中科院团队成功解析叶绿体基因转录机器的结构 研究成果登上《细胞》封面

中科院团队成功解析叶绿体基因转录机器的结构研究成果登上《细胞》封面中国科学院分子植物科学卓越创新中心张余研究团队和华中农业大学周菲研究团队合作,成功解析了叶绿体基因转录机器的结构。3月1日,该成果以封面文章的形式在线发表在国际顶级学术期刊《细胞》上。张余研究团队和合作者,利用叶绿体转化技术,在烟草叶绿体基因转录机器上引入特征性的“捕获标签”,通过纯化烟草内源的叶绿体基因转录机器,利用单颗粒冷冻电镜技术,最终解开了PEP的真面目。此项研究为植物叶绿体生物反应器的效率提升提供了着手点,助力重组疫苗、重组蛋白药物、和天然产物的生产。此外,还为光合作用系统基因表达水平的提高提供了新思路,助力植物高效碳汇。...PC版:https://www.cnbeta.com.tw/articles/soft/1421959.htm手机版:https://m.cnbeta.com.tw/view/1421959.htm

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植物细胞中的叶绿体基因转录机器控制着叶绿体的发育过程,并在调控植物光合作用中发挥着关键作用。但是叶绿体基因转录机器构造一直是未解之谜。中国科学院分子植物科学卓越创新中心张余研究团队与合作者,通过多年研究,揭开了叶绿体基因转录机器构造。该成果于北京时间3月1日在国际学术期刊《细胞》发表。据了解,此项研究将有助于提高植物的光合作用效率和吸收二氧化碳的能力,未来有望在提升农作物产量等领域发挥重要作用。(央视新闻)

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六角萌宠登上《科学》封面广东专家用它找到脑再生“开关”通过模拟人类患病的环境、有毒害物质侵袭甚至饮食结构、行为模式,或直接用技术敲掉模式生物的单个基因,耐心观察。模式生物可以代替人类生病、试药、探索先进的医学理论。日前,广东省人民医院费继锋教授团队联合华大生命科学院研究院、武汉大学等多个科研团队,在国际顶级学术期刊《科学》(《Science》)上发表了题为:利用时空转录组技术解析蝾螈大脑再生的关键干细胞亚型的研究论文。PC版:https://www.cnbeta.com/articles/soft/1316511.htm手机版:https://m.cnbeta.com/view/1316511.htm

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MIT研究人员改进基因编辑技术可高效地将整个基因插入人体细胞使用这种新方法,他们将在基因组的原生位置插入一个健康的基因拷贝,而不必使用其他基因编辑方法进行较小的编辑,创建不同的基因疗法来纠正每一个突变。这种新方法结合使用了素编辑和新开发的重组酶,前者可以直接进行大约100或200个碱基对的大范围编辑,后者可以在基因组的特定位点高效插入数千个碱基对长度的大段DNA。这种名为eePASSIGE的系统进行基因大小编辑的效率是其他类似方法的数倍,相关报道发表在《自然-生物医学工程》(NatureBiomedicalEngineering)上。"据我们所知,这是哺乳动物细胞中可编程靶向基因整合的首个实例之一,符合潜在治疗相关性的主要标准,"该研究的资深作者、理查德-默金教授兼布罗德大学默金医疗保健变革技术研究所所长、哈佛大学教授、霍华德-休斯医学研究所研究员刘说。"如果我们在培养人体细胞中观察到的效率能够转化到临床环境中,我们预计在这些效率下,即使不是大多数功能缺失性遗传疾病,许多疾病也可以得到改善或挽救。"研究生斯姆里蒂-潘迪(SmritiPandey)和博士后研究员丹尼尔-高(DanielGao)都是这项研究的共同第一作者,他们还与明尼苏达大学马克-奥斯本(MarkOsborn)研究小组和贝斯以色列女执事医疗中心埃利奥特-柴科夫(ElliotChaikof)研究小组合作完成了这项研究。潘迪说:"这一系统为细胞疗法提供了大有可为的机会,它可用于将基因精确植入体外细胞,然后再给病人注射,以治疗疾病等。eePASSIGE的高效率和多功能性令人兴奋,它可以催生一类新的基因组药物。我们也希望它能成为整个研究界的科学家们用来研究基础生物学问题的工具。"许多科学家已经利用基因素材编辑技术有效地改变了DNA,这些改变的长度可达几十个碱基对,足以纠正绝大多数已知的致病突变。但是,在基因组的原生位置引入整个健康基因(通常长达数千个碱基对)一直是基因编辑领域的长期目标。这不仅有可能治疗许多患者,而不管他们的致病基因发生了哪种突变,而且还能保留周围的DNA序列,从而增加新安装的基因被适当调控的可能性,而不是表达过多、过少或在错误的时间表达。2021年,刘的实验室报告了向这一目标迈出的关键一步,他们开发出了一种名为twinPE的素体编辑方法,在基因组中安装重组酶"着陆点",然后利用Bxb1等天然重组酶催化新DNA插入素体编辑的目标位点。很快,刘与他人共同创办的生物技术公司PrimeMedicine就开始利用这项被称为PASSIGE(prime-editing-assistedsite-specificintegrasegeneediting)的技术来开发遗传疾病的治疗方法。PASSIGE只在一小部分细胞中进行编辑,这足以治疗某些遗传疾病,但可能无法治疗大多数因功能基因缺失而导致的遗传疾病。因此,在今天报告的新工作中,刘的团队着手提高PASSIGE的编辑效率。他们发现,重组酶Bxb1是限制PASSIGE效率的罪魁祸首。随后,他们利用研究小组之前开发的一种名为PACE(噬菌体辅助持续进化)的工具,在实验室中快速进化出了更高效的Bxb1版本。由此产生的新进化和工程化Bxb1变体(eeBxb1)改进了eePASSIGE方法,平均可整合小鼠和人类细胞中30%的基因大小的载荷,是原始技术的4倍,是最近发表的另一种名为PASTE的方法的16倍。刘说:"eePASSIGE系统为研究在遗传病细胞和动物模型中我们选择的位点整合健康基因拷贝以治疗功能缺失性疾病提供了一个很好的基础。我们希望这个系统将被证明是实现靶向基因整合为患者带来益处的重要一步。"有鉴于此,Liu的团队目前正致力于将eePASSIGE与工程病毒样颗粒(eVLPs)等递送系统结合起来,以克服传统上限制基因编辑器在体内进行治疗递送的障碍。编译来源:ScitechDaily...PC版:https://www.cnbeta.com.tw/articles/soft/1434711.htm手机版:https://m.cnbeta.com.tw/view/1434711.htm

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新的机器学习方法提高了我们对细胞角色的理解

新的机器学习方法提高了我们对细胞角色的理解细胞特性是指在生物体内将一种类型的细胞与另一种类型的细胞区分开来的独特特征和属性。这种特性是由特定基因的表达决定的,这些基因控制着蛋白质的生产,使细胞具有特定的功能和结构。由卡内基梅隆大学计算机科学学院计算生物学教授RayandStephanieLane领导的一个研究小组已经开发了一个机器学习工具来填补这一空白。他们关于该方法的论文被称为SPICEMIX,最近作为《自然-遗传学》的封面故事出现。SPICEMIX帮助研究人员理清不同的空间模式在像大脑这样的复杂组织中的细胞的整体基因表达中所扮演的角色。它通过用空间元基因代表每一种模式来做到这一点--这些基因组可能与一个特定的生物过程有关,并能在整个组织中显示平滑或零星的模式。该团队包括Ma、计算生物学系的项目科学家BenjaminChidester以及博士生TianmingZhou和ShahulAlam,他们使用SPICEMIX来分析来自小鼠和人类大脑区域的空间转录组学数据。他们利用SPICEMIX的独特功能,揭示了大脑细胞类型和空间模式的景观。"当我们选择这个名字时,我们受到了烹饪的启发,"Chidester说。"你可以用同一组调料做出各种不同的味道。细胞可能以类似的方式工作。它们可能使用一套共同的生物过程,但它们使用的特定组合使它们具有独特的身份。"当应用于脑组织时,SPICEMIX比其他方法更准确地确定了大脑中细胞类型的空间模式。它还通过学到的空间元基因发现了新的脑细胞类型的表达模式。使用空间转录组学技术的研究数量正在迅速增长,而SPICEMIX可以帮助研究人员充分利用这种高容量、高维度的数据。这些发现可能有助于我们对脑细胞类型的复杂性进行更全面的描绘。有可能推动空间转录组学研究,并有助于更深入地了解复杂组织的基本生物学和疾病进展。...PC版:https://www.cnbeta.com.tw/articles/soft/1349989.htm手机版:https://m.cnbeta.com.tw/view/1349989.htm

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