荷兰癌症研究所编制出存在于癌症转移灶中细菌的详细目录

荷兰癌症研究所编制出存在于癌症转移灶中细菌的详细目录 例如，某些细菌与免疫疗法的不良反应有关。这项研究为更好地了解细菌如何帮助或阻碍癌症（治疗），以及我们如何利用这一点为患者谋福利指明了方向。研究人员今天在科学杂志《细胞》上发表了他们的研究成果。在我们的身体上和体内生活着数十亿种微生物：细菌、病毒和酵母菌我们的微生物群。我们需要它们，它们也需要我们。例如，细菌帮助我们消化食物，与我们的免疫系统合作对抗病原体。肠道细菌尤其受到广泛研究，包括癌症方面的研究。例如，它们可以影响免疫疗法和化疗的效果。但是，这些微小的同居者也会在肠道外栖息。例如，肿瘤中就有细菌。借助新技术，研究人员正在更好地找出它们是哪些微生物。但是，细菌如何进入肿瘤以及它们在肿瘤中究竟做了什么，这些问题在很大程度上仍是未知数，因此还不清楚它们对疾病和治疗效果有多重要。26 种癌症类型由于许多病人最终死于转移瘤，而且许多治疗方法都针对转移瘤，因此埃米尔-沃伊斯特和洛德维克-韦塞尔斯的研究小组对这些转移瘤进行了更深入的研究。毕竟，人们对这些肿瘤中的细菌知之甚少。他们与荷兰癌症研究所（Netherlands Cancer Institute）和Oncode研究所（Oncode Institute）等机构的同事一起绘制了癌症转移灶中细菌的分布图。研究人员从 26 种癌症的 4000 多个转移灶组织中分析了DNA的密码。从这些遗传物质中，您不仅可以看到哪些人体细胞，还可以看到哪些细菌因为这些细菌也有 DNA。为此，他们使用了哈特维格医学基金会生成的临床信息和 DNA 数据。数据分析和结果有了这些庞大得难以想象的信息（400 TB），他们利用计算机的能力找出了哪些细菌聚集在哪些地方（见图）。这需要大量巧妙的编程，因为在这样一块组织中，细菌的 DNA 相对较少。研究人员托马斯-巴塔利亚（Thomas Battaglia）说："令人惊讶的是，不仅仅是结肠癌转移灶含有大量细菌。人们可能会想到，因为我们的大多数细菌都居住在结肠中，它们有可能在转移过程中从结肠转移到身体的其他部位。另外，转移灶中存在哪些细菌与身体的位置、那里的条件和癌症类型密切相关。"细菌和治疗效果他们还发现了细菌与疗效之间的联系。例如，转移灶中含有镰刀菌属的肺癌患者对免疫疗法的反应比没有这种细菌的患者差。托马斯："我们还注意到，细菌群落越多样化，邻近的肿瘤细胞就越活跃"。"我们的工作为探索新的治疗方式打开了大门，例如针对可能有助于肿瘤的细菌的治疗，"合著者 Iris Mimpen 说。"它帮助我们了解肿瘤的复杂环境是如何运作的，在这个环境中，各种细胞包括细菌生活在一起并相互影响"。编译自:ScitechDaily ... PC版： 手机版：

基因变异与食用肉类增加患肠癌风险有关

基因变异与食用肉类增加患肠癌风险有关 结直肠癌，也称为肠癌，是全球第三大常见癌症，也是全球癌症相关死亡的第二大原因。 年轻人的发病率也在上升，美国癌症协会 (ACS) 报告称，2019 年 20% 的诊断患者年龄在 55 岁以下，这一比例约为 1995 年的两倍。尽管红肉和加工肉类消费与结直肠癌之间的联系早已为人所知，但其主要的生物学机制尚未确定。 在一项新的研究中，南加州大学 (USC) 凯克医学院的研究人员发现了两种基因，它们可以根据红肉和加工肉类的摄入量来改变癌症风险水平。该研究的主要作者兼通讯作者玛丽安娜·斯特恩 (Mariana Stern) 表示：“这些研究结果表明，有一部分人群如果食用红肉或加工肉类，则面临更高的结直肠癌风险。它还使我们能够了解该风险背后的潜在机制，然后我们可以进行实验研究。”研究人员对来自 27 项研究的 29842 例结直肠癌病例和 39635 名欧洲血统对照样本进行了荟萃分析。 他们首先利用研究数据制定了红肉（牛肉、猪肉、羊肉）和加工肉类（培根、香肠、午餐/熟食肉、热狗）消费的标准衡量标准。 对于每个类别，他们计算了每天的份量，根据体重指数（BMI）进行调整，并根据红肉或加工肉类的摄入量将参与者分为四组。 食用红肉和加工肉类最多的人，患结直肠癌的风险分别增加 30% 和 40%。 这些发现没有考虑到遗传变异性，这可能会给某些人带来更高的风险。根据 DNA 样本，研究人员为每位研究参与者收集了跨越基因组的超过 700 万个基因变异的数据，即完整的遗传数据集。 为了分析红肉摄入量与癌症风险之间的联系，进行了全基因组基因-环境相互作用分析。单核苷酸多态性（SNP，发音为“snips”）是最常见的遗传变异类型。 每个 SNP 代表单个 DNA 构建块或核苷酸的差异：腺嘌呤 (A)、胸腺嘧啶 (T)、鸟嘌呤 (G) 和胞嘧啶 (C)。 例如，SNP 可能会在 DNA 的某个片段中用 T 替换 C。 最常见的是，SNP 存在于基因之间的 DNA 中。 它们可以作为生物标记，帮助定位与疾病相关的基因。研究人员检查了参与者的单核苷酸多态性（SNP），以确定特定基因变异是否会改变吃更多红肉的人患结直肠癌的风险。 红肉与癌症之间的关联仅在所检查的两个 SNP 上发生了变化：位于 HAS2 基因附近的 8 号染色体上的一个 SNP，以及位于 SMAD7 基因一部分的 18 号染色体上的一个 SNP。HAS2 基因是编码细胞内蛋白质修饰途径的一部分。 之前的研究已将其与结直肠癌联系起来，但从未与红肉消费联系起来。 研究人员的分析表明，66% 的人口中携带这种基因的常见变异的人，如果食用最高水平的肉类，患结直肠癌的风险会增加 38%。 相比之下，那些具有相同基因的罕见变异的人在吃更多红肉时并没有增加患癌症的风险。SMAD7 调节铁调素，一种与铁代谢相关的蛋白质。 食物含有两种铁：血红素铁和非血红素铁。 人体最容易吸收血红素铁，其中高达 30% 从食物中吸收。 由于红肉和加工肉类含有高含量的血红素铁，研究人员推测不同的 SMAD7 变体可能通过改变身体处理铁的方式来增加癌症风险。“当铁调素失调时，可能会导致铁吸收增加，甚至细胞内铁过载，”斯特恩说。约 74% 的人口中存在最常见 SMAD7 基因变异的两个拷贝，如果食用大量红肉，则患结直肠癌的风险会增加 18%。 那些只有一个最常见变异拷贝或两个不太常见变异拷贝的人患癌症的风险要高得多：分别为 35% 和 46%。研究合著者乔尔·桑切斯·门德斯 (Joel Sanchez Mendez) 表示：“这些发现表明，不同的基因变异可能会导致食用红肉的个体患结直肠癌的风险不同，并强调了这种疾病如何发展的可能解释。”研究人员强调，该研究的结果并不能证明这些基因变异与红肉和加工肉类消费之间存在因果关系。“这给了我们一些重要的思考空间，”斯特恩说。 “当我们知道环境暴露与疾病之间存在明显关联时，我们就会进行这些基因与环境相互作用的研究，但两者之间发生的事情仍然是一个黑匣子。”研究人员希望跟进实验研究，以加强铁代谢失调在结直肠癌发展中作用的证据。该研究发表在《癌症流行病学、生物标志物与预防》杂志上。 ... PC版： 手机版：

衞生署资助逾42万人进行大肠癌筛查　约16%呈阳性

衞生署资助逾42万人进行大肠癌筛查　约16%呈阳性 衞生署数据显示，截至去年12月底，已资助超过42万名市民接受大肠癌筛查，在交回的大便样本中，有63900人、相当于16.3%的检查结果呈阳性，要转介照大肠镜，当中2900人确诊大肠癌；另外有33000人有大肠瘜肉，切除后可以减低患癌机会。署方说，透过筛查确诊大肠癌的患者有近6成属于早期，有助提高治疗成果；相比下，并非参与筛查计划而确诊的患者，只有4成属早期。署方指，早期的大肠癌患者存活率可达95%。衞生署表示，2021年本港共有38400多宗癌症新个案，当中大肠癌占5800多宗，位列第二位。2022年有14700多人因为癌症死亡，当中2270人死于大肠癌，同样位列第二位。大肠癌筛查计划在2020年全面推行，合资格人士包括50至75岁、没有大肠癌征状，每两年到参与计划的私营医生接受大便免疫化学测试，如结果呈阳性，会安排照大肠镜检查。目前合共有超过1200名医生参与有关计划。 2024-03-21 11:18:30 (1)

过敏研究颠覆“卫生假说”：肮脏环境没有让抗体反应发生改变

过敏研究颠覆“卫生假说”：肮脏环境没有让抗体反应发生改变 微生物如何预防过敏一直是近来备受关注的话题。研究表明，某些感染可能会减少针对过敏原的炎症抗体的产生，并改变参与过敏的 T 细胞的行为。还有人认为，我们肠道中的有益细菌可能能够关闭身体其他部位的炎症。现在，研究人员将"肮脏的"野生小鼠的过敏性免疫反应与典型的清洁实验室小鼠的过敏性免疫反应进行了比较。他们发现，几乎没有证据表明抗体反应发生了改变，或者T细胞的功能发生了有意义的变化。良好肠道细菌诱发的抗炎反应似乎也无法关闭过敏性免疫反应。相反，野生小鼠在接触过敏原时会出现强烈的病理性炎症迹象和过敏反应。"这有点出乎我们的意料，但也表明，这并不像'肮脏的生活方式会阻止过敏，而清洁的生活方式可能会引发过敏'这么简单。"这项研究的共同作者、瑞典卡罗林斯卡医学院微生物学、肿瘤和细胞生物学系副教授乔纳森-科凯特（Jonathan Coquet）说："可能在一些非常特殊的情况下，这种说法是正确的，但这也许不是普遍规律。"野生小鼠在基因上与清洁的实验室小鼠完全相同，但在半自然条件下饲养，从出生起就暴露在丰富的微生物环境中。乔纳森-科凯特说："野生小鼠的免疫系统更能代表人类的免疫系统，因此我们希望它们能让我们更接近微生物如何作用于人体的真相。"这些发现有助于我们全面了解过敏是如何产生的，并可能具有临床意义。在临床试验中，研究人员和临床医生最近尝试用实验性感染来治疗炎症性疾病患者。例如，有人提出用蠕虫感染人或进行粪便移植，以此来防治炎症性疾病。通过剖腹产分娩的新生儿接受了母体粪便移植和细菌补充，目的是促进婴儿肠道中的好细菌，并促进婴儿未来的健康。"这一研究领域可以为了解如何利用感染和微生物促进健康提供重要见解，但目前仍处于起步阶段。"这项研究的共同作者、卡罗林斯卡医学院微生物学、肿瘤和细胞生物学系副教授苏珊娜-尼伦（Susanne Nylén）说："我们的研究提醒人们，普遍、广泛地接触微生物可能不会产生我们所希望的明显有益效果。"编译自/scitechdaily ... PC版： 手机版：

实验室培育的模型肿瘤可预测特定药物的治疗效果

实验室培育的模型肿瘤可预测特定药物的治疗效果 由人类肠癌细胞形成的类器官三维结构。蓝色表示单个细胞的细胞核，绿色表示将每个细胞粘在一起的蛋白质，红色表示癌细胞的方向  。研究人员在实验室中培育肿瘤，以便在肠癌患者开始治疗前准确预测哪些药物对他们有效。WEHI领导的这项世界首创研究发现，在肿瘤器官组织（由患者自身组织培养而成的三维癌症模型）上进行药物测试，可以显示它们对特定癌症治疗的反应。目前正在根据研究结果开展一项临床试验，该试验将首次验证类器官药物测试是指导肠癌患者选择治疗方法的准确方法，肠癌是澳大利亚致死率第二高的癌症。WEHI领导的研究证明，类器官药物测试可以预测晚期肠癌患者对治疗的反应，准确率高达90%。这项研究是世界上首次使用源自患者的肿瘤器官组织来预先测试现有治疗方案的有效性，并为肠癌患者确定潜在的新疗法。根据这项研究成果开展的临床试验将于今年启动，以评估类器官药物测试能否彻底改变癌症患者的治疗方式。肠癌，又称结肠直肠癌，仍然是全球癌症相关死亡的第二大原因。在澳大利亚，肠癌也是第四大确诊癌症。虽然肠癌如果发现得早可以得到成功治疗，但由于缺乏症状，只有不到一半的患者在初期阶段得到诊断。这意味着患者往往在癌症扩散到身体其他部位后才被诊断出来。尽管治疗肠癌的方法越来越多，但目前预测哪种疗法对每位患者最有效的能力却很有限。肿瘤类器官是一种微型三维癌症模型，尺寸只有沙粒大小。肿瘤器官组织是在实验室中根据患者自身的组织样本培育而成的，它能模拟癌症的特征，包括对药物治疗的敏感性。在发表于《细胞报告医学》（Cell Reports Medicine）的一项具有里程碑意义的研究中，WEHI 的研究人员表明，通过评估肠癌患者的器官组织对特定药物的反应，该技术可以确定对个别肠癌患者最有效的治疗方法。共同首席研究员、肿瘤内科医生彼得-吉布斯教授说，这一发现可以结束目前为患者选择癌症治疗方法的试验和错误过程，并改善他们的生活质量。"吉布斯教授同时也是 WEHI 实验室的负责人，他说："每次给病人提供无效的治疗，都会让病人损失 2-3 个月的时间。成功治疗的窗口往往是有限的，因此我们必须选择成功几率最高的方案，避免其他不太可能奏效的治疗方法。我们的研究结果表明，类器官药物测试有可能改变癌症治疗的游戏规则，通过改进治疗选择，有可能彻底改变个性化医疗和临床医生与患者之间的护理"。由于可以从一个患者组织样本中培育出数百个器官组织，因此可以在实验室中测试各种不同的治疗方案。"许多晚期肠癌患者只有一到两次治疗机会。在开始治疗前了解什么方法最有可能奏效，将对他们的生存结果和生活质量产生重大影响，"吉布斯教授说。左起：彼得-吉布斯教授、奥利弗-西伯副教授和谭涛博士。作为研究的一部分，30 名肠癌晚期患者的器官组织被用于在临床可行性试验中对化疗药物进行预试验。该研究的通讯作者、WEHI 实验室主任奥利弗-希伯（Oliver Sieber）副教授说，看到这项研究取得令人鼓舞的成果，对团队来说是一个突破性的时刻，验证了团队五年多来的研究成果。"西伯副教授说："如果一种药物对肿瘤类器官没有作用，那么这种治疗对病人也没有作用，反之亦然。我们的研究表明，类器官药物检测能够预测研究患者的治疗反应，准确率高达 83%。重要的是，预先测试显示出无效疗法的准确率超过 90%"。研究人员还利用有机体来测试不常用于肠癌患者的化疗药物的有效性。他们发现两名患者的器官组织对一种常用于治疗乳腺癌和膀胱癌的药物很敏感。"我们不仅首次证明了类器官药物试验可以预测患者对肠癌治疗的反应，而且还在试验中为患者找到了新的治疗方案。这就是这项令人难以置信的技术的力量"。一名研究人员手持装有实验室培育的器官组织的托盘，器官组织只有沙粒大小。合作试验这项研究的第一作者陶坦（Tao Tan）博士正在将研究成果转化为临床试验，今年将在维多利亚州的多家医院展开。这项研究将由澳大利亚癌症协会和斯塔福德-福克斯医学研究基金会（Stafford Fox Medical Research Foundation）资助，研究人员希望招募最近被诊断出患有肠癌的患者，以评估他们的肿瘤器官组织能否准确预测个人对治疗的反应。这项题为"基于患者衍生肿瘤类器官的转移性结直肠癌标准疗法预测性测试统一框架"的研究发表在《细胞报告医学》（Cell Reports Medicine）上。这项研究得到了澳大利亚胃肠道试验小组（AGITG）、斯塔福德-福克斯医学研究基金会、澳大利亚癌症协会、北京基因组研究所、维多利亚州癌症理事会维多利亚州癌症生物库和维多利亚州政府的支持。 ... PC版： 手机版：

新型试验小鼠拥有100%功能性人类免疫系统和近似人类肠道微生物群

新型试验小鼠拥有100%功能性人类免疫系统和近似人类肠道微生物群 德克萨斯大学圣安东尼奥健康科学中心的研究人员成功地改造出了一种具有与人类相同免疫反应的小鼠，而这正是之前许多研究人员失败的地方。虽然小鼠在研究中很常见，而且被认为是最好的工作动物之一，但它们远非完美的人类替代品。一个主要的挑战是小鼠体内的许多基因与人类基因不同，因此它们的免疫系统与我们的免疫系统反应截然不同。这种新型小鼠被称为 TruHuX或 THX，它将使研究障碍成为过去。这种小鼠拥有功能完备的人体免疫系统，最终会像我们任何人一样对治疗做出反应。领导这项开创性研究的医学博士保罗-卡萨利（Paolo Casali）说："THX 小鼠为人类免疫系统研究、人类疫苗开发和疗法测试提供了一个平台。"那么，这对医学研究之外的所有人意味着什么呢？它有可能大大加快药物和免疫疗法的研发速度，缩短"试验和出错"的时间，让科学家们能够在对疗效和安全性更有信心的情况下将治疗方法用于人体试验。卡萨利还认为，THX 小鼠可以取代目前在非人灵长类动物身上进行的免疫学和微生物学测试。小鼠还为新的癌症免疫疗法、细菌和病毒疫苗开发以及疾病建模打开了大门。在未来的某个时刻，技术很可能会促进复杂的人工模型的创造，以取代动物进行医学测试，但遗憾的是，在此之前，它仍然是药物开发和疾病研究的重要组成部分。几十年来，科学家们一直在努力完善人源化小鼠。第一个模型是在 20 世纪 80 年代设计的，用于模拟人类艾滋病病毒感染和机体对艾滋病病毒的反应，现在仍然是研究的重要组成部分。迄今为止，科学家们通过向免疫缺陷小鼠注射人类外周淋巴细胞、未成熟造血干细胞或其他人类细胞来建立这种模型。但这些小鼠的寿命往往很短，会因"人性化"而出现一系列健康问题，而且与其他小鼠模型存在同样的问题，即它们的免疫系统会做出与人类截然不同的反应。卡萨利的团队还从免疫缺陷小鼠（NSG W41突变体）开始，通过动物左心室注射从脐带血中提纯的人类干细胞。经过数周时间让移植细胞沉淀后，再用17b-雌二醇（E2）雌激素对小鼠进行激素调节。研究小组之前的研究发现，这种强效雌激素能促进干细胞存活和淋巴细胞分化，并激活抗体以应对病毒和细菌。归根结底，THX 是一种"超人类"小鼠，拥有完整的人类免疫系统淋巴结、生殖中心、胸腺人类上皮细胞、人类 T 淋巴细胞和 B 淋巴细胞、记忆性 B 淋巴细胞和浆细胞而且可以做出与人类相同的反应。研究小组目前正在利用 THX 小鼠更好地了解人类对 SARS-CoV-2 的免疫反应，并研究参与人类浆细胞活性及其抗体反应的表观遗传因素，这有可能开启新的病毒和癌症疗法。这项研究发表在《自然-免疫学》杂志上。 ... PC版： 手机版：