T细胞仍可能是我们对抗最新冠状病毒"关注变种"BA.2.86的武器
T细胞仍可能是我们对抗最新冠状病毒"关注变种"BA.2.86的武器拉荷亚免疫学研究所科学家们利用生物信息学来预测T细胞如何适应对抗高度变异的Pirola变体。今年8月,研究人员在以色列和丹麦的病人身上检测到了一种新的SARS-CoV-2"令人担忧的变体"。从那时起,这种被称为BA.2.86或"Pirola"的变种就开始在全球传播。Pirola变体之所以引起人们的警惕,是因为它发生了高度变异。事实上,与最初接种的SARS-CoV-2变体相比,Pirola的变异程度不亚于Omicron变体。随着Pirola的扩散,拉荷亚免疫学研究所(LJI)的研究人员正在调查COVID-19疫苗(或以前接触过的SARS-CoV-2疫苗)是否仍能保护人们免受严重疾病的侵袭。LJI教授、生物科学博士AlessandroSette说:"人们担心,变异如此之多的病毒会'逃避'T细胞免疫。"现在,《细胞、宿主与微生物》(CellHost&Microbe)杂志上的一项新研究表明,T细胞可以看穿Pirola的突变,并锁定它们的目标。"我们的分析表明有一个积极的消息,"助理研究教授阿尔巴-格里福尼(AlbaGrifoni)博士说,"看来以前接触过奥米克隆或接种过新型二价疫苗的人可能会被T细胞武装起来,这些细胞可以'迎头赶上',产生对抗Pirola的特异性反应。"拉荷亚研究所教授、生物科学博士亚历山德罗-塞特(AlessandroSette)。图片来源:拉荷亚免疫学研究所在这项新研究中,塞特和格里福尼利用了一个名为免疫表位数据库(IEDB)的资源。该数据库收录了世界各地免疫学家收集的宝贵研究成果,描述了免疫细胞如何识别微生物上的片段或"表位"。借助IEDB中的大量数据,研究人员已经详细了解了COVID-19疫苗或以前接触过SARS-CoV-2的T细胞是如何"训练"T细胞靶向SARS-CoV-2表位的。研究人员提取了这些IEDB数据,并开发了一个生物信息学管道来预测这些T细胞将如何对Pirola变体做出反应。Grifoni说:"我们根据以前SARS-CoV-2变体的实验数据和预测数据模拟了T细胞对Pirola的反应。"研究人员发现,大多数T细胞仍能靶向Pirola上的表位:总体而言,CD4+"辅助"T细胞反应识别的片段有72%,CD8+"杀伤"T细胞表位有89%在变异株之间没有变化,或者说"保持不变"。研究人员在Pirola的"Spike"蛋白上发现的保守T细胞表位较少,这也在意料之中,因为它携带了大部分变异。在这种主要结构蛋白上,只有56%的CD4+"辅助"T细胞表位和CD8+"杀伤"T细胞表位是保守的。这是一个潜在的问题,因为目前的COVID-19疫苗在设计上只能让免疫细胞识别并锁定Spike表位。然而,当研究人员仔细观察斯派克片段时,他们发现96%的CD4+"辅助"T细胞表位和62%的CD8+"杀伤"T细胞表位非常相似,T细胞仍有可能识别它们。简而言之,如果Pirola想要躲避T细胞,它做得并不好。拉荷亚免疫学研究所研究助理阿尔巴-格里福尼(AlbaGrifoni)博士资料来源:拉荷亚免疫学研究所塞特说:"免疫系统识别的许多表位在新的Pirola变体上仍然保持不变。预测这种病毒仍将被T细胞识别。"格里福尼补充说:"T细胞也可能'追随'Pirola新变异的多肽,针对这些表位发起新的反应,就像我们在其他变异体上看到的那样。我们认为,尽管病毒在进化,但在Pirola病毒感染或其他最新变种的病例中,我们并没有看到更严重的疾病,这可能就是原因之一。"格里福尼强调,这些发现只是预测,而不是基于实际Pirola感染的观察结果。尽管如此,她仍然认为,观察以及预测如何反映在最近的实际研究中非常重要。我们仍然需要实验验证,但我们已经在全球范围内建立了几个合作机构,它们正在研究这个问题。塞特补充说,许多人仍然很容易感染SARS-COV-2,即使是Pirola变种。这就是为什么人们仍然应该接种疫苗,尤其是最新疫苗的原因。研究人员目前正在收集实验数据,以进一步了解T细胞对变异体的反应,并进一步加强他们的预测工具以了解接种过二价疫苗和/或"突破性"感染的人究竟是如何对未来的变异株产生T细胞反应的。参考文献"亚利桑德罗-塞特(AlessandroSette)、约翰-西德尼(JohnSidney)和阿尔巴-格里福尼(AlbaGrifoni)于2023年12月8日发表的《细胞宿主与微生物》(CellHost&Microbe)杂志上发表的《预测已有的SARS-2特异性T细胞会交叉识别BA.2.86》。DOI:10.1016/j.chom.2023.11.010编译来源:ScitechDaily...PC版:https://www.cnbeta.com.tw/articles/soft/1403759.htm手机版:https://m.cnbeta.com.tw/view/1403759.htm
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