挑战主流观点：4.5万年前的古代DNA揭示了隐藏的人类历史

挑战主流观点：4.5万年前的古代DNA揭示了隐藏的人类历史"人们普遍认为我们人类祖先的遗传学没有像其他动物那样因环境压力而发生变化，因为我们的沟通能力和制造及使用工具的能力增强了，"Souilmi博士说。然而，通过比较现代基因组和古代DNA，研究人员发现了50多个最初罕见的有益基因变体在古代人类群体的所有成员中变得普遍的案例。与许多其他物种相比，这种类型的适应性遗传变化的证据在人类中是不一致的。因此，这一发现挑战了关于人类适应性的主流观点，使我们对人类如何适应他们在地球上传播时遇到的新环境压力有了新的和令人兴奋的认识。共同牵头人、阿德莱德大学兼职研究员和澳大利亚国立大学DECRA研究员雷-托布勒博士说，检查古代DNA对于揭示人类进化的秘密至关重要。托布勒博士说："我们相信人类群体之间的历史性混合事件可能隐藏了现代人类基因组中的遗传变化迹象。我们检查了来自1000多个古代基因组的DNA，其中最古老的基因组大约有45000年的历史，以了解某些类型的遗传适应在我们的历史上是否比现代基因组的研究更常见。Huber教授说："使用古代基因组是至关重要的，因为它们在重大的历史混合事件之前，这些事件从根本上重塑了现代欧洲人的遗传血统。这使得我们能够恢复现代基因组的标准分析所看不到的历史性适应迹象。"研究论文的资深作者ChristianHuber教授是阿德莱德大学的兼职研究员和宾州州立大学的助理教授。...PC版：https://www.cnbeta.com.tw/articles/soft/1334779.htm手机版：https://m.cnbeta.com.tw/view/1334779.htm

1600亿碱基对 拥有最大基因组的生物所携带的DNA数量是人类的50倍

1600亿碱基对拥有最大基因组的生物所携带的DNA数量是人类的50倍每个活细胞中都蕴藏着构建该生物体的全部蓝图。因此，DNA是一种密度极高的数据存储介质，一克DNA就能存储2.15亿GB的数据。现在，拥有已知最大基因组的生命形式已经被确认--它并不是你想象的那样。一种名为"Tmesipterisoblanceolata"的不起眼的蕨类植物被发现拥有由1,604.5亿个碱基对（Gbp）组成的基因组。作为参考，人类基因组有3.1Gbp。另一种可视化的方法是想象DNA链解开的样子。我们的基因组会延伸出2米（6.6英尺），和勒布朗-詹姆斯差不多高。但是，T.oblanceolata的基因组将远远超过100米（328英尺）--比自由女神像或大本钟塔还要高。不起眼的叉蕨（Tmesipterisoblanceolata）看起来并不起眼，但它在吉尼斯世界纪录大全中却一骑绝尘波尔-费尔南德斯因此，这种不起眼的蕨类植物夺得了三项吉尼斯世界纪录头衔：最大的基因组、最大的植物基因组和最大的蕨类植物基因组。它从另一种植物--巴黎蕨（Parisjaponica）--手中夺走了桂冠。这才是真正的"TARDIS"（塔迪斯）风格，光看外表，你根本不知道这株蕨类植物的内部有多大。无论从哪个角度看，它都是一种非常不起眼的植物，长达30厘米（12英寸），看起来就像你在森林里散步时看都不会看一眼的东西。但此前曾发现该家族的其他成员也含有大型基因组，因此伦敦皇家植物园、邱园和西班牙巴塞罗那植物研究所（IBB-CSIC）的科学家们开始对忘忧草进行研究。他们来到西南太平洋的新喀里多尼亚岛，采集这种植物的样本。研究小组通过分离成千上万个细胞的细胞核，用一种能与细胞核中DNA结合的染料对其进行染色，从而对基因组进行了分析。通过测量有多少染料与细胞核中的DNA结合，可以估算出基因组的大小，从而揭示了新的世界纪录。该研究小组说，耐人寻味的是，基因组并不一定越大越好。基因组大的植物往往生长缓慢，需要更多养分，光合作用效率较低。因此，人们认为T.oblanceolata已经达到了基因组大小的上限。这项研究发表在《iScience》杂志上。...PC版：https://www.cnbeta.com.tw/articles/soft/1433391.htm手机版：https://m.cnbeta.com.tw/view/1433391.htm

研究人员首次绘制狗表观基因组图谱

研究人员首次绘制狗表观基因组图谱由于狗的生物钟加快，寿命较短，与人类相比，它们可以充当瞭望者，对环境风险因素做出更快的反应，并提醒我们潜在的危险。但是，尽管我们与人类最好的朋友有着长期的关系，但我们缺乏狗的参考表观基因组。考虑到我们有如此多的共同点——环境、饮食、生活方式和接触传染源——这可能会告诉我们这些因素如何在基因上影响他们和我们，这有点令人失望。现在，首尔国立大学的研究人员填补了这一知识空白，首次创建了狗表观基因组的高质量参考图谱，为基因组学研究以及与人类和其他物种的比较研究提供了一种手段。研究人员以比格犬这一品种为对象，仔细检查了狗的11种主要组织：大脑（大脑和小脑）、乳腺、肺、肝脏、胃、脾、胰腺、肾、结肠和卵巢。然后，他们使用收集的遗传数据创建功能基因组注释，用有关结构或功能的描述信息标记DNA、RNA或蛋白质序列中的特定特征。他们将狗的表观基因组与现有的人类和小鼠表观基因组进行了比较，通过被命名为EpiCDog（狗表观基因组目录）的工作，研究人员发现了不同组织和物种之间共享的保守且动态的功能特征。最值得注意的是，狗的表观基因组被发现比小鼠的表观基因组更类似于人类的表观基因组，这表明基因的调控方式与人类健康和疾病的影响有相似之处。该研究的通讯作者Je-YoelCho表示：“这一突破性的表观基因组图谱可广泛用于研究不同的狗品种、深入研究癌症和疾病机制、进行跨物种比较研究，并对人类生命科学的进步做出重大贡献。”有趣的是，根据本月早些时候发表的一项研究，自然发生的犬类癌症与人类癌症具有显着的相似之处。研究发现，我们共有18个基因突变“热点”，这些突变很可能是癌症的原因。当前研究中研究人员的工作可以帮助发现人类和狗之间的这种重叠。研究人员表示，EpiCDog当然会让治疗我们四足朋友的兽医受益匪浅。Cho说：“这项工作也代表了兽医学领域基础研究的一个里程碑。这一突破使研究人员能够揭示表观遗传修饰对基因表达的影响，并为研究复杂疾病的潜在机制、推进狗的兽医诊断、治疗和个性化医疗方法开辟新途径。”研究人员计划开发EpiCDog以进一步推进狗的表观基因组学。该研究发表在《科学进展》杂志上。...PC版：https://www.cnbeta.com.tw/articles/soft/1370203.htm手机版：https://m.cnbeta.com.tw/view/1370203.htm

揭示隐藏的基因组：可能对人类健康至关重要的未知DNA序列被发现

揭示隐藏的基因组：可能对人类健康至关重要的未知DNA序列被发现来自杜克-新加坡国立大学医学院的研究人员和他们的合作者在人类基因组中发现了数千个以前未知的DNA序列，这些序列为微蛋白和肽编码，可能对人类健康和疾病至关重要。PC版：https://www.cnbeta.com/articles/soft/1315911.htm手机版：https://m.cnbeta.com/view/1315911.htm

DNA的启示：已经被宣布灭绝的鱼很可能还活着

DNA的启示：已经被宣布灭绝的鱼很可能还活着伦敦自然历史博物馆收藏的"绝种"标本。图片来源：YmkeWinkel生活在北海河口并已正式灭绝的一种鱼类--尖吻白鲑（houting）原来还活得好好的。阿姆斯特丹大学和伦敦自然历史博物馆的研究人员从保存在博物馆的多条尖吻白鲑身上提取了DNA，这些鱼标本已历经250多年的历史。接下来，他们将这些博物馆鱼类的DNA与目前出现的各种同胞物种的DNA进行了比较。生物学家发现，尖吻白鲑和一种叫做欧洲白鱼的鱼类在基因上几乎没有区别。由于这种鱼仍然很常见，因此可以断定尖吻白鲑根本没有灭绝。在最近发表在《BMC生态学与进化》（BMCEcologyandEvolution）杂志上的一项研究中，科学家描述了他们是如何从这种鱼身上分离出线粒体DNA的。他们甚至成功地从1754年的一条干北海蕺鱼身上获得了一小段DNA，林奈曾用它来进行正式的物种描述。接下来，研究人员利用这些DNA创建了一棵系统发生树，在这棵树上，所有受检的两个物种都属于同一类。研究小组认为，尖吻白鲑不是一个独立的物种。第一作者、阿姆斯特丹大学的罗布-克罗斯（RobKroes）评论道："这种欧洲白鲑在西欧和北欧相当普遍，在淡水河流、湖泊、河口和海洋中都有分布。由于我们发现过去的尖吻白鲑和今天的欧洲白鲑之间没有物种差异，因此我们认为尖吻白鲑并未灭绝。那么，尖吻白鲑怎么可能在2008年被正式宣布灭绝呢？克罗斯解释说："人们经常会混淆动物是否是一个物种。尤其是鱼类。在一个物种内，它们的形态特征往往有很大的差异。在这种情况下，生物学家长期以来一直认为，由于吻部的长度和鳃耙的数量，尖吻白鲑与欧洲白鲑是不同的物种。但是，这些特征根本不适合断定它们是一个不同的物种，我们现在的DNA研究清楚地表明了这一点。"官方拉丁文物种名称的更改似乎已经迫在眉睫。不过，要对名称进行明确的调整，还需要对1754年的鱼干DNA进行一些额外的研究，据研究人员称，这将很难做到。克罗斯总结道："DNA已经很老了，而且已经损坏，但我认为我们应该尝试一下。目前，各种尖吻白鲑的保护状况混乱不堪。根据世界自然保护联盟（IUCN）的认定，北海尖吻白鲑已经灭绝；与此同时，欧洲的各种自然法规定，尖吻白鲑和欧洲白鲑都必须受到保护。因此，我们实际上是在保护一种已经灭绝的物种，而这种物种目前依然在游来游去"。...PC版：https://www.cnbeta.com.tw/articles/soft/1390277.htm手机版：https://m.cnbeta.com.tw/view/1390277.htm

我国科研人员在 DNA 转座子研究领域取得新突破

我国科研人员在DNA转座子研究领域取得新突破中国科学院动物研究所科研团队基于自然界丰富的动物遗传资源开展了迄今为止最大规模的DNA转座子活性筛选，从而获得了目前最大的活跃DNA转座子数据集，大幅扩展了现有基因工程工具箱。该成果6月5日在国际学术期刊《细胞》（CELL）在线发表。DNA转座子是存在于染色体DNA上可自主复制和位移的基本单位，是基因组中一段可移动的DNA序列，可以通过切割、重新整合等一系列过程从基因组的一个位置“跳跃”到另一个位置，对于生命科学研究具有非常重要的意义。（央视新闻）