2细胞受体(蓝色)结合。这项研究发表在《自然-通讯》杂志上,它使用低温电子显微镜(cryo-EM)来确定病毒尖峰蛋白上的脆弱区域或表位的原子结构。该研究还报告了一个VHAb6抗体片段,它能与该位置结合并中和每一个主要变体。UBC大学医学院教授、该研究的资深作者SriramSubramaniam博士说:"这是一种高度适应性的病毒,已经进化到可以逃避大多数现有的抗体治疗,以及疫苗和自然感染赋予的大部分免疫力。这项研究揭示了一个弱点,这个弱点在不同的变体中基本没有变化,可以被一个抗体片段中和。它为设计有可能帮助许多脆弱人群的泛变种治疗方法创造了条件。"识别COVID-19的万能钥匙我们的身体自然地制造抗体来对抗感染,但它们也可能在实验室中被制造出来,并作为一种治疗方法给病人使用。尽管已经为COVID-19创造了一些抗体治疗方法,但面对像Omicron这样高度变异的变体,它们的疗效已经下降。"抗体以一种非常具体的方式附着在病毒上,就像一把钥匙进入一把锁。但当病毒发生变异时,钥匙就不再适用了,"Subramaniam博士说。"我们一直在寻找万能钥匙--即使在广泛的变异后仍能继续中和病毒的抗体。这篇新论文将抗体片段VHAb6确定为"万能钥匙",已经发现它对Alpha、Beta、Gamma、Delta、Kappa、Epsilon和Omicron变种有效。通过与尖峰蛋白上的表位结合并阻止SARS-CoV-2感染人体细胞,该片段可中和病毒。这一发现是苏布拉马尼亚姆博士的团队与匹兹堡大学MitkoDimitrov和WeiLi博士领导的同事之间长期而富有成效的合作的最新成果。匹兹堡的团队一直在筛选大型抗体库并测试它们对COVID-19的有效性,而UBC的团队一直在使用低温电镜研究尖峰蛋白的分子结构和特征。专注于COVID-19的薄弱点UBC团队因其在使用低温电镜以原子分辨率观察蛋白质-蛋白质和蛋白质-抗体相互作用的专业知识而闻名于世。在今年早些时候发表在《科学》上的另一篇论文中,他们首次报告了Omicron尖峰蛋白和人类细胞受体ACE2之间的接触区结构,为Omicron增强的病毒适应性提供了分子解释。通过绘制每个尖峰蛋白的分子结构图,该团队一直在寻找可能为新疗法提供信息的脆弱区域。苏布拉马尼亚姆博士说:"我们在这篇论文中描述的表位大多远离突变的热点,这就是为什么它的能力在不同的变体中得以保留。现在我们已经详细描述了这个部位的结构,它开启了一个全新的治疗可能性领域。"Subramaniam博士说,这个关键的弱点现在可以被制药商利用,而且由于该部位相对无突变,所产生的治疗方法可以对现有的,甚至是未来的变种有效。PC版:https://www.cnbeta.com/articles/soft/1311789.htm手机版:https://m.cnbeta.com/view/1311789.htm

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